More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3824 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3824  aldo/keto reductase  100 
 
 		 339 aa  700    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  81.9 
 
 		 337 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0931  putative oxidoreductase (aldo/keto reductase)  80.54 
 
 		 336 aa  577  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3731  aldo/keto reductase  72.24 
 
 		 336 aa  508  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0880043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  70.09 
 
 		 337 aa  485  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0927  aldo/keto reductase  68.06 
 
 		 342 aa  456  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320709  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2297  aldo/keto reductase  63.75 
 
 		 339 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0919281  normal  0.745376 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7188  aldo/keto reductase  60.78 
 
 		 349 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5453  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  61.79 
 
 		 335 aa  431  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2915  aldo/keto reductase  61.31 
 
 		 337 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_003296  RS03071  putative oxidoreductase protein  64.67 
 
 		 334 aa  430  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5007  aldo/keto reductase  62.09 
 
 		 335 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5233  aldo/keto reductase  60.06 
 
 		 349 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5927  aldo/keto oxidoreductase  61.03 
 
 		 341 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5659  aldo/keto reductase  58.91 
 
 		 353 aa  419  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184034  normal  0.516333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3174  aldo/keto reductase  59.23 
 
 		 336 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4528  aldo/keto reductase  61.38 
 
 		 335 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.153462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5053  aldo/keto reductase  61.38 
 
 		 335 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2676  aldo/keto reductase  59.82 
 
 		 336 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2542  aldo/keto reductase  60.12 
 
 		 336 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2569  aldo/keto reductase  58.73 
 
 		 359 aa  413  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0520  aldo/keto reductase  60.78 
 
 		 335 aa  408  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00146659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3167  aldo/keto reductase  59.76 
 
 		 354 aa  410  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2514  aldo/keto reductase  59.76 
 
 		 333 aa  409  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0462  aldo/keto reductase  58.01 
 
 		 333 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3469  aldo/keto reductase  56.8 
 
 		 342 aa  393  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1565  aldo/keto reductase  58.31 
 
 		 332 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.876817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  42.9 
 
 		 333 aa  251  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  43.07 
 
 		 343 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  41.96 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  42.33 
 
 		 325 aa  246  6e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  43.77 
 
 		 315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  41.99 
 
 		 340 aa  242  7e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  43.85 
 
 		 315 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  45.14 
 
 		 329 aa  239  4e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  45.02 
 
 		 343 aa  239  5e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  42.68 
 
 		 322 aa  239  5e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  41.54 
 
 		 352 aa  237  3e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  41.75 
 
 		 317 aa  235  9e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  41.94 
 
 		 343 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2439  putative aldo/keto reductase  42.09 
 
 		 341 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  decreased coverage  0.000840189 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  39.83 
 
 		 343 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  40.38 
 
 		 343 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  41.23 
 
 		 345 aa  229  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  40.94 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  43.81 
 
 		 341 aa  227  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1049  aldo/keto reductase  38.98 
 
 		 323 aa  226  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  39.94 
 
 		 351 aa  226  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  40.12 
 
 		 331 aa  226  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  39.82 
 
 		 349 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  40 
 
 		 343 aa  225  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  38.91 
 
 		 358 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  41.03 
 
 		 341 aa  224  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  40.88 
 
 		 334 aa  223  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  40.49 
 
 		 349 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  40.06 
 
 		 325 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  40.06 
 
 		 313 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  40.97 
 
 		 343 aa  222  6e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  40.58 
 
 		 343 aa  222  7e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  42.14 
 
 		 354 aa  222  8e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  38.14 
 
 		 353 aa  222  9e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  40.13 
 
 		 332 aa  221  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  40.72 
 
 		 349 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  40 
 
 		 343 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  40.72 
 
 		 349 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  40.88 
 
 		 333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  39.58 
 
 		 342 aa  220  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  41.49 
 
 		 350 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5173  aldo/keto reductase  40.58 
 
 		 345 aa  218  7.999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  40.99 
 
 		 349 aa  219  7.999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  42.06 
 
 		 352 aa  218  7.999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  39.64 
 
 		 338 aa  218  8.999999999999998e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  40 
 
 		 341 aa  218  1e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6213  aldo/keto reductase  41.61 
 
 		 344 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  39.74 
 
 		 331 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  39.87 
 
 		 313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3629  aldo/keto reductase  39.94 
 
 		 344 aa  216  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0520546 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  36.67 
 
 		 327 aa  216  5e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0585  aldo/keto reductase  41.61 
 
 		 344 aa  216  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  38.95 
 
 		 344 aa  215  8e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  40.3 
 
 		 351 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  40.3 
 
 		 351 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  37.01 
 
 		 349 aa  215  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1722  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.87 
 
 		 339 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0414871  hitchhiker  0.00103465 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1541  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.87 
 
 		 339 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  39.4 
 
 		 370 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  40.95 
 
 		 334 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1650  aldo/keto reductase  39.87 
 
 		 339 aa  215  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  38.92 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  39.47 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  39.52 
 
 		 350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  37.01 
 
 		 349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  39.94 
 
 		 348 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  40.3 
 
 		 351 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10590  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  39.88 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244513 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  38.92 
 
 		 344 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  38.7 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1811  aldo/keto reductase  39.54 
 
 		 316 aa  210  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  40.25 
 
 		 352 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4529  aldo/keto reductase  37.27 
 
 		 326 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>