More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1049 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1049  aldo/keto reductase  100 
 
 
323 aa  674    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  43.35 
 
 
332 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5453  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40.54 
 
 
335 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  42.76 
 
 
343 aa  241  7.999999999999999e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  41.74 
 
 
325 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  40.19 
 
 
339 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  40.19 
 
 
339 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  38.71 
 
 
333 aa  238  8e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  41.64 
 
 
331 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5007  aldo/keto reductase  39.53 
 
 
335 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0588  aldo/keto reductase  38.07 
 
 
360 aa  237  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3174  aldo/keto reductase  40.43 
 
 
336 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  40.98 
 
 
331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  37.5 
 
 
333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  41.54 
 
 
338 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  39.56 
 
 
331 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0426  aldo/keto reductase  39.02 
 
 
361 aa  232  8.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2676  aldo/keto reductase  39.66 
 
 
336 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2353  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2915  aldo/keto reductase  40.43 
 
 
337 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0931  putative oxidoreductase (aldo/keto reductase)  39.66 
 
 
336 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  39.74 
 
 
349 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  40.25 
 
 
345 aa  230  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  37.42 
 
 
336 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  39.06 
 
 
348 aa  229  4e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  39.1 
 
 
349 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2542  aldo/keto reductase  39.36 
 
 
336 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  40.13 
 
 
334 aa  228  7e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  40.6 
 
 
317 aa  229  7e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  38.64 
 
 
337 aa  228  9e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  38.61 
 
 
343 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  38.94 
 
 
351 aa  228  1e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  42.07 
 
 
341 aa  228  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  40.27 
 
 
348 aa  226  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3824  aldo/keto reductase  38.98 
 
 
339 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  35.94 
 
 
345 aa  226  5.0000000000000005e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  37.11 
 
 
338 aa  225  7e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6213  aldo/keto reductase  38.28 
 
 
344 aa  224  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  40.4 
 
 
349 aa  225  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2514  aldo/keto reductase  37.62 
 
 
333 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  38.75 
 
 
322 aa  224  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  40 
 
 
349 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  40 
 
 
343 aa  224  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  39.66 
 
 
337 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  39.01 
 
 
346 aa  224  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  39.34 
 
 
344 aa  223  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  36.79 
 
 
338 aa  223  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3167  aldo/keto reductase  38.31 
 
 
354 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  40.27 
 
 
315 aa  222  6e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  42 
 
 
349 aa  222  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  38.98 
 
 
340 aa  222  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3731  aldo/keto reductase  37.29 
 
 
336 aa  222  8e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0880043 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0585  aldo/keto reductase  37.42 
 
 
344 aa  222  9e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  37.87 
 
 
349 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  36.73 
 
 
327 aa  221  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  36.91 
 
 
341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  39.22 
 
 
341 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  39.86 
 
 
368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1565  aldo/keto reductase  37.97 
 
 
332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.876817  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  38.01 
 
 
353 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1811  aldo/keto reductase  40.27 
 
 
316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0693  aldo/keto reductase  37.79 
 
 
338 aa  219  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1755  aldo/keto reductase  36.36 
 
 
323 aa  219  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000557671 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0809  aldo/keto reductase  38.8 
 
 
317 aa  219  3.9999999999999997e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  39.09 
 
 
315 aa  219  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  36.09 
 
 
344 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  38.15 
 
 
352 aa  219  6e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  37.23 
 
 
358 aa  218  7.999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  36.76 
 
 
349 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7188  aldo/keto reductase  36.61 
 
 
349 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0869  putative oxidoreductase  39.6 
 
 
325 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3469  aldo/keto reductase  36.33 
 
 
342 aa  216  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  36.69 
 
 
313 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5927  aldo/keto oxidoreductase  37.63 
 
 
341 aa  216  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0927  aldo/keto reductase  38.31 
 
 
342 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320709  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  35.85 
 
 
342 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  38.39 
 
 
349 aa  215  8e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  37.7 
 
 
389 aa  215  8e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  38.39 
 
 
349 aa  215  8e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  37.38 
 
 
344 aa  215  9e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_003296  RS03071  putative oxidoreductase protein  35.47 
 
 
334 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0430  aldo/keto reductase  37.31 
 
 
326 aa  214  9.999999999999999e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.542765  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  36.16 
 
 
313 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0471  aldo/keto reductase  36.76 
 
 
337 aa  214  9.999999999999999e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00023215  normal  0.05091 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6159  aldo/keto reductase  40.97 
 
 
317 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145044  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0266  aldo/keto reductase  38.28 
 
 
344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5053  aldo/keto reductase  36.36 
 
 
335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0148  aldo/keto reductase  39.44 
 
 
319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00957933  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  37.26 
 
 
327 aa  213  4.9999999999999996e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2569  aldo/keto reductase  35.59 
 
 
359 aa  212  7e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2297  aldo/keto reductase  38.18 
 
 
339 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0919281  normal  0.745376 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5173  aldo/keto reductase  37.11 
 
 
345 aa  212  9e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0782  aldo/keto reductase  36.31 
 
 
318 aa  211  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.16349  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  34.67 
 
 
354 aa  211  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0033  aldo/keto reductase  38.23 
 
 
339 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  36.42 
 
 
344 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0042  aldo/keto reductase  38.23 
 
 
339 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00274786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0023  aldo/keto reductase  38.23 
 
 
339 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  35.95 
 
 
355 aa  210  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1041  aldo/keto reductase  35.78 
 
 
329 aa  210  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  35.5 
 
 
340 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>