More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2514 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2514  aldo/keto reductase  100 
 
 
333 aa  687    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3167  aldo/keto reductase  99.7 
 
 
354 aa  687    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1565  aldo/keto reductase  82.78 
 
 
332 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.876817  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3469  aldo/keto reductase  79.46 
 
 
342 aa  551  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5927  aldo/keto oxidoreductase  70.39 
 
 
341 aa  488  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5233  aldo/keto reductase  69.91 
 
 
349 aa  485  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0462  aldo/keto reductase  64.65 
 
 
333 aa  444  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147038  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3824  aldo/keto reductase  59.76 
 
 
339 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0931  putative oxidoreductase (aldo/keto reductase)  58.43 
 
 
336 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  59.52 
 
 
337 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  57.1 
 
 
337 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3731  aldo/keto reductase  58.61 
 
 
336 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0880043 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5659  aldo/keto reductase  56.19 
 
 
353 aa  388  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184034  normal  0.516333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2297  aldo/keto reductase  57.4 
 
 
339 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0919281  normal  0.745376 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7188  aldo/keto reductase  55.29 
 
 
349 aa  377  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5007  aldo/keto reductase  53.31 
 
 
335 aa  361  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5453  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  52.11 
 
 
335 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2676  aldo/keto reductase  53.29 
 
 
336 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2353  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0927  aldo/keto reductase  56.02 
 
 
342 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320709  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2542  aldo/keto reductase  53.89 
 
 
336 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3174  aldo/keto reductase  53.29 
 
 
336 aa  354  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03071  putative oxidoreductase protein  54.65 
 
 
334 aa  354  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2915  aldo/keto reductase  52.25 
 
 
337 aa  350  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5053  aldo/keto reductase  54.49 
 
 
335 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4528  aldo/keto reductase  53.89 
 
 
335 aa  348  5e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.153462  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0520  aldo/keto reductase  53.29 
 
 
335 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00146659  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2569  aldo/keto reductase  52.87 
 
 
359 aa  344  1e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  40.54 
 
 
343 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  41.52 
 
 
343 aa  224  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1049  aldo/keto reductase  37.62 
 
 
323 aa  224  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  39.57 
 
 
325 aa  223  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  42.19 
 
 
349 aa  222  8e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  39.25 
 
 
349 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  40 
 
 
343 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  39.43 
 
 
333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  40.62 
 
 
345 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6197  aldo/keto reductase  39.4 
 
 
339 aa  210  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  41.35 
 
 
313 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  41.25 
 
 
368 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  39.12 
 
 
333 aa  209  6e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  41.53 
 
 
313 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  39.24 
 
 
332 aa  208  9e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  39.01 
 
 
348 aa  208  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  39.88 
 
 
340 aa  208  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  41.37 
 
 
341 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4281  aldo/keto reductase  41.72 
 
 
317 aa  207  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198466  hitchhiker  0.0048015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  39.82 
 
 
342 aa  205  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  39.88 
 
 
335 aa  204  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  37.07 
 
 
327 aa  204  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  40.71 
 
 
313 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  39.63 
 
 
355 aa  203  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  39.68 
 
 
341 aa  200  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  37.24 
 
 
353 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0266  aldo/keto reductase  39.22 
 
 
344 aa  199  5e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  38.54 
 
 
322 aa  199  6e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  38.68 
 
 
331 aa  199  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  38.66 
 
 
344 aa  199  7e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  40.38 
 
 
313 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  39.56 
 
 
309 aa  198  9e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  38.83 
 
 
315 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  39.69 
 
 
336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2439  putative aldo/keto reductase  37.69 
 
 
341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  decreased coverage  0.000840189 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0458  aldo/keto reductase  38.51 
 
 
317 aa  197  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  39.45 
 
 
343 aa  197  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  39.26 
 
 
325 aa  196  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6213  aldo/keto reductase  38.19 
 
 
344 aa  196  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3890  aldo/keto reductase  39.86 
 
 
319 aa  196  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872462  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0379  aldo/keto reductase  40.39 
 
 
314 aa  195  8.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0161187  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  37.2 
 
 
349 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5173  aldo/keto reductase  39.47 
 
 
345 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  38.34 
 
 
349 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0585  aldo/keto reductase  39.07 
 
 
344 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  40 
 
 
354 aa  193  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  36.9 
 
 
349 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  37.19 
 
 
343 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  38.39 
 
 
352 aa  192  7e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  38.39 
 
 
329 aa  192  7e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3318  aldo/keto reductase  38.53 
 
 
327 aa  192  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0621997 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  38.12 
 
 
343 aa  192  8e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  36.88 
 
 
343 aa  192  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  38.53 
 
 
344 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  37.15 
 
 
351 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  38.04 
 
 
326 aa  191  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6256  aldo/keto reductase  39.1 
 
 
334 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5072  aldo/keto reductase  39.87 
 
 
325 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  38.36 
 
 
331 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  36.17 
 
 
349 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0033  aldo/keto reductase  36.78 
 
 
339 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0823  aldo/keto reductase  41.16 
 
 
322 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0042  aldo/keto reductase  36.78 
 
 
339 aa  190  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00274786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0023  aldo/keto reductase  36.78 
 
 
339 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  36.17 
 
 
349 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  36.56 
 
 
343 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  37.54 
 
 
352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6159  aldo/keto reductase  39.3 
 
 
317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145044  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6431  aldo/keto reductase  36.62 
 
 
324 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  38.2 
 
 
345 aa  189  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0490  aldo/keto reductase  40.55 
 
 
323 aa  188  9e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.828014 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  37.23 
 
 
352 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0264  aldo/keto reductase  41.16 
 
 
323 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>