More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4528 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_4528  aldo/keto reductase  100 
 
 
335 aa  683    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.153462  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5053  aldo/keto reductase  97.31 
 
 
335 aa  645    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0520  aldo/keto reductase  92.54 
 
 
335 aa  621  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00146659  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03071  putative oxidoreductase protein  83.83 
 
 
334 aa  556  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2297  aldo/keto reductase  72.67 
 
 
339 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0919281  normal  0.745376 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7188  aldo/keto reductase  66.67 
 
 
349 aa  462  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5659  aldo/keto reductase  64.97 
 
 
353 aa  458  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184034  normal  0.516333 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2569  aldo/keto reductase  64.46 
 
 
359 aa  446  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  62.39 
 
 
337 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  62.76 
 
 
337 aa  433  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0931  putative oxidoreductase (aldo/keto reductase)  61.38 
 
 
336 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3824  aldo/keto reductase  61.38 
 
 
339 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2915  aldo/keto reductase  61.38 
 
 
337 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5007  aldo/keto reductase  59.76 
 
 
335 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3731  aldo/keto reductase  59.46 
 
 
336 aa  412  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0880043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3174  aldo/keto reductase  59.46 
 
 
336 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5453  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  58.81 
 
 
335 aa  408  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2676  aldo/keto reductase  59.46 
 
 
336 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2353  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2542  aldo/keto reductase  59.76 
 
 
336 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5233  aldo/keto reductase  58.56 
 
 
349 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0927  aldo/keto reductase  62.09 
 
 
342 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320709  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5927  aldo/keto oxidoreductase  59.1 
 
 
341 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0462  aldo/keto reductase  54.93 
 
 
333 aa  373  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147038  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3167  aldo/keto reductase  53.89 
 
 
354 aa  363  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2514  aldo/keto reductase  53.89 
 
 
333 aa  362  3e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3469  aldo/keto reductase  53.75 
 
 
342 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1565  aldo/keto reductase  54.05 
 
 
332 aa  350  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.876817  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  40.48 
 
 
333 aa  249  5e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  41.09 
 
 
333 aa  247  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2439  putative aldo/keto reductase  44.1 
 
 
341 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  decreased coverage  0.000840189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  42.45 
 
 
343 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  42.81 
 
 
340 aa  239  6.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  42.63 
 
 
333 aa  231  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  41.37 
 
 
342 aa  229  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  42.86 
 
 
345 aa  229  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  41.23 
 
 
315 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  40.49 
 
 
325 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  40.82 
 
 
322 aa  223  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  42.71 
 
 
331 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  41.26 
 
 
315 aa  223  4e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  39.43 
 
 
332 aa  222  8e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  38.96 
 
 
317 aa  221  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  40.43 
 
 
341 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  42.12 
 
 
343 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  42.37 
 
 
331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  40.45 
 
 
313 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  40.6 
 
 
344 aa  219  7e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  39.81 
 
 
325 aa  218  7.999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  41.98 
 
 
335 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  40 
 
 
343 aa  217  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  41.21 
 
 
313 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  42.26 
 
 
327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10970  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  44.93 
 
 
327 aa  216  4e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  38.91 
 
 
349 aa  216  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  40.31 
 
 
332 aa  215  7e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  41.32 
 
 
334 aa  215  8e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  38.66 
 
 
349 aa  215  8e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  40 
 
 
348 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  39.01 
 
 
336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1898  aldo/keto reductase  37.69 
 
 
332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116625 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1049  aldo/keto reductase  35.69 
 
 
323 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  39.18 
 
 
333 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5173  aldo/keto reductase  38.62 
 
 
345 aa  212  7.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0296  aldo/keto reductase  39.5 
 
 
338 aa  211  9e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  39.13 
 
 
331 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1876  aldo/keto reductase  37.91 
 
 
342 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0585  aldo/keto reductase  39.51 
 
 
344 aa  210  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  40.26 
 
 
313 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1691  aldo/keto reductase  42.11 
 
 
336 aa  211  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0210969 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6213  aldo/keto reductase  40.12 
 
 
344 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  38.46 
 
 
327 aa  209  4e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  39.44 
 
 
343 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
313 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  37.15 
 
 
347 aa  208  9e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  38.08 
 
 
343 aa  208  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2390  aldo/keto reductase  39.29 
 
 
336 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000519885  hitchhiker  0.000458148 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0430  aldo/keto reductase  37.16 
 
 
326 aa  206  4e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.542765  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  39.13 
 
 
343 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  40.68 
 
 
341 aa  204  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1650  aldo/keto reductase  38.54 
 
 
339 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1541  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.54 
 
 
339 aa  204  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  38.82 
 
 
343 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  37.88 
 
 
352 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1722  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.66 
 
 
339 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0414871  hitchhiker  0.00103465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  39.63 
 
 
341 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4529  aldo/keto reductase  38.48 
 
 
326 aa  203  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2469  aldo/keto reductase  38.61 
 
 
348 aa  203  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0410  aldo/keto reductase  37.77 
 
 
320 aa  203  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213987  normal  0.0921299 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4577  aldo/keto reductase  40.57 
 
 
353 aa  202  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871786  normal  0.194058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2653  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  37.15 
 
 
332 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.481202  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
325 aa  202  7e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  37.85 
 
 
309 aa  202  8e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2826  aldo/keto reductase  40.72 
 
 
340 aa  202  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  36.56 
 
 
334 aa  201  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  35.45 
 
 
351 aa  202  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1178  aldo/keto reductase  37.9 
 
 
353 aa  201  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6739  aldo/keto reductase  38.84 
 
 
331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  39.01 
 
 
343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  37.99 
 
 
354 aa  200  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1550  aldo/keto reductase  38.41 
 
 
324 aa  200  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>