More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5927 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5927  aldo/keto oxidoreductase  100 
 
 		 341 aa  701    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5233  aldo/keto reductase  83.72 
 
 		 349 aa  600  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0462  aldo/keto reductase  70.27 
 
 		 333 aa  489  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2514  aldo/keto reductase  70.39 
 
 		 333 aa  488  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3167  aldo/keto reductase  70.69 
 
 		 354 aa  489  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1565  aldo/keto reductase  71.87 
 
 		 332 aa  482  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.876817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3469  aldo/keto reductase  67.67 
 
 		 342 aa  479  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  64.95 
 
 		 337 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0931  putative oxidoreductase (aldo/keto reductase)  61.63 
 
 		 336 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3824  aldo/keto reductase  61.03 
 
 		 339 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  59.52 
 
 		 337 aa  418  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3731  aldo/keto reductase  61.63 
 
 		 336 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0880043 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5053  aldo/keto reductase  60 
 
 		 335 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5659  aldo/keto reductase  56.19 
 
 		 353 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184034  normal  0.516333 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7188  aldo/keto reductase  57.4 
 
 		 349 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0927  aldo/keto reductase  60.42 
 
 		 342 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320709  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4528  aldo/keto reductase  59.1 
 
 		 335 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.153462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2297  aldo/keto reductase  58.61 
 
 		 339 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0919281  normal  0.745376 
 
 
-
 
NC_003296  RS03071  putative oxidoreductase protein  60.42 
 
 		 334 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0520  aldo/keto reductase  57.61 
 
 		 335 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00146659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2569  aldo/keto reductase  57.69 
 
 		 359 aa  375  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5453  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  54.19 
 
 		 335 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3174  aldo/keto reductase  54.82 
 
 		 336 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2676  aldo/keto reductase  54.22 
 
 		 336 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5007  aldo/keto reductase  54.22 
 
 		 335 aa  364  1e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2542  aldo/keto reductase  54.82 
 
 		 336 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2915  aldo/keto reductase  54.52 
 
 		 337 aa  360  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  40.35 
 
 		 343 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  41.18 
 
 		 349 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  39.02 
 
 		 333 aa  226  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  39.02 
 
 		 333 aa  226  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  41.05 
 
 		 349 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  40.74 
 
 		 325 aa  226  5.0000000000000005e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  39.87 
 
 		 332 aa  225  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  40.73 
 
 		 343 aa  222  6e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  40.69 
 
 		 340 aa  222  7e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  40.13 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  40.24 
 
 		 341 aa  220  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  40.94 
 
 		 345 aa  220  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  41.4 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1049  aldo/keto reductase  37.63 
 
 		 323 aa  216  4e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1178  aldo/keto reductase  41.59 
 
 		 353 aa  216  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  40.24 
 
 		 344 aa  216  5.9999999999999996e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  38.7 
 
 		 348 aa  215  7e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  40.25 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  41.27 
 
 		 341 aa  212  7.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  37.39 
 
 		 329 aa  212  7.999999999999999e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  40.58 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  39.94 
 
 		 313 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  39.05 
 
 		 343 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  38.71 
 
 		 343 aa  210  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  38.46 
 
 		 325 aa  210  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6213  aldo/keto reductase  40.25 
 
 		 344 aa  209  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  38.67 
 
 		 342 aa  210  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  39.41 
 
 		 343 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  39.05 
 
 		 343 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  40.89 
 
 		 313 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  37.58 
 
 		 353 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  38.3 
 
 		 343 aa  207  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  39.94 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2439  putative aldo/keto reductase  39.62 
 
 		 341 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  decreased coverage  0.000840189 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  39.62 
 
 		 331 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0585  aldo/keto reductase  40.25 
 
 		 344 aa  207  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  38.7 
 
 		 368 aa  206  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  39 
 
 		 341 aa  205  8e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  39.67 
 
 		 331 aa  205  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  40.56 
 
 		 344 aa  205  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2826  aldo/keto reductase  39.6 
 
 		 340 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1650  aldo/keto reductase  37.62 
 
 		 339 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1722  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.5 
 
 		 339 aa  204  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0414871  hitchhiker  0.00103465 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1541  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.62 
 
 		 339 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4281  aldo/keto reductase  40.61 
 
 		 317 aa  202  6e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198466  hitchhiker  0.0048015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3629  aldo/keto reductase  38.58 
 
 		 344 aa  202  7e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0520546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4156  aldo/keto reductase  39.14 
 
 		 335 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0249282  normal  0.138418 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  36.63 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  39.42 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  37.11 
 
 		 351 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  38.87 
 
 		 343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  36.57 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  36.08 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0266  aldo/keto reductase  38.99 
 
 		 344 aa  200  3e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  37.65 
 
 		 351 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5690  aldo/keto reductase  36.59 
 
 		 326 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0442358  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  37.65 
 
 		 351 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  38.29 
 
 		 352 aa  200  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  37.31 
 
 		 338 aa  199  6e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  36.65 
 
 		 349 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  40 
 
 		 333 aa  198  9e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3286  aldo/keto reductase  38.87 
 
 		 323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.278509 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5173  aldo/keto reductase  39.63 
 
 		 345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  37.42 
 
 		 326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  38.49 
 
 		 325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  37.93 
 
 		 349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  37.65 
 
 		 351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  38.05 
 
 		 355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  36.65 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  38.16 
 
 		 317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  36.2 
 
 		 349 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0296  aldo/keto reductase  38.58 
 
 		 338 aa  196  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10590  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  39.13 
 
 		 331 aa  197  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>