More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2676 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3174  aldo/keto reductase  94.94 
 
 		 336 aa  665    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2542  aldo/keto reductase  94.94 
 
 		 336 aa  666    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2676  aldo/keto reductase  100 
 
 		 336 aa  689    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2915  aldo/keto reductase  79.46 
 
 		 337 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5007  aldo/keto reductase  75.82 
 
 		 335 aa  544  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5453  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  75.52 
 
 		 335 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  59.4 
 
 		 337 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3824  aldo/keto reductase  59.82 
 
 		 339 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5659  aldo/keto reductase  60.91 
 
 		 353 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184034  normal  0.516333 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  58.98 
 
 		 337 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0931  putative oxidoreductase (aldo/keto reductase)  57.31 
 
 		 336 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7188  aldo/keto reductase  58.56 
 
 		 349 aa  398  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03071  putative oxidoreductase protein  61.79 
 
 		 334 aa  396  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4528  aldo/keto reductase  59.46 
 
 		 335 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.153462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5053  aldo/keto reductase  59.58 
 
 		 335 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2569  aldo/keto reductase  58.56 
 
 		 359 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0520  aldo/keto reductase  58.98 
 
 		 335 aa  388  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00146659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2297  aldo/keto reductase  57.78 
 
 		 339 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0919281  normal  0.745376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3731  aldo/keto reductase  55.95 
 
 		 336 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0880043 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0927  aldo/keto reductase  58.43 
 
 		 342 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320709  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5233  aldo/keto reductase  53.75 
 
 		 349 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0462  aldo/keto reductase  55.42 
 
 		 333 aa  368  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5927  aldo/keto oxidoreductase  54.22 
 
 		 341 aa  366  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3469  aldo/keto reductase  52.48 
 
 		 342 aa  363  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1565  aldo/keto reductase  53.75 
 
 		 332 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.876817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3167  aldo/keto reductase  53.29 
 
 		 354 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2514  aldo/keto reductase  53.29 
 
 		 333 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  40.85 
 
 		 315 aa  235  8e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1049  aldo/keto reductase  39.66 
 
 		 323 aa  231  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  41.59 
 
 		 322 aa  228  9e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  38.35 
 
 		 333 aa  228  9e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  41.42 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  41.23 
 
 		 340 aa  225  9e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3006  aldo/keto reductase  40.92 
 
 		 327 aa  224  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.378905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2439  putative aldo/keto reductase  41.14 
 
 		 341 aa  224  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  decreased coverage  0.000840189 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  41.72 
 
 		 343 aa  223  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  39.94 
 
 		 332 aa  223  4e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  40.06 
 
 		 327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  39.18 
 
 		 327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  38.58 
 
 		 325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  41.82 
 
 		 333 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0430  aldo/keto reductase  39.94 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.542765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  40.51 
 
 		 341 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  40.19 
 
 		 349 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  37.58 
 
 		 317 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  41.33 
 
 		 331 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  40.37 
 
 		 343 aa  215  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  39.94 
 
 		 313 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04673  voltage-gated potassium channel beta subunit  41.32 
 
 		 322 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  35.93 
 
 		 333 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  39.2 
 
 		 352 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  39.63 
 
 		 334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  39.2 
 
 		 351 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1811  aldo/keto reductase  38.76 
 
 		 316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  38.44 
 
 		 352 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0471  aldo/keto reductase  38.48 
 
 		 337 aa  212  7.999999999999999e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00023215  normal  0.05091 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  40.98 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  40.67 
 
 		 331 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  37.73 
 
 		 343 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1876  aldo/keto reductase  38.25 
 
 		 342 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5173  aldo/keto reductase  40.67 
 
 		 345 aa  211  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  40.99 
 
 		 349 aa  209  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  39.26 
 
 		 348 aa  209  5e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  38.34 
 
 		 313 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  38.17 
 
 		 342 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  41.3 
 
 		 368 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  40.27 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  39.44 
 
 		 343 aa  207  3e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  37.06 
 
 		 313 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  38.82 
 
 		 335 aa  206  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  36.96 
 
 		 336 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  37.38 
 
 		 343 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  38.2 
 
 		 325 aa  205  8e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  38.77 
 
 		 350 aa  205  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  38.12 
 
 		 344 aa  205  9e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  37.07 
 
 		 343 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  37 
 
 		 344 aa  205  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  38.62 
 
 		 349 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  39.83 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0643  aldo/keto reductase  41.41 
 
 		 323 aa  203  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.671834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  39.2 
 
 		 354 aa  203  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  37.22 
 
 		 313 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6213  aldo/keto reductase  38.28 
 
 		 344 aa  202  6e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3629  aldo/keto reductase  37.79 
 
 		 344 aa  202  6e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0520546 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  36.05 
 
 		 343 aa  202  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1550  aldo/keto reductase  37.38 
 
 		 324 aa  202  6e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1691  aldo/keto reductase  38.56 
 
 		 336 aa  202  8e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0210969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1813  aldo/keto reductase  39.32 
 
 		 329 aa  202  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0383943 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  37.7 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  37.85 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0585  aldo/keto reductase  38.28 
 
 		 344 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1620  aldo/keto reductase  38.7 
 
 		 329 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.884834  normal  0.762073 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08597  VIC potassium ion channel, beta subunit (Eurofung)  40.4 
 
 		 341 aa  200  3e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  35.51 
 
 		 334 aa  200  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0434  aldo/keto reductase  37.69 
 
 		 323 aa  200  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  38.61 
 
 		 332 aa  200  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1879  aldo/keto reductase  37.31 
 
 		 338 aa  200  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4200  aldo/keto reductase  39.29 
 
 		 327 aa  200  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  36.31 
 
 		 351 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  38.05 
 
 		 349 aa  200  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>