More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3469 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3469  aldo/keto reductase  100 
 
 		 342 aa  707    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2514  aldo/keto reductase  79.46 
 
 		 333 aa  551  1e-156  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3167  aldo/keto reductase  79.46 
 
 		 354 aa  551  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1565  aldo/keto reductase  76.51 
 
 		 332 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.876817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5233  aldo/keto reductase  69.32 
 
 		 349 aa  494  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5927  aldo/keto oxidoreductase  67.67 
 
 		 341 aa  479  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0462  aldo/keto reductase  66.16 
 
 		 333 aa  464  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  57.53 
 
 		 337 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0931  putative oxidoreductase (aldo/keto reductase)  56.5 
 
 		 336 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3824  aldo/keto reductase  56.8 
 
 		 339 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  57.83 
 
 		 337 aa  394  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3731  aldo/keto reductase  56.63 
 
 		 336 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0880043 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5659  aldo/keto reductase  54.98 
 
 		 353 aa  381  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184034  normal  0.516333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2297  aldo/keto reductase  57.1 
 
 		 339 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0919281  normal  0.745376 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7188  aldo/keto reductase  55.12 
 
 		 349 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5007  aldo/keto reductase  53.15 
 
 		 335 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2676  aldo/keto reductase  52.48 
 
 		 336 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2542  aldo/keto reductase  53.45 
 
 		 336 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5453  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  51.81 
 
 		 335 aa  360  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2569  aldo/keto reductase  53.31 
 
 		 359 aa  359  4e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0927  aldo/keto reductase  56.19 
 
 		 342 aa  359  5e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320709  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2915  aldo/keto reductase  52.41 
 
 		 337 aa  358  7e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3174  aldo/keto reductase  52.25 
 
 		 336 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03071  putative oxidoreductase protein  55.59 
 
 		 334 aa  353  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5053  aldo/keto reductase  54.35 
 
 		 335 aa  350  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4528  aldo/keto reductase  53.75 
 
 		 335 aa  347  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.153462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0520  aldo/keto reductase  53.15 
 
 		 335 aa  345  5e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00146659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  40 
 
 		 343 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  40.12 
 
 		 325 aa  226  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  40.59 
 
 		 343 aa  224  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  41.72 
 
 		 345 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  40.13 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  38.79 
 
 		 343 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1049  aldo/keto reductase  36.33 
 
 		 323 aa  216  4e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  39.51 
 
 		 349 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  40.26 
 
 		 313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  40.13 
 
 		 313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  39.31 
 
 		 349 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  40.13 
 
 		 313 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  39.31 
 
 		 331 aa  209  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  38.29 
 
 		 332 aa  209  7e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  37.36 
 
 		 348 aa  208  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  40.13 
 
 		 331 aa  206  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  38.02 
 
 		 353 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  38.63 
 
 		 368 aa  203  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4281  aldo/keto reductase  39.93 
 
 		 317 aa  202  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198466  hitchhiker  0.0048015 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0266  aldo/keto reductase  38.62 
 
 		 344 aa  202  9e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  38.17 
 
 		 340 aa  202  9e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  39.2 
 
 		 331 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6197  aldo/keto reductase  38.46 
 
 		 339 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  38.94 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  37.14 
 
 		 322 aa  199  7.999999999999999e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  38.1 
 
 		 341 aa  199  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  37.98 
 
 		 342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  38.23 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  37.79 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  36.88 
 
 		 343 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  34.59 
 
 		 327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  37.04 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  36.6 
 
 		 317 aa  196  7e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0033  aldo/keto reductase  36.47 
 
 		 339 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  37.97 
 
 		 355 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  36.56 
 
 		 343 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0042  aldo/keto reductase  36.47 
 
 		 339 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00274786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0023  aldo/keto reductase  36.47 
 
 		 339 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  37.19 
 
 		 333 aa  194  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  37.42 
 
 		 352 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  35.69 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  36.56 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  36.25 
 
 		 343 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3629  aldo/keto reductase  37 
 
 		 344 aa  193  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0520546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3890  aldo/keto reductase  38.7 
 
 		 319 aa  193  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  36.12 
 
 		 370 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0488  aldo/keto reductase  37.87 
 
 		 368 aa  193  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.807596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1178  aldo/keto reductase  38.23 
 
 		 353 aa  192  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0458  aldo/keto reductase  38.41 
 
 		 317 aa  192  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  37.69 
 
 		 343 aa  192  7e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3286  aldo/keto reductase  37.39 
 
 		 323 aa  192  8e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.278509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  39.37 
 
 		 341 aa  192  8e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1811  aldo/keto reductase  35.95 
 
 		 316 aa  192  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  35.82 
 
 		 351 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  35.82 
 
 		 351 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  37.79 
 
 		 354 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  38.39 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6213  aldo/keto reductase  38.39 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  38.69 
 
 		 336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  35.82 
 
 		 351 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  35.1 
 
 		 349 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  36.84 
 
 		 326 aa  189  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  35.49 
 
 		 345 aa  189  5e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  35.82 
 
 		 351 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  35.67 
 
 		 349 aa  188  9e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  35.67 
 
 		 349 aa  188  9e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  37.61 
 
 		 343 aa  188  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  37.5 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0585  aldo/keto reductase  38.08 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  38.19 
 
 		 329 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  37.58 
 
 		 349 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0490  aldo/keto reductase  37.5 
 
 		 323 aa  186  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.828014 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  36.99 
 
 		 334 aa  186  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>