More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03071 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03071  putative oxidoreductase protein  100 
 
 		 334 aa  679    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0520  aldo/keto reductase  85.03 
 
 		 335 aa  567  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00146659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4528  aldo/keto reductase  83.83 
 
 		 335 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.153462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5053  aldo/keto reductase  82.93 
 
 		 335 aa  551  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2297  aldo/keto reductase  75.53 
 
 		 339 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0919281  normal  0.745376 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5659  aldo/keto reductase  69.58 
 
 		 353 aa  477  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184034  normal  0.516333 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7188  aldo/keto reductase  68.86 
 
 		 349 aa  477  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  65.56 
 
 		 337 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2569  aldo/keto reductase  67.17 
 
 		 359 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  64.07 
 
 		 337 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3824  aldo/keto reductase  64.67 
 
 		 339 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0931  putative oxidoreductase (aldo/keto reductase)  63.77 
 
 		 336 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3731  aldo/keto reductase  62.57 
 
 		 336 aa  430  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0880043 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0927  aldo/keto reductase  66.57 
 
 		 342 aa  420  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320709  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5007  aldo/keto reductase  61.49 
 
 		 335 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2915  aldo/keto reductase  62.09 
 
 		 337 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5453  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  60.3 
 
 		 335 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2542  aldo/keto reductase  62.09 
 
 		 336 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3174  aldo/keto reductase  61.49 
 
 		 336 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2676  aldo/keto reductase  61.79 
 
 		 336 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5233  aldo/keto reductase  59.94 
 
 		 349 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5927  aldo/keto oxidoreductase  60.42 
 
 		 341 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0462  aldo/keto reductase  58.91 
 
 		 333 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3469  aldo/keto reductase  55.59 
 
 		 342 aa  371  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3167  aldo/keto reductase  54.65 
 
 		 354 aa  371  1e-102  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2514  aldo/keto reductase  54.65 
 
 		 333 aa  371  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1565  aldo/keto reductase  55.29 
 
 		 332 aa  358  6e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.876817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  42.55 
 
 		 333 aa  259  4e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  43.77 
 
 		 333 aa  259  6e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2439  putative aldo/keto reductase  44.89 
 
 		 341 aa  252  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  decreased coverage  0.000840189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  42.99 
 
 		 343 aa  249  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  43.37 
 
 		 340 aa  248  8e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  43.38 
 
 		 345 aa  239  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  43.29 
 
 		 343 aa  239  4e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  41.67 
 
 		 342 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  41.9 
 
 		 341 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  43.28 
 
 		 322 aa  231  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  41.64 
 
 		 343 aa  230  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5173  aldo/keto reductase  40.35 
 
 		 345 aa  229  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  41.05 
 
 		 325 aa  228  9e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  42.04 
 
 		 344 aa  228  9e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  41.99 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  42.02 
 
 		 333 aa  228  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  40.68 
 
 		 349 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  38.73 
 
 		 317 aa  226  4e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1898  aldo/keto reductase  38.68 
 
 		 332 aa  225  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116625 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  41.83 
 
 		 315 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  41.49 
 
 		 348 aa  223  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  41.55 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  39.76 
 
 		 334 aa  222  6e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  40.06 
 
 		 332 aa  222  7e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  41.43 
 
 		 349 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0296  aldo/keto reductase  41.19 
 
 		 338 aa  220  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  40.67 
 
 		 332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6213  aldo/keto reductase  42.55 
 
 		 344 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1049  aldo/keto reductase  35.47 
 
 		 323 aa  219  6e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  41.42 
 
 		 313 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10970  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  43.65 
 
 		 327 aa  218  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  41.69 
 
 		 331 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  41.93 
 
 		 335 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  41.43 
 
 		 341 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0585  aldo/keto reductase  41.61 
 
 		 344 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  38.74 
 
 		 327 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  41.9 
 
 		 341 aa  216  5.9999999999999996e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  39.88 
 
 		 333 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1691  aldo/keto reductase  43.34 
 
 		 336 aa  216  5.9999999999999996e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0210969 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  40.98 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  41.12 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  40.06 
 
 		 325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  40.38 
 
 		 313 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0023  aldo/keto reductase  38.46 
 
 		 339 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  37.15 
 
 		 351 aa  212  7e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0033  aldo/keto reductase  38.46 
 
 		 339 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0042  aldo/keto reductase  38.46 
 
 		 339 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00274786 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1722  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.32 
 
 		 339 aa  211  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0414871  hitchhiker  0.00103465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0928  aldo/keto reductase  40.51 
 
 		 339 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1650  aldo/keto reductase  38.32 
 
 		 339 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1541  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.32 
 
 		 339 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0430  aldo/keto reductase  38.2 
 
 		 326 aa  211  2e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.542765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  40.99 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  40.06 
 
 		 313 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6197  aldo/keto reductase  39 
 
 		 339 aa  210  3e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  39.76 
 
 		 323 aa  208  8e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  37.35 
 
 		 338 aa  207  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0410  aldo/keto reductase  41.72 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213987  normal  0.0921299 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  38.12 
 
 		 347 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1876  aldo/keto reductase  38.74 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  38.96 
 
 		 334 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  38.44 
 
 		 355 aa  207  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1746  putative oxidoreductase  40.63 
 
 		 327 aa  206  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0734648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2390  aldo/keto reductase  40.39 
 
 		 336 aa  206  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000519885  hitchhiker  0.000458148 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1794  aldo/keto reductase  42.25 
 
 		 324 aa  206  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.81315 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1811  aldo/keto reductase  36.83 
 
 		 316 aa  205  8e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2653  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  38.04 
 
 		 332 aa  205  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.481202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  38.24 
 
 		 331 aa  205  8e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  37.93 
 
 		 352 aa  205  9e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  36.76 
 
 		 334 aa  204  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  38.79 
 
 		 352 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0266  aldo/keto reductase  40.49 
 
 		 344 aa  205  1e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  38.01 
 
 		 343 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>