More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5233 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5233  aldo/keto reductase  100 
 
 
349 aa  722    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5927  aldo/keto oxidoreductase  83.72 
 
 
341 aa  600  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0462  aldo/keto reductase  71 
 
 
333 aa  503  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147038  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3469  aldo/keto reductase  69.32 
 
 
342 aa  494  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2514  aldo/keto reductase  69.91 
 
 
333 aa  485  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3167  aldo/keto reductase  69.91 
 
 
354 aa  485  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1565  aldo/keto reductase  69.85 
 
 
332 aa  474  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.876817  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  64.74 
 
 
337 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  61.68 
 
 
337 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0931  putative oxidoreductase (aldo/keto reductase)  61.75 
 
 
336 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3824  aldo/keto reductase  60.06 
 
 
339 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3731  aldo/keto reductase  61.7 
 
 
336 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0880043 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0927  aldo/keto reductase  61.7 
 
 
342 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320709  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5659  aldo/keto reductase  58.01 
 
 
353 aa  396  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184034  normal  0.516333 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7188  aldo/keto reductase  57.06 
 
 
349 aa  392  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2297  aldo/keto reductase  58.97 
 
 
339 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0919281  normal  0.745376 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5053  aldo/keto reductase  59.46 
 
 
335 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03071  putative oxidoreductase protein  59.94 
 
 
334 aa  385  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4528  aldo/keto reductase  58.56 
 
 
335 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.153462  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2569  aldo/keto reductase  56.45 
 
 
359 aa  385  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0520  aldo/keto reductase  57.06 
 
 
335 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00146659  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5453  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  54.33 
 
 
335 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3174  aldo/keto reductase  53.45 
 
 
336 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2676  aldo/keto reductase  53.75 
 
 
336 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2353  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5007  aldo/keto reductase  54.35 
 
 
335 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2915  aldo/keto reductase  54.01 
 
 
337 aa  368  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2542  aldo/keto reductase  54.35 
 
 
336 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  42.36 
 
 
343 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  42.55 
 
 
325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  42.31 
 
 
322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  40.31 
 
 
332 aa  231  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  41.23 
 
 
343 aa  231  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  40.99 
 
 
349 aa  228  8e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  40.81 
 
 
349 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  42.63 
 
 
345 aa  226  7e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1178  aldo/keto reductase  42.54 
 
 
353 aa  223  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  39.63 
 
 
333 aa  223  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  40.63 
 
 
340 aa  222  7e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  39.01 
 
 
333 aa  222  8e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  38.92 
 
 
343 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  38.39 
 
 
348 aa  218  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  39.62 
 
 
343 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  39.39 
 
 
341 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  41.51 
 
 
331 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  39.62 
 
 
343 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0266  aldo/keto reductase  39.65 
 
 
344 aa  216  7e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  39.58 
 
 
342 aa  215  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  41.07 
 
 
335 aa  215  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  40.71 
 
 
313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6213  aldo/keto reductase  40.94 
 
 
344 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  39.62 
 
 
331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  40.65 
 
 
313 aa  212  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3629  aldo/keto reductase  39.4 
 
 
344 aa  212  7e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0520546 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  38.26 
 
 
329 aa  212  7e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  41.35 
 
 
341 aa  211  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  38.2 
 
 
353 aa  211  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2439  putative aldo/keto reductase  39.24 
 
 
341 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  decreased coverage  0.000840189 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4281  aldo/keto reductase  40.61 
 
 
317 aa  209  5e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198466  hitchhiker  0.0048015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0585  aldo/keto reductase  40.81 
 
 
344 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  39.87 
 
 
334 aa  209  6e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  39.87 
 
 
331 aa  209  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  38.18 
 
 
343 aa  209  8e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  37.72 
 
 
343 aa  208  9e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  38.71 
 
 
325 aa  208  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  39.48 
 
 
313 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5173  aldo/keto reductase  41.12 
 
 
345 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  38.86 
 
 
344 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1049  aldo/keto reductase  37.5 
 
 
323 aa  207  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6197  aldo/keto reductase  39.17 
 
 
339 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  40.95 
 
 
309 aa  207  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  38.92 
 
 
368 aa  206  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1687  aldo/keto reductase  38.98 
 
 
310 aa  206  7e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  38.81 
 
 
343 aa  206  7e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  39.87 
 
 
352 aa  206  7e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4156  aldo/keto reductase  39.43 
 
 
335 aa  205  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0249282  normal  0.138418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  39.38 
 
 
326 aa  205  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  40 
 
 
352 aa  205  9e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  36.31 
 
 
315 aa  205  9e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  36.16 
 
 
327 aa  205  9e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  38.73 
 
 
355 aa  204  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0023  aldo/keto reductase  37.66 
 
 
339 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  39.29 
 
 
344 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0033  aldo/keto reductase  37.66 
 
 
339 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  38.11 
 
 
315 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0042  aldo/keto reductase  37.66 
 
 
339 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00274786 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  39.56 
 
 
341 aa  204  3e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0844  putative aldo/keto reductase  39.39 
 
 
326 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  0.025561 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  39.45 
 
 
325 aa  203  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4529  aldo/keto reductase  38.65 
 
 
326 aa  202  6e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  38.24 
 
 
317 aa  202  6e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  37.35 
 
 
351 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  37.35 
 
 
351 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1650  aldo/keto reductase  35.73 
 
 
339 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  36.96 
 
 
351 aa  201  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1722  aldo/keto reductase family oxidoreductase  35.73 
 
 
339 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0414871  hitchhiker  0.00103465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6681  aldo/keto reductase  35.91 
 
 
349 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210539  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1541  aldo/keto reductase family oxidoreductase  35.73 
 
 
339 aa  202  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  38.85 
 
 
332 aa  200  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5690  aldo/keto reductase  36.81 
 
 
326 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0442358  normal  0.528688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>