More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6213 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6213  aldo/keto reductase  100 
 
 
344 aa  704    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0585  aldo/keto reductase  97.08 
 
 
344 aa  665    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  68.6 
 
 
349 aa  480  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  65.61 
 
 
348 aa  471  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  58.97 
 
 
345 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  55.46 
 
 
340 aa  357  9.999999999999999e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  53.91 
 
 
343 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  55.62 
 
 
341 aa  353  2.9999999999999997e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  54.81 
 
 
343 aa  348  7e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  55.23 
 
 
342 aa  348  8e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  54.15 
 
 
344 aa  347  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  52.56 
 
 
349 aa  343  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2439  putative aldo/keto reductase  53.91 
 
 
341 aa  342  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  decreased coverage  0.000840189 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5173  aldo/keto reductase  53.71 
 
 
345 aa  342  4e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6197  aldo/keto reductase  50.71 
 
 
339 aa  341  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  54.08 
 
 
368 aa  338  5e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0266  aldo/keto reductase  53.89 
 
 
344 aa  328  8e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  51.02 
 
 
343 aa  325  9e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  54.34 
 
 
341 aa  322  7e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0033  aldo/keto reductase  51.01 
 
 
339 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0042  aldo/keto reductase  51.01 
 
 
339 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00274786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0023  aldo/keto reductase  50.72 
 
 
339 aa  302  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0928  aldo/keto reductase  49.41 
 
 
339 aa  302  6.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339617  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3948  aldo/keto reductase  46.7 
 
 
357 aa  285  8e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  45.85 
 
 
333 aa  271  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0477  aldo/keto reductase  46.91 
 
 
348 aa  270  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  45.85 
 
 
333 aa  269  4e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  45.43 
 
 
341 aa  261  8e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  45.12 
 
 
325 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  44.17 
 
 
335 aa  243  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  42.41 
 
 
315 aa  242  7e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  42.32 
 
 
313 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  43.06 
 
 
353 aa  239  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1898  aldo/keto reductase  40.31 
 
 
332 aa  238  1e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116625 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  42.64 
 
 
333 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  41.36 
 
 
352 aa  238  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  42.81 
 
 
313 aa  237  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  42.28 
 
 
309 aa  236  4e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  41.56 
 
 
313 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4281  aldo/keto reductase  45.95 
 
 
317 aa  235  7e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198466  hitchhiker  0.0048015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  44.38 
 
 
325 aa  235  8e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  41.59 
 
 
332 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  39.64 
 
 
338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  41.56 
 
 
313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
358 aa  233  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  42.04 
 
 
326 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  39.82 
 
 
346 aa  232  6e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0296  aldo/keto reductase  42.46 
 
 
338 aa  231  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  40.18 
 
 
342 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  42.11 
 
 
322 aa  230  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  40.29 
 
 
326 aa  230  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  40.53 
 
 
349 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  40.79 
 
 
327 aa  229  4e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  39.44 
 
 
317 aa  229  5e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  41.28 
 
 
349 aa  229  5e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  42.15 
 
 
332 aa  229  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  39.6 
 
 
334 aa  227  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10590  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  40.81 
 
 
331 aa  228  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.244513 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0430  aldo/keto reductase  41.41 
 
 
326 aa  228  2e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.542765  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1811  aldo/keto reductase  38.7 
 
 
316 aa  227  3e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  38.82 
 
 
315 aa  226  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  41.77 
 
 
343 aa  226  4e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0069  aldo/keto reductase  46.1 
 
 
323 aa  225  8e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1049  aldo/keto reductase  38.28 
 
 
323 aa  224  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  41.05 
 
 
343 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4073  aldo/keto reductase  45.24 
 
 
311 aa  224  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.492904 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  40.24 
 
 
349 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3890  aldo/keto reductase  44.41 
 
 
319 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872462  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  40.24 
 
 
349 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  39.88 
 
 
349 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  41.3 
 
 
334 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  38.35 
 
 
348 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
350 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0471  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
337 aa  222  6e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00023215  normal  0.05091 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  44.2 
 
 
316 aa  222  7e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03071  putative oxidoreductase protein  42.55 
 
 
334 aa  222  8e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0931  putative oxidoreductase (aldo/keto reductase)  40.91 
 
 
336 aa  222  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  40.68 
 
 
337 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  39.18 
 
 
350 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  39.88 
 
 
349 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3629  aldo/keto reductase  41.52 
 
 
344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0520546 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  40.74 
 
 
343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  40.74 
 
 
343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0520  aldo/keto reductase  40.43 
 
 
335 aa  220  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00146659  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  41.96 
 
 
351 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  41.96 
 
 
351 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  42.26 
 
 
370 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  39.51 
 
 
328 aa  219  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3824  aldo/keto reductase  41.61 
 
 
339 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  39.18 
 
 
349 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  40.26 
 
 
343 aa  219  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1687  aldo/keto reductase  38.82 
 
 
310 aa  219  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  40.68 
 
 
337 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1464  aldo/keto reductase  40.24 
 
 
326 aa  219  5e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000207795  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  38.1 
 
 
327 aa  219  6e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  39.47 
 
 
339 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  38.48 
 
 
351 aa  218  7.999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  39.47 
 
 
339 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  40.62 
 
 
331 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1077  aldo/keto reductase  39.58 
 
 
324 aa  218  8.999999999999998e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>