More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2297 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2297  aldo/keto reductase  100 
 
 
339 aa  697    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0919281  normal  0.745376 
 
 
-
 
NC_003296  RS03071  putative oxidoreductase protein  75.53 
 
 
334 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0520  aldo/keto reductase  72.67 
 
 
335 aa  483  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00146659  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4528  aldo/keto reductase  72.67 
 
 
335 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.153462  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5053  aldo/keto reductase  72.67 
 
 
335 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7188  aldo/keto reductase  65.56 
 
 
349 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3824  aldo/keto reductase  63.75 
 
 
339 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5659  aldo/keto reductase  62.24 
 
 
353 aa  428  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.184034  normal  0.516333 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  61.03 
 
 
337 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  62.16 
 
 
337 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0931  putative oxidoreductase (aldo/keto reductase)  59.82 
 
 
336 aa  421  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3731  aldo/keto reductase  59.52 
 
 
336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0880043 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2569  aldo/keto reductase  60.36 
 
 
359 aa  404  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2915  aldo/keto reductase  60.54 
 
 
337 aa  401  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5453  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  59.04 
 
 
335 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5007  aldo/keto reductase  58.38 
 
 
335 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5233  aldo/keto reductase  58.97 
 
 
349 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0927  aldo/keto reductase  62.54 
 
 
342 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.320709  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5927  aldo/keto oxidoreductase  58.61 
 
 
341 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2676  aldo/keto reductase  57.78 
 
 
336 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2353  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2542  aldo/keto reductase  58.08 
 
 
336 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3167  aldo/keto reductase  57.4 
 
 
354 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2514  aldo/keto reductase  57.4 
 
 
333 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3174  aldo/keto reductase  56.89 
 
 
336 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3469  aldo/keto reductase  57.1 
 
 
342 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0462  aldo/keto reductase  56.8 
 
 
333 aa  368  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147038  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1565  aldo/keto reductase  56.5 
 
 
332 aa  362  4e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.876817  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2439  putative aldo/keto reductase  44.27 
 
 
341 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  decreased coverage  0.000840189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  42.3 
 
 
340 aa  239  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  41.43 
 
 
343 aa  232  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  41.61 
 
 
343 aa  228  8e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  45.07 
 
 
322 aa  226  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  41.43 
 
 
343 aa  225  7e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  39.75 
 
 
333 aa  224  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  40 
 
 
332 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  40.31 
 
 
345 aa  223  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  38.8 
 
 
333 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  39.3 
 
 
349 aa  220  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  41.72 
 
 
333 aa  218  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  40.56 
 
 
348 aa  217  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  40.85 
 
 
315 aa  218  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  39.81 
 
 
325 aa  217  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5173  aldo/keto reductase  38.3 
 
 
345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
341 aa  212  5.999999999999999e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1049  aldo/keto reductase  38.18 
 
 
323 aa  212  9e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
313 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  40.51 
 
 
334 aa  210  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  40.26 
 
 
342 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  40.31 
 
 
344 aa  209  5e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  39.31 
 
 
349 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  39.1 
 
 
313 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  39.07 
 
 
341 aa  206  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  41.23 
 
 
341 aa  206  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  39.1 
 
 
313 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  39.34 
 
 
317 aa  205  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1473  aldo/keto reductase  42.9 
 
 
345 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0111458  normal  0.642292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6213  aldo/keto reductase  40.99 
 
 
344 aa  203  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  38.68 
 
 
331 aa  202  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  38.05 
 
 
331 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  38.11 
 
 
343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0585  aldo/keto reductase  40 
 
 
344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  35.17 
 
 
343 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  37.92 
 
 
338 aa  200  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3629  aldo/keto reductase  38.11 
 
 
344 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0520546 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1898  aldo/keto reductase  36.59 
 
 
332 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116625 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  39.67 
 
 
315 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0296  aldo/keto reductase  40.82 
 
 
338 aa  199  5e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  37.72 
 
 
334 aa  199  7e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  38.78 
 
 
313 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  38.6 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  38.91 
 
 
335 aa  196  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  37.54 
 
 
327 aa  196  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  38.06 
 
 
343 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1178  aldo/keto reductase  38.98 
 
 
353 aa  196  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3948  aldo/keto reductase  39.82 
 
 
357 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  38.04 
 
 
333 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  34.86 
 
 
343 aa  195  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  38.56 
 
 
332 aa  195  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  37.78 
 
 
309 aa  196  7e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0023  aldo/keto reductase  36.61 
 
 
339 aa  195  9e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  37.5 
 
 
344 aa  195  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0033  aldo/keto reductase  36.61 
 
 
339 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  37.96 
 
 
331 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0042  aldo/keto reductase  36.61 
 
 
339 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00274786 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  34.86 
 
 
343 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1541  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.86 
 
 
339 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  38.61 
 
 
352 aa  193  3e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  37.85 
 
 
352 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1650  aldo/keto reductase  36.86 
 
 
339 aa  193  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  36.54 
 
 
325 aa  193  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1722  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.98 
 
 
339 aa  193  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0414871  hitchhiker  0.00103465 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  35.91 
 
 
343 aa  192  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  37.39 
 
 
352 aa  192  7e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0928  aldo/keto reductase  38.68 
 
 
339 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339617  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  37.23 
 
 
352 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  36.31 
 
 
368 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  35.67 
 
 
354 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2653  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  36.91 
 
 
332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.481202  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1876  aldo/keto reductase  36.34 
 
 
342 aa  189  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1811  aldo/keto reductase  37.38 
 
 
316 aa  188  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>