More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0928 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0928  aldo/keto reductase  100 
 
 
339 aa  671    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339617  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0033  aldo/keto reductase  70.21 
 
 
339 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0042  aldo/keto reductase  70.21 
 
 
339 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00274786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0023  aldo/keto reductase  70.21 
 
 
339 aa  484  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  63.27 
 
 
343 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  63.74 
 
 
341 aa  406  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  53.87 
 
 
349 aa  351  8.999999999999999e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  54.71 
 
 
340 aa  349  4e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  54.84 
 
 
368 aa  339  4e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  52.19 
 
 
341 aa  335  7e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2439  putative aldo/keto reductase  53.91 
 
 
341 aa  335  7.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  decreased coverage  0.000840189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6197  aldo/keto reductase  52.21 
 
 
339 aa  333  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4232  aldo/keto reductase  53.94 
 
 
345 aa  333  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5173  aldo/keto reductase  52.02 
 
 
345 aa  318  1e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  52.74 
 
 
343 aa  317  1e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  51.47 
 
 
343 aa  313  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0266  aldo/keto reductase  51.3 
 
 
344 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  49.42 
 
 
348 aa  310  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  49.28 
 
 
349 aa  307  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  49.56 
 
 
344 aa  302  5.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  49.56 
 
 
342 aa  302  7.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6213  aldo/keto reductase  49.42 
 
 
344 aa  289  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0585  aldo/keto reductase  49.13 
 
 
344 aa  289  6e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  46.25 
 
 
333 aa  267  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  44.69 
 
 
333 aa  261  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3948  aldo/keto reductase  44.16 
 
 
357 aa  258  9e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0477  aldo/keto reductase  44.15 
 
 
348 aa  249  5e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1898  aldo/keto reductase  41.28 
 
 
332 aa  241  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116625 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0296  aldo/keto reductase  43.17 
 
 
338 aa  240  2.9999999999999997e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  42.94 
 
 
325 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  42.96 
 
 
329 aa  222  6e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  39.63 
 
 
338 aa  222  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  39.5 
 
 
317 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  42.17 
 
 
313 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  39.69 
 
 
358 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  40.19 
 
 
341 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  42.9 
 
 
349 aa  218  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  41.21 
 
 
313 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  38.94 
 
 
315 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  41.05 
 
 
353 aa  217  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  38.63 
 
 
325 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  43.04 
 
 
309 aa  216  5e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  41.43 
 
 
352 aa  216  5e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  41.77 
 
 
322 aa  215  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4175  aldo/keto reductase  41.14 
 
 
345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  39.75 
 
 
349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4826  aldo/keto reductase  41.14 
 
 
345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3340  aldo/keto reductase  41.14 
 
 
345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  40 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  41.07 
 
 
333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2914  aldo/keto reductase  39.71 
 
 
345 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5127  aldo/keto reductase  40.51 
 
 
345 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3890  aldo/keto reductase  41.98 
 
 
319 aa  212  7e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872462  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  41.03 
 
 
351 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  41.03 
 
 
351 aa  212  9e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  38.56 
 
 
332 aa  211  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  40.76 
 
 
313 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  41.03 
 
 
313 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  37.65 
 
 
334 aa  209  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  38.76 
 
 
334 aa  209  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  41.03 
 
 
351 aa  208  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  37.46 
 
 
334 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  38.65 
 
 
326 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  39.5 
 
 
345 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4529  aldo/keto reductase  39.26 
 
 
326 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  39.18 
 
 
349 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  39.18 
 
 
349 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5453  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40.69 
 
 
335 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0844  putative aldo/keto reductase  40.18 
 
 
326 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  0.025561 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4281  aldo/keto reductase  42.96 
 
 
317 aa  207  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198466  hitchhiker  0.0048015 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  40.5 
 
 
357 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1549  aldo/keto reductase  40.91 
 
 
326 aa  206  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.886416  normal  0.340196 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1464  aldo/keto reductase  39.01 
 
 
326 aa  206  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000207795  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2035  aldo/keto reductase  40.95 
 
 
341 aa  206  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.848931  hitchhiker  0.000622322 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  38.12 
 
 
346 aa  206  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  38.92 
 
 
344 aa  206  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7438  aldo/keto reductase  40.13 
 
 
360 aa  205  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.798482 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  37.65 
 
 
326 aa  205  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  39.13 
 
 
349 aa  206  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1178  aldo/keto reductase  39.42 
 
 
353 aa  205  9e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  36.98 
 
 
328 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4156  aldo/keto reductase  37.04 
 
 
335 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0249282  normal  0.138418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1656  aldo/keto reductase  39.43 
 
 
328 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.702563 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0069  aldo/keto reductase  44.95 
 
 
323 aa  204  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  37.57 
 
 
344 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4809  aldo/keto reductase  40.82 
 
 
330 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  39.44 
 
 
352 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  37.57 
 
 
389 aa  203  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  37.21 
 
 
344 aa  203  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1736  aldo/keto reductase  39.39 
 
 
378 aa  203  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
352 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11890  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  37.95 
 
 
342 aa  203  4e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.018283  normal  0.630679 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1794  aldo/keto reductase  38.1 
 
 
324 aa  202  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.81315 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  38.17 
 
 
345 aa  202  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0886  aldo/keto reductase  39.2 
 
 
324 aa  202  5e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.472535  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1849  aldo/keto reductase  39.39 
 
 
337 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0475646  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5007  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
335 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0524  aldo/keto reductase  37.93 
 
 
359 aa  202  7e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1746  putative oxidoreductase  39.82 
 
 
327 aa  202  9e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0734648  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>