More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3006 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3006  aldo/keto reductase  100 
 
 
327 aa  670    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.378905 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4200  aldo/keto reductase  58.82 
 
 
327 aa  406  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122481  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1620  aldo/keto reductase  59.2 
 
 
329 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.884834  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1813  aldo/keto reductase  57.98 
 
 
329 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0383943 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0086  voltage-dependent potassium channel, beta subunit  55.83 
 
 
332 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0643  aldo/keto reductase  57.33 
 
 
323 aa  368  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.671834  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04673  voltage-gated potassium channel beta subunit  54.86 
 
 
322 aa  355  3.9999999999999996e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3157  putative voltage-gated potassium channel, beta subunit  52.35 
 
 
323 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.350031 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5541  aldo/keto reductase  51.41 
 
 
323 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.675732 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2039  aldo/keto reductase family oxidoreductase  52.66 
 
 
323 aa  348  6e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2251  aldo/keto reductase  52.04 
 
 
323 aa  347  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2130  aldo/keto reductase  52.04 
 
 
323 aa  347  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.940949  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1392  aldo/keto reductase  52.35 
 
 
323 aa  345  6e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203744  hitchhiker  0.00446461 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0875  aldo/keto reductase family oxidoreductase  52.04 
 
 
323 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.73472  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1917  aldo/keto reductase family oxidoreductase  52.04 
 
 
323 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0019  aldo/keto reductase family oxidoreductase  52.04 
 
 
323 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322839  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0600  aldo/keto reductase family oxidoreductase  52.04 
 
 
323 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0504  aldo/keto reductase family oxidoreductase  52.04 
 
 
323 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0919  aldo/keto reductase family oxidoreductase  52.04 
 
 
323 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.146678  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1962  aldo/keto reductase  52.66 
 
 
323 aa  343  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.575618  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0838  aldo/keto reductase  52.76 
 
 
322 aa  342  5e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5864  aldo/keto reductase  49.84 
 
 
323 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1064  aldo/keto reductase  49.53 
 
 
323 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680696  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2213  aldo/keto reductase  49.84 
 
 
323 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2237  aldo/keto reductase  49.84 
 
 
323 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0618  aldo/keto reductase  51.71 
 
 
319 aa  333  2e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000265496  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1791  aldo/keto reductase  55.02 
 
 
321 aa  333  2e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1862  voltage-gated potassium channel beta subunit  54.37 
 
 
321 aa  331  8e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0604  aldo/keto reductase  51.4 
 
 
319 aa  332  8e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000106884  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0255  aldo/keto reductase family oxidoreductase  49.85 
 
 
330 aa  326  3e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0148  aldo/keto reductase  49.07 
 
 
319 aa  325  9e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00957933  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00610  VIC potassium ion channel, beta subunit (Eurofung)  47.77 
 
 
344 aa  321  9.999999999999999e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930439  normal  0.576143 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0809  aldo/keto reductase  47.2 
 
 
317 aa  317  2e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1455  aldo/keto reductase  47.8 
 
 
322 aa  316  3e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.138581  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03480  Voltage-gated potassium channel beta-2 subunit, putative  47.72 
 
 
355 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1811  aldo/keto reductase  45.51 
 
 
316 aa  293  3e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08597  VIC potassium ion channel, beta subunit (Eurofung)  46.36 
 
 
341 aa  288  8e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  43.12 
 
 
315 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  43.03 
 
 
315 aa  279  4e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1687  aldo/keto reductase  45.6 
 
 
310 aa  278  7e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  42.59 
 
 
322 aa  271  8.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0379  aldo/keto reductase  41.38 
 
 
314 aa  267  2e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0161187  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2158  aldo/keto reductase  44.31 
 
 
321 aa  260  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0782  aldo/keto reductase  42.63 
 
 
318 aa  259  3e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.16349  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  42.55 
 
 
317 aa  257  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0869  putative oxidoreductase  44.88 
 
 
325 aa  251  1e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  42.26 
 
 
333 aa  251  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2653  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  41.25 
 
 
332 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.481202  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  40.54 
 
 
334 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2390  aldo/keto reductase  40.74 
 
 
336 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000519885  hitchhiker  0.000458148 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10590  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  40.19 
 
 
331 aa  241  7.999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.244513 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  39.69 
 
 
333 aa  241  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  40.31 
 
 
332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1462  aldo/keto reductase  39.44 
 
 
333 aa  239  4e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2023  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
337 aa  239  4e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0725313  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1857  aldo/keto reductase  40.31 
 
 
333 aa  239  5.999999999999999e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3542  aldo/keto reductase  39.82 
 
 
332 aa  238  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3949  aldo/keto reductase  40.85 
 
 
334 aa  237  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11890  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  40.06 
 
 
342 aa  237  2e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.018283  normal  0.630679 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  40.06 
 
 
334 aa  236  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2535  aldo/keto reductase  39.09 
 
 
329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00875609  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3310  aldo/keto reductase  39.33 
 
 
332 aa  233  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108449  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3746  aldo/keto reductase  38.72 
 
 
334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1360  aldo/keto reductase  37.92 
 
 
328 aa  232  6e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2751  aldo/keto family dehydrogenase  38.15 
 
 
329 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178849 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3351  aldo/keto reductase  38.41 
 
 
327 aa  230  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15540  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  38.7 
 
 
337 aa  229  6e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3124  aldo/keto reductase  37.5 
 
 
321 aa  229  7e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.188754  normal  0.840561 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  42.11 
 
 
351 aa  228  8e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28620  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  38.53 
 
 
334 aa  226  3e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2949  aldo/keto reductase  39.47 
 
 
336 aa  226  3e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1879  aldo/keto reductase  37.61 
 
 
338 aa  226  6e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2987  aldo/keto reductase  38.3 
 
 
336 aa  225  7e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2071  aldo/keto reductase  39.38 
 
 
316 aa  225  8e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0765419  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3265  aldo/keto reductase  37.8 
 
 
336 aa  225  9e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0553  aldo/keto reductase  39.44 
 
 
324 aa  224  1e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0909264 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0539  aldo/keto reductase  39.44 
 
 
324 aa  224  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2676  aldo/keto reductase  40.92 
 
 
336 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2353  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1794  aldo/keto reductase  37.31 
 
 
324 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.81315 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2542  aldo/keto reductase  40.92 
 
 
336 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3174  aldo/keto reductase  40.62 
 
 
336 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4156  aldo/keto reductase  38.87 
 
 
335 aa  222  8e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0249282  normal  0.138418 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2915  aldo/keto reductase  38.56 
 
 
337 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3154  aldo/keto reductase  38.14 
 
 
335 aa  215  8e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  39.64 
 
 
349 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  39.64 
 
 
349 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5007  aldo/keto reductase  37.69 
 
 
335 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5453  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  37.38 
 
 
335 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  37.08 
 
 
333 aa  211  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  37.13 
 
 
346 aa  209  5e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  37.42 
 
 
325 aa  209  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
348 aa  209  6e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  36.17 
 
 
333 aa  208  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  36.28 
 
 
316 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  37.93 
 
 
352 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  39.4 
 
 
349 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  37.19 
 
 
341 aa  202  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  37.65 
 
 
349 aa  202  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1049  aldo/keto reductase  37.42 
 
 
323 aa  202  6e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1275  aldo/keto reductase  36.39 
 
 
315 aa  202  7e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.13271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>