More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1862 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1862  voltage-gated potassium channel beta subunit  100 
 
 
321 aa  658    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1791  aldo/keto reductase  98.75 
 
 
321 aa  652    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04673  voltage-gated potassium channel beta subunit  74.06 
 
 
322 aa  485  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0643  aldo/keto reductase  72.05 
 
 
323 aa  475  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.671834  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4200  aldo/keto reductase  57.32 
 
 
327 aa  361  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122481  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1620  aldo/keto reductase  59.21 
 
 
329 aa  360  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.884834  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1813  aldo/keto reductase  58.88 
 
 
329 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0383943 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3006  aldo/keto reductase  54.37 
 
 
327 aa  347  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.378905 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0086  voltage-dependent potassium channel, beta subunit  51.7 
 
 
332 aa  331  1e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0875  aldo/keto reductase family oxidoreductase  54.05 
 
 
323 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.73472  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1917  aldo/keto reductase family oxidoreductase  54.05 
 
 
323 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0019  aldo/keto reductase family oxidoreductase  54.05 
 
 
323 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322839  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0600  aldo/keto reductase family oxidoreductase  54.05 
 
 
323 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0504  aldo/keto reductase family oxidoreductase  54.05 
 
 
323 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0919  aldo/keto reductase family oxidoreductase  54.05 
 
 
323 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.146678  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1392  aldo/keto reductase  53.72 
 
 
323 aa  328  6e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203744  hitchhiker  0.00446461 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2039  aldo/keto reductase family oxidoreductase  54.69 
 
 
323 aa  328  7e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5864  aldo/keto reductase  52.65 
 
 
323 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2130  aldo/keto reductase  52.65 
 
 
323 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.940949  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1962  aldo/keto reductase  52.35 
 
 
323 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.575618  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2251  aldo/keto reductase  52.65 
 
 
323 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2237  aldo/keto reductase  52.34 
 
 
323 aa  326  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1064  aldo/keto reductase  53.58 
 
 
323 aa  326  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680696  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2213  aldo/keto reductase  52.34 
 
 
323 aa  326  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3157  putative voltage-gated potassium channel, beta subunit  53.07 
 
 
323 aa  325  5e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.350031 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5541  aldo/keto reductase  53.07 
 
 
323 aa  324  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.675732 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0255  aldo/keto reductase family oxidoreductase  53.65 
 
 
330 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0838  aldo/keto reductase  46.6 
 
 
322 aa  301  1e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0148  aldo/keto reductase  49.03 
 
 
319 aa  295  8e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00957933  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0809  aldo/keto reductase  47.4 
 
 
317 aa  294  1e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1455  aldo/keto reductase  50.33 
 
 
322 aa  289  4e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.138581  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0604  aldo/keto reductase  44.89 
 
 
319 aa  280  3e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000106884  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1811  aldo/keto reductase  47.68 
 
 
316 aa  280  3e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0618  aldo/keto reductase  44.89 
 
 
319 aa  280  3e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000265496  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03480  Voltage-gated potassium channel beta-2 subunit, putative  43.56 
 
 
355 aa  277  2e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00610  VIC potassium ion channel, beta subunit (Eurofung)  43.43 
 
 
344 aa  267  2e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930439  normal  0.576143 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  42.95 
 
 
315 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1687  aldo/keto reductase  44.41 
 
 
310 aa  264  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  42.43 
 
 
315 aa  263  4e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  44.41 
 
 
322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0782  aldo/keto reductase  44.12 
 
 
318 aa  249  3e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.16349  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0379  aldo/keto reductase  42.9 
 
 
314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0161187  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  40.32 
 
 
317 aa  236  3e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2158  aldo/keto reductase  43.23 
 
 
321 aa  235  7e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  43.55 
 
 
333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2653  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  41.1 
 
 
332 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.481202  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  43.69 
 
 
334 aa  230  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0553  aldo/keto reductase  42.36 
 
 
324 aa  228  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0909264 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0539  aldo/keto reductase  42.36 
 
 
324 aa  228  1e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  40.55 
 
 
332 aa  228  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  42.24 
 
 
334 aa  226  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08597  VIC potassium ion channel, beta subunit (Eurofung)  41.77 
 
 
341 aa  226  4e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  41.18 
 
 
316 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3124  aldo/keto reductase  41.9 
 
 
321 aa  225  7e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.188754  normal  0.840561 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1794  aldo/keto reductase  42.07 
 
 
324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.81315 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11890  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  43.17 
 
 
342 aa  218  1e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.018283  normal  0.630679 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  41.88 
 
 
333 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0869  putative oxidoreductase  40.99 
 
 
325 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10590  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  39.69 
 
 
331 aa  211  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.244513 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3351  aldo/keto reductase  41.19 
 
 
327 aa  208  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3542  aldo/keto reductase  39.88 
 
 
332 aa  206  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15540  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  40.45 
 
 
337 aa  206  6e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2751  aldo/keto family dehydrogenase  37.5 
 
 
329 aa  205  8e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178849 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2390  aldo/keto reductase  39.81 
 
 
336 aa  205  9e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000519885  hitchhiker  0.000458148 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2071  aldo/keto reductase  38.99 
 
 
316 aa  204  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0765419  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21730  Oxidoreductase aldo/keto reductase family  41.49 
 
 
347 aa  203  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4156  aldo/keto reductase  39.38 
 
 
335 aa  203  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0249282  normal  0.138418 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1879  aldo/keto reductase  40.59 
 
 
338 aa  202  8e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2023  aldo/keto reductase  41.69 
 
 
337 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0725313  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2949  aldo/keto reductase  41.97 
 
 
336 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3949  aldo/keto reductase  36.75 
 
 
334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1462  aldo/keto reductase  38.61 
 
 
333 aa  200  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1360  aldo/keto reductase  38.46 
 
 
328 aa  200  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3310  aldo/keto reductase  38.97 
 
 
332 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108449  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  39.63 
 
 
345 aa  199  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1857  aldo/keto reductase  40.45 
 
 
333 aa  199  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2987  aldo/keto reductase  39.75 
 
 
336 aa  199  7e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2535  aldo/keto reductase  36.86 
 
 
329 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00875609  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3174  aldo/keto reductase  38.97 
 
 
336 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2676  aldo/keto reductase  38.97 
 
 
336 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2353  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3746  aldo/keto reductase  38.66 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2915  aldo/keto reductase  37.59 
 
 
337 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28620  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  38.92 
 
 
334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0554  aldo/keto reductase  36.25 
 
 
329 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  36.54 
 
 
327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5453  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  36.94 
 
 
335 aa  196  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2542  aldo/keto reductase  38.97 
 
 
336 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3154  aldo/keto reductase  39.17 
 
 
335 aa  195  8.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0252  aldo/keto reductase  40 
 
 
345 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0880  aldo/keto reductase  39.34 
 
 
347 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0355  aldo/keto reductase  38.39 
 
 
347 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  37.85 
 
 
340 aa  192  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5007  aldo/keto reductase  36.62 
 
 
335 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  37.77 
 
 
351 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  37.54 
 
 
349 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  38.26 
 
 
326 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4367  putative aldo/keto reductase  37.74 
 
 
347 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5157  hypothetical protein  37.86 
 
 
347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136679  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0093  aldo/keto reductase  39.48 
 
 
347 aa  189  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112545 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  38.92 
 
 
350 aa  189  5e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>