More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0093 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0093  aldo/keto reductase  100 
 
 
347 aa  708    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112545 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0355  aldo/keto reductase  75.5 
 
 
347 aa  559  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0252  aldo/keto reductase  77.55 
 
 
345 aa  557  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0351  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  77.78 
 
 
345 aa  552  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4367  putative aldo/keto reductase  74.93 
 
 
347 aa  553  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4823  aldo/keto reductase  77.49 
 
 
345 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0342  aldo/keto reductase  76.16 
 
 
348 aa  547  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422815  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0082  aldo/keto reductase  73.2 
 
 
347 aa  549  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21730  Oxidoreductase aldo/keto reductase family  74.86 
 
 
347 aa  545  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3688  aldo/keto reductase  75.58 
 
 
348 aa  537  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3074  aldo/keto reductase  76.66 
 
 
347 aa  534  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.395934 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3095  aldo/keto reductase  75.5 
 
 
347 aa  527  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2345  aldo/keto reductase  75.65 
 
 
346 aa  529  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.172822 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3125  aldo/keto reductase  75.79 
 
 
347 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2988  aldo/keto reductase  75.79 
 
 
347 aa  529  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378193  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3266  aldo/keto reductase family oxidoreductase  74.64 
 
 
347 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0400  aldo/keto reductase family oxidoreductase  74.64 
 
 
347 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6427  aldo/keto reductase  74.93 
 
 
347 aa  526  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0178  aldo/keto reductase family oxidoreductase  75.29 
 
 
347 aa  527  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2463  aldo/keto reductase  75.22 
 
 
347 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3077  aldo/keto reductase  75.22 
 
 
347 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2929  aldo/keto reductase family oxidoreductase  74.64 
 
 
379 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2160  aldo/keto reductase family oxidoreductase  74.64 
 
 
347 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0203  aldo/keto reductase family oxidoreductase  74.64 
 
 
379 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0216  aldo/keto reductase family oxidoreductase  74.64 
 
 
379 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3418  aldo/keto reductase family oxidoreductase  73.78 
 
 
343 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51520  Aldo/keto reductase  73.91 
 
 
347 aa  513  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5157  hypothetical protein  70.93 
 
 
347 aa  510  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136679  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1715  aldo/keto reductase  65.89 
 
 
341 aa  479  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.734066  normal  0.168064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3408  aldo/keto reductase  68.34 
 
 
345 aa  471  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.299651  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1278  aldo/keto reductase  67.44 
 
 
369 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2293  oxidoreductase  67.64 
 
 
360 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0207177  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3410  aldo-keto reductase  65.51 
 
 
346 aa  469  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3287  aldo-keto reductase  65.22 
 
 
346 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02876  aldo-keto reductase  65.22 
 
 
346 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0696  aldo/keto reductase  65.22 
 
 
346 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3470  aldo-keto reductase  64.93 
 
 
346 aa  464  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3180  aldo-keto reductase  65.22 
 
 
346 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0693  aldo-keto reductase  65.22 
 
 
346 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02826  hypothetical protein  65.22 
 
 
346 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4313  aldo-keto reductase  64.93 
 
 
346 aa  465  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1282  aldo/keto reductase  64.22 
 
 
352 aa  462  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0039468 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0850  aldo/keto reductase  65.09 
 
 
344 aa  457  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3430  aldo-keto reductase  64.35 
 
 
346 aa  460  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3871  aldo/keto reductase  66.86 
 
 
343 aa  449  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.532554  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1595  aldo/keto reductase  64.22 
 
 
349 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.14436 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2149  aldo/keto reductase  64.53 
 
 
342 aa  446  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.36269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8949  hypothetical protein  63.42 
 
 
342 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0880  aldo/keto reductase  63.22 
 
 
347 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2692  aldo/keto reductase  64.04 
 
 
356 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225464  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2615  aldo/keto reductase  61.85 
 
 
346 aa  430  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0325741 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6900  aldo/keto reductase  65.35 
 
 
338 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0960645  normal  0.0649561 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2906  aldo/keto reductase  61.74 
 
 
345 aa  425  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.520305  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1363  aldo/keto reductase  62.65 
 
 
332 aa  426  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00176374  normal  0.576313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2662  aldo/keto reductase  63.74 
 
 
356 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.441037  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0448  aldo/keto reductase  60.7 
 
 
348 aa  422  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2707  aldo/keto reductase  63.74 
 
 
356 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0109998 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3836  aldo/keto reductase  64.13 
 
 
331 aa  419  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2259  aldo/keto reductase  64.05 
 
 
336 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0691093 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1721  aldo/keto reductase  60.77 
 
 
342 aa  415  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.361877  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5157  aldo/keto reductase  59.29 
 
 
344 aa  412  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0024376  decreased coverage  0.000123461 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2330  aldo/keto reductase  59.88 
 
 
343 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720042  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0572  aldo/keto reductase  59.45 
 
 
331 aa  409  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2091  aldo/keto reductase  60.77 
 
 
343 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0649423  normal  0.375082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2432  aldo/keto reductase  62.39 
 
 
330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.060631  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06120  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  59.54 
 
 
349 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.277345  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2549  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  62.5 
 
 
332 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935137  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2640  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  62.8 
 
 
332 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2598  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  62.8 
 
 
332 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2408  hypothetical protein  58.11 
 
 
343 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2664  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  62.5 
 
 
332 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.926167 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2770  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  62.2 
 
 
332 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1072  aldo/keto reductase  63.33 
 
 
329 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0377  aldo/keto reductase  60 
 
 
353 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.877145  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2985  aldo/keto reductase  60.7 
 
 
346 aa  395  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0962  aldo/keto reductase  62.69 
 
 
331 aa  396  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0209073 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3413  aldo/keto reductase  59.45 
 
 
329 aa  391  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2921  aldo/keto reductase  59.45 
 
 
330 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.151764  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6178  aldo/keto reductase  62.54 
 
 
326 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0677  aldo/keto reductase  59.64 
 
 
349 aa  394  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.524365  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0463  aldo/keto reductase  58.55 
 
 
348 aa  393  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5588  aldo/keto reductase  59.33 
 
 
331 aa  389  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.142249  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2232  aldo/keto reductase  55.96 
 
 
338 aa  388  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.342948  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2924  aldo/keto reductase  60.06 
 
 
332 aa  390  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0239351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3250  aldo/keto reductase  59.94 
 
 
337 aa  388  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1329  aldo/keto reductase family oxidoreductase  60.37 
 
 
329 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216615  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2731  aldo/keto reductase family oxidoreductase  60.06 
 
 
329 aa  385  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.93027  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2077  aldo/keto reductase  58.1 
 
 
333 aa  386  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.97994  normal  0.282857 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23010  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  58.72 
 
 
347 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.223741 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1441  aldo/keto reductase  60.06 
 
 
329 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0554  aldo/keto reductase  56.88 
 
 
329 aa  383  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0803  aldo/keto reductase  59.88 
 
 
337 aa  382  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1315  aryl-alcohol dehydrogenase  56.67 
 
 
335 aa  376  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.337911  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4960  aldo/keto reductase  56.78 
 
 
318 aa  372  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0422  aldo/keto reductase  55.84 
 
 
328 aa  369  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2078  aldo/keto reductase  59.2 
 
 
330 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2657  aldo/keto reductase  56.4 
 
 
330 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0157  Aryl-alcohol dehydrogenase related enzyme  53.68 
 
 
338 aa  364  1e-99  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1527  aldo/keto reductase  55.45 
 
 
329 aa  354  1e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.137113  normal  0.101936 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2248  aryl-alcohol dehydrogenase family oxidoreductase  57.53 
 
 
334 aa  349  5e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>