More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3351 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3351  aldo/keto reductase  100 
 
 
327 aa  663    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2653  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  76 
 
 
332 aa  512  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.481202  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  75.23 
 
 
333 aa  497  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1360  aldo/keto reductase  72.62 
 
 
328 aa  491  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2987  aldo/keto reductase  74.23 
 
 
336 aa  491  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10590  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  72.48 
 
 
331 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.244513 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  72.62 
 
 
332 aa  484  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1857  aldo/keto reductase  73.31 
 
 
333 aa  482  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2949  aldo/keto reductase  72.87 
 
 
336 aa  476  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28620  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  72.09 
 
 
334 aa  471  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3310  aldo/keto reductase  70.46 
 
 
332 aa  471  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108449  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3542  aldo/keto reductase  69.54 
 
 
332 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3124  aldo/keto reductase  71.56 
 
 
321 aa  468  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.188754  normal  0.840561 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2023  aldo/keto reductase  70.99 
 
 
337 aa  468  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0725313  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3154  aldo/keto reductase  73.01 
 
 
335 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15540  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  70.37 
 
 
337 aa  465  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2390  aldo/keto reductase  70.03 
 
 
336 aa  461  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000519885  hitchhiker  0.000458148 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1462  aldo/keto reductase  69.23 
 
 
333 aa  461  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1794  aldo/keto reductase  70.19 
 
 
324 aa  461  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.81315 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1879  aldo/keto reductase  71.91 
 
 
338 aa  459  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3746  aldo/keto reductase  68.1 
 
 
334 aa  460  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  67.99 
 
 
333 aa  457  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3265  aldo/keto reductase  68.2 
 
 
336 aa  453  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3949  aldo/keto reductase  68.71 
 
 
334 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4156  aldo/keto reductase  69.23 
 
 
335 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0249282  normal  0.138418 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  67.07 
 
 
334 aa  448  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  68.18 
 
 
334 aa  447  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11890  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  63.86 
 
 
342 aa  429  1e-119  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.018283  normal  0.630679 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2535  aldo/keto reductase  62.01 
 
 
329 aa  430  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00875609  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2751  aldo/keto family dehydrogenase  61.7 
 
 
329 aa  430  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178849 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  57.37 
 
 
322 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  53.02 
 
 
315 aa  346  3e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  49.68 
 
 
315 aa  335  7.999999999999999e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  52.65 
 
 
316 aa  325  5e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2071  aldo/keto reductase  50.63 
 
 
316 aa  311  7.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0765419  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  47.45 
 
 
317 aa  308  5.9999999999999995e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1275  aldo/keto reductase  49.84 
 
 
315 aa  293  4e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.13271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1687  aldo/keto reductase  48.73 
 
 
310 aa  292  6e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0379  aldo/keto reductase  45.57 
 
 
314 aa  272  6e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0161187  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0838  aldo/keto reductase  43.73 
 
 
322 aa  263  4e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1811  aldo/keto reductase  42.32 
 
 
316 aa  263  4e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0869  putative oxidoreductase  43.53 
 
 
325 aa  261  1e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0782  aldo/keto reductase  43.75 
 
 
318 aa  259  5.0000000000000005e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.16349  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2158  aldo/keto reductase  44.51 
 
 
321 aa  249  6e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0604  aldo/keto reductase  42.02 
 
 
319 aa  248  1e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000106884  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0618  aldo/keto reductase  42.02 
 
 
319 aa  247  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000265496  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0086  voltage-dependent potassium channel, beta subunit  44.14 
 
 
332 aa  246  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0148  aldo/keto reductase  44.48 
 
 
319 aa  245  8e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00957933  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1813  aldo/keto reductase  43.12 
 
 
329 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0383943 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1620  aldo/keto reductase  42.51 
 
 
329 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.884834  normal  0.762073 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00610  VIC potassium ion channel, beta subunit (Eurofung)  41.12 
 
 
344 aa  236  5.0000000000000005e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930439  normal  0.576143 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5541  aldo/keto reductase  43.33 
 
 
323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.675732 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0809  aldo/keto reductase  40.46 
 
 
317 aa  233  3e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2130  aldo/keto reductase  44.41 
 
 
323 aa  232  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.940949  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2251  aldo/keto reductase  44.41 
 
 
323 aa  231  9e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1064  aldo/keto reductase  43.64 
 
 
323 aa  230  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680696  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3006  aldo/keto reductase  38.41 
 
 
327 aa  230  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.378905 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5864  aldo/keto reductase  43.56 
 
 
323 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2237  aldo/keto reductase  43.25 
 
 
323 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2213  aldo/keto reductase  43.25 
 
 
323 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4200  aldo/keto reductase  43.99 
 
 
327 aa  226  4e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122481  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3157  putative voltage-gated potassium channel, beta subunit  41.72 
 
 
323 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.350031 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1392  aldo/keto reductase  41.8 
 
 
323 aa  225  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203744  hitchhiker  0.00446461 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03480  Voltage-gated potassium channel beta-2 subunit, putative  40.36 
 
 
355 aa  224  2e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1917  aldo/keto reductase family oxidoreductase  43.08 
 
 
323 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2039  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.77 
 
 
323 aa  223  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  41.88 
 
 
352 aa  222  6e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04673  voltage-gated potassium channel beta subunit  42.15 
 
 
322 aa  222  7e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  42.77 
 
 
353 aa  222  8e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  43.96 
 
 
339 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  43.96 
 
 
339 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0875  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.77 
 
 
323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.73472  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0255  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.6 
 
 
330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0019  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.77 
 
 
323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322839  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0919  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.77 
 
 
323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.146678  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  41.18 
 
 
332 aa  219  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0600  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.77 
 
 
323 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0504  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.77 
 
 
323 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0643  aldo/keto reductase  42.28 
 
 
323 aa  220  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.671834  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  39.44 
 
 
350 aa  219  5e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  40.3 
 
 
336 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1282  aldo/keto reductase  43.71 
 
 
352 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0039468 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1962  aldo/keto reductase  41.46 
 
 
323 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.575618  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08597  VIC potassium ion channel, beta subunit (Eurofung)  40.12 
 
 
341 aa  216  4e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  39.7 
 
 
338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  39.25 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2149  aldo/keto reductase  42.5 
 
 
342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.36269 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  40.19 
 
 
331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  40.95 
 
 
313 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0553  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
324 aa  211  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0909264 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  39.56 
 
 
331 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  39.17 
 
 
313 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0539  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
324 aa  211  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  40.31 
 
 
333 aa  210  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  40.37 
 
 
331 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  40.5 
 
 
343 aa  210  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  39.49 
 
 
313 aa  210  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3210  aldo/keto reductase  38.04 
 
 
342 aa  210  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0255002 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2078  aldo/keto reductase  42.5 
 
 
330 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  39.49 
 
 
313 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>