More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2987 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2987  aldo/keto reductase  100 
 
 
336 aa  691    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3265  aldo/keto reductase  80.54 
 
 
336 aa  563  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2949  aldo/keto reductase  78.27 
 
 
336 aa  545  1e-154  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15540  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  76.35 
 
 
337 aa  539  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1879  aldo/keto reductase  77.48 
 
 
338 aa  536  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2023  aldo/keto reductase  73.05 
 
 
337 aa  518  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0725313  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3746  aldo/keto reductase  73.73 
 
 
334 aa  520  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28620  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  74.55 
 
 
334 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3949  aldo/keto reductase  72.24 
 
 
334 aa  513  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2390  aldo/keto reductase  71.26 
 
 
336 aa  501  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000519885  hitchhiker  0.000458148 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3154  aldo/keto reductase  71.73 
 
 
335 aa  495  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3351  aldo/keto reductase  74.23 
 
 
327 aa  491  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1462  aldo/keto reductase  70.71 
 
 
333 aa  489  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  69.55 
 
 
333 aa  481  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3542  aldo/keto reductase  68.86 
 
 
332 aa  479  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10590  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  70.55 
 
 
331 aa  479  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.244513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3310  aldo/keto reductase  69.16 
 
 
332 aa  479  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108449  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1360  aldo/keto reductase  69.42 
 
 
328 aa  468  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  67.26 
 
 
334 aa  464  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1857  aldo/keto reductase  68.06 
 
 
333 aa  464  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2653  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  70.15 
 
 
332 aa  467  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.481202  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  67.16 
 
 
332 aa  456  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  66.97 
 
 
333 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4156  aldo/keto reductase  66.57 
 
 
335 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0249282  normal  0.138418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1794  aldo/keto reductase  68.21 
 
 
324 aa  448  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.81315 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3124  aldo/keto reductase  67.08 
 
 
321 aa  436  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.188754  normal  0.840561 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  64.74 
 
 
334 aa  424  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11890  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  60.96 
 
 
342 aa  407  1.0000000000000001e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.018283  normal  0.630679 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2751  aldo/keto family dehydrogenase  56.84 
 
 
329 aa  394  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178849 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2535  aldo/keto reductase  57.45 
 
 
329 aa  392  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00875609  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  56.39 
 
 
322 aa  362  3e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  53.25 
 
 
316 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  50 
 
 
315 aa  325  8.000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  50.47 
 
 
315 aa  325  9e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  47.78 
 
 
317 aa  297  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1275  aldo/keto reductase  46.86 
 
 
315 aa  297  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.13271 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2071  aldo/keto reductase  48.75 
 
 
316 aa  290  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0765419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1687  aldo/keto reductase  43.67 
 
 
310 aa  271  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0379  aldo/keto reductase  42.45 
 
 
314 aa  261  1e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0161187  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0086  voltage-dependent potassium channel, beta subunit  44.17 
 
 
332 aa  257  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0838  aldo/keto reductase  42.64 
 
 
322 aa  257  2e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1811  aldo/keto reductase  40.37 
 
 
316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0869  putative oxidoreductase  43.12 
 
 
325 aa  252  6e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0782  aldo/keto reductase  42.24 
 
 
318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.16349  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2251  aldo/keto reductase  43.29 
 
 
323 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2130  aldo/keto reductase  43.29 
 
 
323 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.940949  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1620  aldo/keto reductase  41.21 
 
 
329 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.884834  normal  0.762073 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0148  aldo/keto reductase  41.91 
 
 
319 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00957933  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5541  aldo/keto reductase  43.12 
 
 
323 aa  235  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.675732 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2158  aldo/keto reductase  42.68 
 
 
321 aa  235  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1813  aldo/keto reductase  41.21 
 
 
329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0383943 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5864  aldo/keto reductase  42.07 
 
 
323 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4200  aldo/keto reductase  41.83 
 
 
327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122481  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0618  aldo/keto reductase  38.27 
 
 
319 aa  233  5e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000265496  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0604  aldo/keto reductase  38.27 
 
 
319 aa  233  5e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000106884  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1064  aldo/keto reductase  41.9 
 
 
323 aa  232  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0680696  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2237  aldo/keto reductase  41.77 
 
 
323 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2213  aldo/keto reductase  41.77 
 
 
323 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3157  putative voltage-gated potassium channel, beta subunit  40.85 
 
 
323 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.350031 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1917  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.67 
 
 
323 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1392  aldo/keto reductase  40.12 
 
 
323 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203744  hitchhiker  0.00446461 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0600  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.37 
 
 
323 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0504  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.37 
 
 
323 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0875  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.37 
 
 
323 aa  225  6e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.73472  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0019  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.37 
 
 
323 aa  225  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322839  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0919  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.37 
 
 
323 aa  225  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.146678  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3006  aldo/keto reductase  38.3 
 
 
327 aa  225  7e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.378905 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1962  aldo/keto reductase  39.45 
 
 
323 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.575618  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0255  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.14 
 
 
330 aa  224  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.249154 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0809  aldo/keto reductase  38.49 
 
 
317 aa  223  3e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2039  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.55 
 
 
323 aa  222  6e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  40.92 
 
 
353 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0693  aldo/keto reductase  42.2 
 
 
338 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
352 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  41.05 
 
 
340 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00610  VIC potassium ion channel, beta subunit (Eurofung)  38.64 
 
 
344 aa  215  9e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.930439  normal  0.576143 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03480  Voltage-gated potassium channel beta-2 subunit, putative  37.5 
 
 
355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  40.74 
 
 
339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  40.74 
 
 
339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2078  aldo/keto reductase  40.99 
 
 
330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  41.36 
 
 
352 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04673  voltage-gated potassium channel beta subunit  41.29 
 
 
322 aa  212  7e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3210  aldo/keto reductase  39.59 
 
 
342 aa  211  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0255002 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  40.12 
 
 
338 aa  211  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  40.12 
 
 
338 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  41.91 
 
 
332 aa  210  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  38.87 
 
 
337 aa  210  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0448  aldo/keto reductase  38.75 
 
 
348 aa  210  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  40.62 
 
 
343 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  40.18 
 
 
349 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  40.18 
 
 
349 aa  210  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  36.76 
 
 
325 aa  209  6e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  40.87 
 
 
349 aa  209  7e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1721  aldo/keto reductase  37.3 
 
 
342 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.361877  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  39.45 
 
 
370 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  38.04 
 
 
346 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  36.31 
 
 
326 aa  206  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  38.56 
 
 
313 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  39.88 
 
 
343 aa  206  6e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  37.81 
 
 
326 aa  205  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>