More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6159 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6159  aldo/keto reductase  100 
 
 
317 aa  641    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145044  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0458  aldo/keto reductase  87.94 
 
 
317 aa  572  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4281  aldo/keto reductase  63.14 
 
 
317 aa  386  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198466  hitchhiker  0.0048015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3890  aldo/keto reductase  63.23 
 
 
319 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872462  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4073  aldo/keto reductase  62.38 
 
 
311 aa  371  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.492904 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0069  aldo/keto reductase  62.18 
 
 
323 aa  364  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6154  aldo/keto reductase  58.6 
 
 
316 aa  359  3e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.775736  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5072  aldo/keto reductase  57.91 
 
 
325 aa  358  7e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1876  aldo/keto reductase  58.33 
 
 
317 aa  344  1e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0609138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4777  aldo/keto reductase  56.37 
 
 
321 aa  328  6e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1649  aldo/keto reductase  55.56 
 
 
325 aa  328  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.328017  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1641  aldo/keto reductase  54.43 
 
 
325 aa  321  9.999999999999999e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000385668 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  54.02 
 
 
309 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  51.58 
 
 
313 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1691  aldo/keto reductase  54.55 
 
 
336 aa  312  3.9999999999999997e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0210969 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  50.32 
 
 
313 aa  308  9e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  49.84 
 
 
313 aa  306  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  50.64 
 
 
313 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13010  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  56.15 
 
 
324 aa  298  6e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118581  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10970  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  53.92 
 
 
327 aa  296  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0410  aldo/keto reductase  49.07 
 
 
320 aa  277  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213987  normal  0.0921299 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3670  aldo/keto reductase  48.24 
 
 
311 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  43.65 
 
 
325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  44 
 
 
349 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  42.09 
 
 
349 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1049  aldo/keto reductase  39.42 
 
 
323 aa  221  9e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  41.46 
 
 
352 aa  216  4e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  41.03 
 
 
335 aa  215  7e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  42.38 
 
 
348 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  40.67 
 
 
341 aa  215  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0585  aldo/keto reductase  40.79 
 
 
344 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6213  aldo/keto reductase  40.79 
 
 
344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.344018 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  42.95 
 
 
343 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  40 
 
 
344 aa  212  7.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  40.91 
 
 
334 aa  210  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  41.14 
 
 
325 aa  210  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  38.23 
 
 
343 aa  210  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  40.43 
 
 
352 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  40.18 
 
 
345 aa  209  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  39.63 
 
 
349 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  40.54 
 
 
349 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  39.44 
 
 
352 aa  207  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  39.69 
 
 
354 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  39.56 
 
 
328 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3286  aldo/keto reductase  41.19 
 
 
323 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.278509 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3487  aldo/keto reductase  44.83 
 
 
341 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  42.03 
 
 
332 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2915  aldo/keto reductase  40 
 
 
337 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
353 aa  206  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4803  aldo/keto reductase  38.77 
 
 
329 aa  206  4e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  40.3 
 
 
338 aa  206  5e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  39.82 
 
 
348 aa  205  6e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  39.14 
 
 
355 aa  206  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3379  aldo/keto reductase  42.67 
 
 
325 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6197  aldo/keto reductase  40.12 
 
 
339 aa  203  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  43.17 
 
 
339 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  43.17 
 
 
339 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  38.2 
 
 
344 aa  202  4e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2012  aldo/keto reductase  39.13 
 
 
328 aa  202  5e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  38.2 
 
 
389 aa  202  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  40.88 
 
 
343 aa  202  6e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  41.23 
 
 
332 aa  202  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  40.78 
 
 
352 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  39.33 
 
 
344 aa  202  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2303  aldo/keto reductase  43.28 
 
 
344 aa  201  9e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  39.35 
 
 
333 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  38.91 
 
 
350 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  38.51 
 
 
344 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  39.54 
 
 
326 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  41.74 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  36.12 
 
 
347 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  41.74 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  40.61 
 
 
342 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5690  aldo/keto reductase  40.97 
 
 
326 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0442358  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  38.2 
 
 
326 aa  200  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  38.41 
 
 
344 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  40.43 
 
 
344 aa  200  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0084  aldo/keto reductase  40.38 
 
 
328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0322052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  40.92 
 
 
340 aa  199  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  38.48 
 
 
338 aa  199  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  36.78 
 
 
343 aa  199  6e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  38.51 
 
 
351 aa  199  7e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  41.38 
 
 
333 aa  199  7e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  41.14 
 
 
342 aa  199  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
337 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5453  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  38.1 
 
 
335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2653  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40.44 
 
 
332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.481202  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1975  aldo/keto reductase  39.69 
 
 
332 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  40.61 
 
 
333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3174  aldo/keto reductase  37.46 
 
 
336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  37.07 
 
 
343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  36.34 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5927  aldo/keto oxidoreductase  40.07 
 
 
341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  38.41 
 
 
326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4305  aldo/keto reductase  38.11 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0836372  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  39.47 
 
 
346 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1155  aldo/keto reductase  37.62 
 
 
311 aa  196  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  38.01 
 
 
357 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2542  aldo/keto reductase  37.46 
 
 
336 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>