More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6154 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6154  aldo/keto reductase  100 
 
 
316 aa  641    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.775736  normal  0.411679 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5072  aldo/keto reductase  70.42 
 
 
325 aa  441  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.156563  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0458  aldo/keto reductase  61.22 
 
 
317 aa  366  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3890  aldo/keto reductase  59.37 
 
 
319 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872462  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4281  aldo/keto reductase  57.83 
 
 
317 aa  349  3e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198466  hitchhiker  0.0048015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6159  aldo/keto reductase  58.6 
 
 
317 aa  345  6e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.145044  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0069  aldo/keto reductase  60.51 
 
 
323 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  56.27 
 
 
309 aa  340  2e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1641  aldo/keto reductase  56.47 
 
 
325 aa  321  9.000000000000001e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000385668 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1876  aldo/keto reductase  54.37 
 
 
317 aa  317  1e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0609138 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  54.09 
 
 
313 aa  316  3e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  53.46 
 
 
313 aa  315  4e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  52.68 
 
 
313 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10970  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  55.49 
 
 
327 aa  311  7.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4073  aldo/keto reductase  54.63 
 
 
311 aa  309  5e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.492904 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  51.42 
 
 
313 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4777  aldo/keto reductase  54.86 
 
 
321 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1649  aldo/keto reductase  55.35 
 
 
325 aa  305  8.000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.328017  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1691  aldo/keto reductase  53.44 
 
 
336 aa  297  1e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0210969 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13010  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  56.48 
 
 
324 aa  296  2e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118581  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0410  aldo/keto reductase  49.85 
 
 
320 aa  281  7.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213987  normal  0.0921299 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3670  aldo/keto reductase  46.71 
 
 
311 aa  255  8e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  43.3 
 
 
349 aa  239  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  44.62 
 
 
349 aa  239  5e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4305  aldo/keto reductase  43.52 
 
 
342 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0836372  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4075  aldo/keto reductase  43.21 
 
 
342 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4151  aldo/keto reductase  43.21 
 
 
342 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  42.5 
 
 
345 aa  223  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  40.5 
 
 
343 aa  222  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  43.25 
 
 
352 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  43.16 
 
 
350 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  43.44 
 
 
368 aa  218  8.999999999999998e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6644  aldo/keto reductase  39.75 
 
 
342 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000695523  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  42.02 
 
 
352 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  40.68 
 
 
344 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  40.19 
 
 
351 aa  216  5e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  41.28 
 
 
352 aa  214  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  40.85 
 
 
355 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  41.14 
 
 
325 aa  214  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2914  aldo/keto reductase  41.98 
 
 
345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  41.41 
 
 
352 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3210  aldo/keto reductase  40.99 
 
 
342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0255002 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  42.37 
 
 
345 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3015  putative oxidoreductase, MocA  39.63 
 
 
341 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4249  aldo/keto reductase  40.5 
 
 
343 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.615627  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0432  aldo/keto reductase  42.72 
 
 
343 aa  212  5.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.320892  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  37.39 
 
 
347 aa  212  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  40.55 
 
 
344 aa  212  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  40.62 
 
 
349 aa  212  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1427  aldo/keto reductase  39.63 
 
 
341 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  42.68 
 
 
343 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5127  aldo/keto reductase  42.06 
 
 
345 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  40.25 
 
 
333 aa  210  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  39.63 
 
 
344 aa  209  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  42.24 
 
 
349 aa  208  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4826  aldo/keto reductase  41.74 
 
 
345 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4175  aldo/keto reductase  41.74 
 
 
345 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3340  aldo/keto reductase  41.74 
 
 
345 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4044  aldo/keto reductase  38.63 
 
 
344 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  41.34 
 
 
341 aa  207  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3284  aldo/keto reductase  40.38 
 
 
343 aa  206  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
341 aa  206  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  39.08 
 
 
389 aa  205  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  38.89 
 
 
344 aa  205  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  37.08 
 
 
345 aa  206  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  39.06 
 
 
340 aa  206  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  38.89 
 
 
344 aa  205  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  40 
 
 
354 aa  204  1e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  41.3 
 
 
357 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  40.48 
 
 
349 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3663  aldo/keto reductase  41.46 
 
 
344 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  40.48 
 
 
349 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3505  aldo/keto reductase  41.16 
 
 
344 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  39.64 
 
 
353 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3594  aldo/keto reductase  41.46 
 
 
344 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  42.41 
 
 
342 aa  202  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4803  aldo/keto reductase  38.65 
 
 
329 aa  202  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24760  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  39.76 
 
 
323 aa  202  8e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0580627  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  38.7 
 
 
343 aa  201  9e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1755  aldo/keto reductase  39.09 
 
 
323 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000557671 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0928  aldo/keto reductase  42.68 
 
 
339 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339617  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0033  aldo/keto reductase  42.36 
 
 
339 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0042  aldo/keto reductase  42.36 
 
 
339 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00274786 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  40 
 
 
335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8302  aldo/keto reductase  40.74 
 
 
332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  38.05 
 
 
333 aa  200  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  40.61 
 
 
350 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3416  aldo/keto reductase  40.62 
 
 
348 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0023  aldo/keto reductase  42.36 
 
 
339 aa  199  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  38.02 
 
 
346 aa  199  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  41.69 
 
 
345 aa  199  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  40.36 
 
 
344 aa  199  6e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6197  aldo/keto reductase  37.27 
 
 
339 aa  199  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  36.9 
 
 
358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  39.12 
 
 
328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  40.3 
 
 
349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  38.28 
 
 
348 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  37.27 
 
 
343 aa  197  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3542  aldo/keto reductase  39.69 
 
 
332 aa  196  3e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0524  aldo/keto reductase  37.08 
 
 
359 aa  197  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>