More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3146 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3146  aldo/keto reductase  100 
 
 
315 aa  624  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5005  aldo/keto reductase  99.37 
 
 
315 aa  620  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5300  aldo/keto reductase  92.7 
 
 
315 aa  587  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5129  aldo/keto reductase  92.04 
 
 
315 aa  577  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5730  aldo/keto reductase  92.04 
 
 
315 aa  577  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4493  aldo/keto reductase  92.04 
 
 
315 aa  577  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3141  aldo/keto reductase  91.4 
 
 
315 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0627738  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  81.85 
 
 
315 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2461  aldo/keto reductase family oxidoreductase  81.85 
 
 
463 aa  524  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.454661  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0355  aldo/keto reductase family oxidoreductase  81.85 
 
 
334 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42782  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0633  aldo/keto reductase family oxidoreductase  81.85 
 
 
334 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.336251  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1269  aldo/keto reductase family oxidoreductase  81.53 
 
 
331 aa  524  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.594857  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1195  aldo/keto reductase family oxidoreductase  81.85 
 
 
334 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0938  aldo/keto reductase family oxidoreductase  81.85 
 
 
334 aa  525  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1541  aldo/keto reductase family oxidoreductase  80.57 
 
 
315 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0104  aldo/keto reductase  66.88 
 
 
313 aa  421  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.603484 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3831  aldo/keto reductase  65.92 
 
 
313 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2988  aldo/keto reductase  65.29 
 
 
313 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000283356 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3551  aldo/keto reductase  63.09 
 
 
317 aa  389  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3891  aldo/keto reductase  62.86 
 
 
318 aa  379  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2213  aldo/keto reductase  60.63 
 
 
322 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341962  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1234  aldo/keto reductase  59.68 
 
 
317 aa  369  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0495818  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2964  aldo/keto reductase  61.66 
 
 
321 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.373125  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4024  aldo/keto reductase  59.37 
 
 
326 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450342  normal  0.165527 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4021  aldo/keto reductase  58.15 
 
 
314 aa  360  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.535863 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3016  aldo/keto reductase  58.23 
 
 
325 aa  359  3e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.233516 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1320  putative oxidoreductase  60.44 
 
 
316 aa  359  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225792  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03274  oxidoreductase  60.52 
 
 
323 aa  359  4e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14990  putative oxidoreductase  59.81 
 
 
316 aa  358  9e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.239005 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1314  aldo/keto reductase  60.7 
 
 
321 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127438  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1208  aldo/keto reductase  59.68 
 
 
320 aa  354  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000298069  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0298  aldo/keto reductase  58.23 
 
 
317 aa  352  4e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7226  oxidoreductase  55.7 
 
 
316 aa  349  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.348696  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1146  aldo/keto reductase  57.59 
 
 
315 aa  348  8e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2700  aldo/keto reductase  57.78 
 
 
321 aa  345  5e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000432356  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3494  aldo/keto reductase  56.33 
 
 
316 aa  341  8e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5855  aldo/keto reductase  56.51 
 
 
320 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.306238  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2231  aldo/keto reductase  53.48 
 
 
316 aa  335  3.9999999999999995e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.500812 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0318  aldo/keto reductase  57.41 
 
 
320 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.62816  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5334  aldo/keto reductase  53.75 
 
 
324 aa  329  4e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0616277  normal  0.0448039 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2848  aldo/keto reductase  54.31 
 
 
311 aa  329  4e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0082562  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6919  aldo/keto reductase  53.67 
 
 
312 aa  326  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3745  aldo/keto reductase  54.29 
 
 
314 aa  321  9.000000000000001e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130994  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0990  aldo/keto reductase  52.7 
 
 
315 aa  318  5e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4543  aldo/keto reductase  52.22 
 
 
315 aa  319  5e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.785787  normal  0.78245 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4278  aldo/keto reductase  52.87 
 
 
315 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0151  oxidoreductase  53 
 
 
317 aa  316  4e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0788  aldo/keto reductase  51.58 
 
 
315 aa  312  4.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0480  aldo/keto reductase  50.96 
 
 
321 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775946  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0261  aldo/keto reductase  54.74 
 
 
314 aa  291  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0106192 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0485  aldo/keto reductase  51.77 
 
 
321 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0452  aldo/keto reductase  51.28 
 
 
321 aa  288  8e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5044  aldo/keto reductase  50.16 
 
 
316 aa  286  4e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0976  aldo/keto reductase  50.97 
 
 
314 aa  277  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.80034  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6313  aldo/keto reductase  54.05 
 
 
307 aa  275  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.68408  normal  0.160779 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3437  aldo/keto reductase  49.67 
 
 
318 aa  275  9e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108032  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  44.98 
 
 
338 aa  267  2e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1384  aldo/keto reductase  47.19 
 
 
323 aa  257  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.475337  normal  0.194601 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0299  aldo/keto reductase  47.74 
 
 
305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.750112  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  43.16 
 
 
342 aa  250  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1402  aldo/keto reductase  46.1 
 
 
318 aa  239  2.9999999999999997e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0529164  normal  0.998691 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3644  aldo/keto reductase  43 
 
 
315 aa  235  8e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  42.23 
 
 
329 aa  230  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  43.25 
 
 
325 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  38.97 
 
 
341 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  41.88 
 
 
332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  38.46 
 
 
333 aa  192  8e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  39.14 
 
 
331 aa  192  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  39.6 
 
 
333 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  39.69 
 
 
325 aa  190  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  38.2 
 
 
336 aa  186  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  39.12 
 
 
343 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  37.39 
 
 
331 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  37.07 
 
 
334 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  37.08 
 
 
335 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  35.38 
 
 
325 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  37.54 
 
 
326 aa  176  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  37.39 
 
 
331 aa  176  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  36.9 
 
 
349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  36.9 
 
 
349 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  35.35 
 
 
327 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004434  oxidoreductase Tas aldo/keto reductase family  34.23 
 
 
344 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0724585  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1975  aldo/keto reductase  37 
 
 
332 aa  172  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3286  aldo/keto reductase  38.05 
 
 
323 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.278509 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  34.64 
 
 
338 aa  172  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  37.8 
 
 
343 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3629  aldo/keto reductase  39.21 
 
 
344 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0520546 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0032  aldo/keto reductase  34.9 
 
 
346 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3045  aldo/keto reductase  34.82 
 
 
343 aa  170  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  33.74 
 
 
358 aa  170  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  38.14 
 
 
309 aa  169  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  37.05 
 
 
355 aa  170  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0867  putative aldo/keto reductase  36.11 
 
 
349 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  37 
 
 
343 aa  170  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  37.65 
 
 
353 aa  169  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1969  putative oxidoreductase  35.57 
 
 
326 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00365702  normal  0.23795 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1898  aldo/keto reductase  38.17 
 
 
332 aa  169  7e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116625 
 
 
-
 
NC_003296  RS03071  putative oxidoreductase protein  36.99 
 
 
334 aa  168  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1178  aldo/keto reductase  36.06 
 
 
353 aa  168  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00964  oxidoreductase  33.53 
 
 
344 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>