More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2162 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2162  aldo/keto reductase  100 
 
 
323 aa  635    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2316  aldo/keto reductase  96.59 
 
 
323 aa  577  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4504  aldo/keto reductase  69.81 
 
 
319 aa  415  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0157031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4794  aldo/keto reductase  66.36 
 
 
336 aa  415  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2659  aldo/keto reductase  66.77 
 
 
326 aa  414  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0194115  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2622  aldo/keto reductase  67.62 
 
 
315 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0688105  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2281  aldo/keto reductase  63.06 
 
 
312 aa  391  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000892258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5935  aldo/keto reductase  63.26 
 
 
314 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.431084  normal  0.0103117 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20030  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  62.73 
 
 
321 aa  383  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1938  aldo/keto reductase  62.42 
 
 
312 aa  378  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0483679  normal  0.477908 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3524  aldo/keto reductase  61.61 
 
 
321 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1168  aldo/keto reductase  61.3 
 
 
338 aa  345  6e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.387611  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2250  aldo/keto reductase  60.56 
 
 
321 aa  337  9.999999999999999e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.263208  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2012  aldo/keto reductase  58.51 
 
 
318 aa  334  1e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1477  aldo/keto reductase  58.75 
 
 
313 aa  333  2e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.699204  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2773  aldo/keto reductase  59.11 
 
 
308 aa  333  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000277138  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1839  putative oxidoreductase  58.82 
 
 
318 aa  331  8e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237183  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2762  aldo/keto reductase  56.19 
 
 
317 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21000  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  56.05 
 
 
316 aa  305  6e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.669588 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2166  aldo/keto reductase  54.92 
 
 
311 aa  305  6e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1909  aldo/keto reductase  51.58 
 
 
311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000159083 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  46.2 
 
 
352 aa  247  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  42.99 
 
 
352 aa  240  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3629  aldo/keto reductase  46.73 
 
 
344 aa  238  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0520546 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  47.11 
 
 
344 aa  238  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  44.91 
 
 
335 aa  233  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  43.58 
 
 
349 aa  233  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  40.18 
 
 
358 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  41.9 
 
 
333 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3226  aldo/keto reductase  46.63 
 
 
345 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  44.34 
 
 
343 aa  223  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  44.51 
 
 
343 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  40.32 
 
 
333 aa  222  6e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3467  aldo/keto reductase  39.82 
 
 
361 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.648507  normal  0.107464 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  45.36 
 
 
323 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  46.79 
 
 
343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  41.32 
 
 
352 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  41.02 
 
 
352 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  40.66 
 
 
341 aa  220  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  41.96 
 
 
340 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  41.39 
 
 
345 aa  219  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1178  aldo/keto reductase  42.07 
 
 
353 aa  219  7e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  41.32 
 
 
354 aa  218  8.999999999999998e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  42.42 
 
 
350 aa  218  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  41.87 
 
 
353 aa  217  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  41.62 
 
 
355 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  42.18 
 
 
338 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1549  aldo/keto reductase  40.69 
 
 
326 aa  216  4e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.886416  normal  0.340196 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  41.89 
 
 
338 aa  216  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  39.3 
 
 
334 aa  214  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  40.77 
 
 
357 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  38.58 
 
 
358 aa  214  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3890  aldo/keto reductase  44.15 
 
 
319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.872462  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0305  aldo/keto reductase  45.72 
 
 
346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  39.26 
 
 
325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4577  aldo/keto reductase  40.61 
 
 
353 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871786  normal  0.194058 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0296  aldo/keto reductase  38.36 
 
 
338 aa  213  2.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  42.47 
 
 
343 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0948  putative aldo/keto reductase  40.67 
 
 
360 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.738715  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  42.32 
 
 
332 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  40.52 
 
 
338 aa  211  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3365  aldo/keto reductase  43.12 
 
 
336 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  40.23 
 
 
349 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3819  aldo/keto reductase  41.84 
 
 
326 aa  210  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7438  aldo/keto reductase  39.88 
 
 
360 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.798482 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  40.23 
 
 
349 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  39.81 
 
 
326 aa  210  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  41.39 
 
 
339 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0693  aldo/keto reductase  41.3 
 
 
338 aa  210  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  41.39 
 
 
339 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  41.87 
 
 
331 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  40.25 
 
 
328 aa  209  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4281  aldo/keto reductase  44.11 
 
 
317 aa  209  6e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198466  hitchhiker  0.0048015 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  41.74 
 
 
343 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  41.83 
 
 
325 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  39.05 
 
 
349 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  39.3 
 
 
348 aa  206  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  41.34 
 
 
345 aa  206  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  41.74 
 
 
343 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  39.07 
 
 
342 aa  206  5e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1447  aldo/keto reductase  40.92 
 
 
351 aa  206  5e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0652704  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  41.37 
 
 
327 aa  206  5e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0588  aldo/keto reductase  39.7 
 
 
360 aa  205  7e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4809  aldo/keto reductase  41.67 
 
 
330 aa  205  8e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6197  aldo/keto reductase  41.01 
 
 
339 aa  205  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6423  aldo/keto reductase  41.69 
 
 
339 aa  205  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251084  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0085  putative norsolorinic acid reductase  40.06 
 
 
348 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3379  aldo/keto reductase  42.81 
 
 
325 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  40.36 
 
 
351 aa  204  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  42.04 
 
 
326 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3784  aldo/keto reductase  42.38 
 
 
342 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00710905  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  38.05 
 
 
346 aa  204  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0524  aldo/keto reductase  37.72 
 
 
359 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2761  aldo/keto reductase  41.07 
 
 
323 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  40.46 
 
 
329 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0240  aldo/keto reductase  37.08 
 
 
340 aa  204  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.628771 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1898  aldo/keto reductase  40.95 
 
 
332 aa  203  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0701  aldo/keto reductase  40.24 
 
 
348 aa  203  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  40.86 
 
 
340 aa  203  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1077  aldo/keto reductase  40.58 
 
 
324 aa  203  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>