More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3365 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3365  aldo/keto reductase  100 
 
 
336 aa  676    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0085  putative norsolorinic acid reductase  56.83 
 
 
348 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0538  aldo/keto reductase  56.52 
 
 
350 aa  365  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1189  aldo/keto reductase  51.53 
 
 
349 aa  333  3e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.712785  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0524  aldo/keto reductase  51.08 
 
 
351 aa  328  1.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3492  aldo/keto reductase  50.92 
 
 
349 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2932  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  50.32 
 
 
335 aa  309  4e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0453646  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4534  aldo/keto reductase  49.39 
 
 
346 aa  308  8e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3226  aldo/keto reductase  51.84 
 
 
345 aa  291  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0701  aldo/keto reductase  50 
 
 
348 aa  286  4e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1178  aldo/keto reductase  45.73 
 
 
353 aa  281  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4577  aldo/keto reductase  45.15 
 
 
353 aa  275  9e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871786  normal  0.194058 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0240  aldo/keto reductase  43.93 
 
 
340 aa  265  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.628771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1447  aldo/keto reductase  45.95 
 
 
351 aa  263  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0652704  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0948  putative aldo/keto reductase  43.43 
 
 
360 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.738715  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4192  aldo/keto reductase  44.68 
 
 
338 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.957663  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5688  aldo/keto reductase  41.93 
 
 
321 aa  260  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.871424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1473  aldo/keto reductase  49.52 
 
 
345 aa  258  7e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0111458  normal  0.642292 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14220  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  46.42 
 
 
354 aa  258  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.982518  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3467  aldo/keto reductase  42.07 
 
 
361 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.648507  normal  0.107464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7438  aldo/keto reductase  43.48 
 
 
360 aa  236  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.798482 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  41.92 
 
 
358 aa  233  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  40.17 
 
 
343 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  37.65 
 
 
347 aa  209  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4794  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
336 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  40.64 
 
 
352 aa  206  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0488  aldo/keto reductase  39.33 
 
 
368 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.807596  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2659  aldo/keto reductase  41.34 
 
 
326 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0194115  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2316  aldo/keto reductase  42.81 
 
 
323 aa  204  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2162  aldo/keto reductase  42.51 
 
 
323 aa  203  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  39.34 
 
 
341 aa  202  7e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20030  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  40.24 
 
 
321 aa  202  7e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  39.29 
 
 
335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  38.07 
 
 
352 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  38.14 
 
 
352 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  38.48 
 
 
344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  35.19 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  40.9 
 
 
354 aa  196  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4044  aldo/keto reductase  37.04 
 
 
344 aa  195  7e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  35.76 
 
 
327 aa  195  8.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  39.7 
 
 
345 aa  195  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2622  aldo/keto reductase  41.25 
 
 
315 aa  194  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0688105  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  39.39 
 
 
349 aa  194  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  37.88 
 
 
344 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  38.48 
 
 
344 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  38.53 
 
 
351 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  38.74 
 
 
352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  37.95 
 
 
355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  37.99 
 
 
353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6327  aldo/keto reductase  40.84 
 
 
340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.563142  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  39.09 
 
 
349 aa  190  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  40.48 
 
 
344 aa  189  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4504  aldo/keto reductase  41.61 
 
 
319 aa  189  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0157031 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  36.87 
 
 
344 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3993  oxidoreductase  36.93 
 
 
365 aa  188  9e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0410  aldo/keto reductase  40 
 
 
320 aa  188  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213987  normal  0.0921299 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3524  aldo/keto reductase  38.34 
 
 
321 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2914  aldo/keto reductase  38.74 
 
 
345 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6423  aldo/keto reductase  36.98 
 
 
339 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251084  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  37.05 
 
 
344 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  37.58 
 
 
343 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  37.05 
 
 
389 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  38.39 
 
 
338 aa  186  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2250  aldo/keto reductase  42.99 
 
 
321 aa  186  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.263208  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4424  aldo/keto reductase  37.58 
 
 
335 aa  186  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00178858  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  37.24 
 
 
349 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1477  aldo/keto reductase  38.6 
 
 
313 aa  185  7e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.699204  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  37.43 
 
 
345 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  35.93 
 
 
343 aa  185  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5935  aldo/keto reductase  39.69 
 
 
314 aa  185  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.431084  normal  0.0103117 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3629  aldo/keto reductase  38.15 
 
 
344 aa  185  8e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0520546 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4943  aldo/keto reductase  37.08 
 
 
332 aa  185  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  36.94 
 
 
349 aa  185  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0266  aldo/keto reductase  39.75 
 
 
344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  37.18 
 
 
357 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  37.88 
 
 
343 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  38.39 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5127  aldo/keto reductase  37.13 
 
 
345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4175  aldo/keto reductase  37.27 
 
 
345 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4826  aldo/keto reductase  37.27 
 
 
345 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3340  aldo/keto reductase  37.27 
 
 
345 aa  183  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  37.31 
 
 
343 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  35.33 
 
 
343 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2281  aldo/keto reductase  37.85 
 
 
312 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000892258  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  37.03 
 
 
339 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  37.03 
 
 
339 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  34.1 
 
 
346 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  35.03 
 
 
343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5984  aldo/keto reductase  39.01 
 
 
368 aa  179  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  34.73 
 
 
345 aa  179  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0524  aldo/keto reductase  34.72 
 
 
359 aa  179  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  37.54 
 
 
313 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1488  aldo/keto reductase  37.12 
 
 
337 aa  179  7e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  40.88 
 
 
337 aa  179  8e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  35.55 
 
 
338 aa  178  9e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3663  aldo/keto reductase  39.34 
 
 
344 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  38.44 
 
 
342 aa  178  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4612  aldo/keto reductase  37.5 
 
 
340 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.593922  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3594  aldo/keto reductase  39.82 
 
 
344 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  36.79 
 
 
313 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>