More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_20030 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_20030  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  100 
 
 
321 aa  633  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3524  aldo/keto reductase  75.71 
 
 
321 aa  471  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2659  aldo/keto reductase  63.04 
 
 
326 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0194115  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4794  aldo/keto reductase  61.99 
 
 
336 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2281  aldo/keto reductase  62.54 
 
 
312 aa  368  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000892258  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2162  aldo/keto reductase  62.73 
 
 
323 aa  366  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1938  aldo/keto reductase  60.76 
 
 
312 aa  358  6e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0483679  normal  0.477908 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2316  aldo/keto reductase  60.87 
 
 
323 aa  356  1.9999999999999998e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2622  aldo/keto reductase  60.13 
 
 
315 aa  355  5.999999999999999e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0688105  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5935  aldo/keto reductase  60.32 
 
 
314 aa  353  2.9999999999999997e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.431084  normal  0.0103117 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2773  aldo/keto reductase  60.13 
 
 
308 aa  343  2e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000277138  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4504  aldo/keto reductase  57.99 
 
 
319 aa  331  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0157031 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2250  aldo/keto reductase  56.56 
 
 
321 aa  330  3e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.263208  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1168  aldo/keto reductase  57.59 
 
 
338 aa  324  1e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.387611  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1477  aldo/keto reductase  54.18 
 
 
313 aa  311  1e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.699204  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2012  aldo/keto reductase  54.86 
 
 
318 aa  310  2e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2166  aldo/keto reductase  53.85 
 
 
311 aa  304  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1839  putative oxidoreductase  53.42 
 
 
318 aa  296  4e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237183  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2762  aldo/keto reductase  54.04 
 
 
317 aa  295  6e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1909  aldo/keto reductase  49.03 
 
 
311 aa  278  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000159083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21000  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  49.84 
 
 
316 aa  275  6e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.669588 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  43.43 
 
 
352 aa  236  3e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  43.94 
 
 
349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  41.77 
 
 
340 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  44.92 
 
 
344 aa  228  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  41.95 
 
 
357 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  42.11 
 
 
332 aa  226  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  40.8 
 
 
358 aa  223  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  44.27 
 
 
343 aa  223  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  41.59 
 
 
335 aa  222  8e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  41.53 
 
 
333 aa  222  8e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  40.66 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  42.3 
 
 
353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  40.37 
 
 
354 aa  219  6e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3226  aldo/keto reductase  44.27 
 
 
345 aa  218  7.999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  40.73 
 
 
350 aa  218  8.999999999999998e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  42.28 
 
 
323 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1549  aldo/keto reductase  40.82 
 
 
326 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.886416  normal  0.340196 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  40.66 
 
 
331 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
355 aa  216  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  41.32 
 
 
328 aa  216  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3629  aldo/keto reductase  43.33 
 
 
344 aa  216  5e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0520546 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  40.24 
 
 
331 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3819  aldo/keto reductase  41.27 
 
 
326 aa  216  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  40.89 
 
 
333 aa  215  7e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  39.02 
 
 
352 aa  214  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  44.17 
 
 
343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  42.59 
 
 
326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  39.82 
 
 
345 aa  213  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0305  aldo/keto reductase  41.72 
 
 
346 aa  213  3.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  37.06 
 
 
334 aa  211  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  40.25 
 
 
331 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  39.51 
 
 
352 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6431  aldo/keto reductase  38.8 
 
 
324 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  40.98 
 
 
343 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  42.42 
 
 
349 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  38.14 
 
 
341 aa  210  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  38.6 
 
 
352 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3467  aldo/keto reductase  39.32 
 
 
361 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.648507  normal  0.107464 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  40.85 
 
 
344 aa  209  6e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  40.63 
 
 
313 aa  208  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  42.12 
 
 
339 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  38.67 
 
 
349 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  41.82 
 
 
338 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  42.12 
 
 
339 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  40.43 
 
 
345 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2263  aldo/keto reductase  38.17 
 
 
326 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0693  aldo/keto reductase  41.99 
 
 
338 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  41.82 
 
 
338 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  40.98 
 
 
343 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  38.67 
 
 
351 aa  207  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  40.67 
 
 
343 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4809  aldo/keto reductase  40.58 
 
 
330 aa  206  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.419234  normal  0.447394 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1178  aldo/keto reductase  39.51 
 
 
353 aa  206  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  39.63 
 
 
345 aa  206  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5127  aldo/keto reductase  40.12 
 
 
345 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  40.29 
 
 
338 aa  206  5e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  38.34 
 
 
336 aa  205  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2761  aldo/keto reductase  38.29 
 
 
323 aa  205  6e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5669  aldo/keto reductase  38.15 
 
 
322 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.192891 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  39.63 
 
 
343 aa  206  6e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4826  aldo/keto reductase  40.55 
 
 
345 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  41.03 
 
 
343 aa  205  7e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3340  aldo/keto reductase  40.55 
 
 
345 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4175  aldo/keto reductase  40.55 
 
 
345 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0617  aldo/keto reductase  41.23 
 
 
326 aa  205  9e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.376815  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
313 aa  205  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2914  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
345 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  40.45 
 
 
313 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3716  aldo/keto reductase  39.82 
 
 
322 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0948  putative aldo/keto reductase  40.37 
 
 
360 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.738715  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  40.54 
 
 
351 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  40.54 
 
 
351 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  39.88 
 
 
370 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  40.18 
 
 
351 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  38.07 
 
 
349 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4577  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
353 aa  203  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871786  normal  0.194058 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  40.18 
 
 
351 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  40 
 
 
342 aa  203  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4529  aldo/keto reductase  38.39 
 
 
326 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>