More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_21000 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_21000  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  100 
 
 
316 aa  608  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.669588 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2012  aldo/keto reductase  63.29 
 
 
318 aa  359  3e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1477  aldo/keto reductase  61.98 
 
 
313 aa  350  1e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.699204  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2250  aldo/keto reductase  60.95 
 
 
321 aa  343  2e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.263208  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2166  aldo/keto reductase  53.67 
 
 
311 aa  320  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1938  aldo/keto reductase  53.48 
 
 
312 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0483679  normal  0.477908 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2622  aldo/keto reductase  54.14 
 
 
315 aa  301  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0688105  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4794  aldo/keto reductase  53.27 
 
 
336 aa  301  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1909  aldo/keto reductase  52.23 
 
 
311 aa  298  9e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000159083 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2659  aldo/keto reductase  53.02 
 
 
326 aa  289  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0194115  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2162  aldo/keto reductase  56.05 
 
 
323 aa  289  4e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2316  aldo/keto reductase  55.1 
 
 
323 aa  288  7e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5935  aldo/keto reductase  51.41 
 
 
314 aa  288  8e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.431084  normal  0.0103117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2281  aldo/keto reductase  50.48 
 
 
312 aa  287  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000892258  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1839  putative oxidoreductase  52.56 
 
 
318 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237183  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3524  aldo/keto reductase  52.22 
 
 
321 aa  278  7e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1168  aldo/keto reductase  51.43 
 
 
338 aa  277  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.387611  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20030  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  49.84 
 
 
321 aa  275  6e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2773  aldo/keto reductase  51.75 
 
 
308 aa  269  4e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000277138  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2762  aldo/keto reductase  49.84 
 
 
317 aa  268  8.999999999999999e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4504  aldo/keto reductase  49.68 
 
 
319 aa  266  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0157031 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  44.31 
 
 
344 aa  199  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  40.49 
 
 
352 aa  194  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0538  aldo/keto reductase  40.87 
 
 
350 aa  192  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  36.36 
 
 
358 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  37.74 
 
 
313 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3629  aldo/keto reductase  42.28 
 
 
344 aa  186  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0520546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  39.88 
 
 
349 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  40.85 
 
 
349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  38.68 
 
 
335 aa  182  8.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  39.51 
 
 
343 aa  182  9.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  39.76 
 
 
345 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  38.84 
 
 
340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0524  aldo/keto reductase  38.89 
 
 
351 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  41.07 
 
 
343 aa  179  4.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  35.6 
 
 
342 aa  179  7e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  38.08 
 
 
355 aa  179  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  35.76 
 
 
313 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3226  aldo/keto reductase  39.43 
 
 
345 aa  178  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0410  aldo/keto reductase  37.33 
 
 
320 aa  178  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213987  normal  0.0921299 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  39.21 
 
 
344 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0701  aldo/keto reductase  40.18 
 
 
348 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  36.78 
 
 
338 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2932  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  37.5 
 
 
335 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0453646  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  39.51 
 
 
343 aa  177  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  37.69 
 
 
343 aa  177  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0948  putative aldo/keto reductase  36.99 
 
 
360 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.738715  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0085  putative norsolorinic acid reductase  36.76 
 
 
348 aa  175  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  36.28 
 
 
352 aa  175  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  36.2 
 
 
352 aa  175  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3365  aldo/keto reductase  37.46 
 
 
336 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3467  aldo/keto reductase  34.16 
 
 
361 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.648507  normal  0.107464 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  36.62 
 
 
332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  38 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  38.72 
 
 
343 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1954  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
349 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464115  normal  0.0603236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  34.07 
 
 
333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1549  aldo/keto reductase  37.18 
 
 
326 aa  172  5.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.886416  normal  0.340196 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4075  aldo/keto reductase  39.08 
 
 
342 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4151  aldo/keto reductase  39.08 
 
 
342 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  38.18 
 
 
326 aa  172  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  38.3 
 
 
354 aa  171  1e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  33.23 
 
 
325 aa  171  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  35.4 
 
 
331 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3210  aldo/keto reductase  36.92 
 
 
342 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0255002 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4305  aldo/keto reductase  38.77 
 
 
342 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0836372  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  38.41 
 
 
343 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  38.72 
 
 
343 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  37.67 
 
 
340 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  35.51 
 
 
331 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  38.41 
 
 
343 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  35.13 
 
 
313 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  39.29 
 
 
322 aa  170  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  38.48 
 
 
345 aa  170  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  37 
 
 
350 aa  170  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4175  aldo/keto reductase  39.16 
 
 
345 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4826  aldo/keto reductase  39.16 
 
 
345 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3340  aldo/keto reductase  39.16 
 
 
345 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3379  aldo/keto reductase  35.26 
 
 
325 aa  169  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0240  aldo/keto reductase  34.16 
 
 
340 aa  169  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.628771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5127  aldo/keto reductase  38.86 
 
 
345 aa  169  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
333 aa  169  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4529  aldo/keto reductase  33.02 
 
 
326 aa  168  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3835  aldo/keto reductase  32.73 
 
 
326 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256524  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  37.82 
 
 
316 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3310  aldo/keto reductase  36.48 
 
 
332 aa  168  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108449  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  36.12 
 
 
342 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4577  aldo/keto reductase  36 
 
 
353 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871786  normal  0.194058 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  36.67 
 
 
347 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3542  aldo/keto reductase  36.51 
 
 
332 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  37.72 
 
 
357 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  37.28 
 
 
352 aa  166  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  37.62 
 
 
328 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  36.39 
 
 
325 aa  166  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  35.56 
 
 
345 aa  166  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1683  aldo/keto reductase  32.31 
 
 
325 aa  166  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.891662  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1462  aldo/keto reductase  34.81 
 
 
333 aa  166  5e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0426  aldo/keto reductase  35.56 
 
 
361 aa  166  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1313  aldo/keto reductase  37.12 
 
 
337 aa  166  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0386871  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2915  aldo/keto reductase  33.96 
 
 
337 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>