More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1839 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1839  putative oxidoreductase  100 
 
 
318 aa  631  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237183  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2762  aldo/keto reductase  66.67 
 
 
317 aa  401  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2281  aldo/keto reductase  63.69 
 
 
312 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000892258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5935  aldo/keto reductase  61.59 
 
 
314 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.431084  normal  0.0103117 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1938  aldo/keto reductase  62.54 
 
 
312 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0483679  normal  0.477908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4794  aldo/keto reductase  62.1 
 
 
336 aa  360  3e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2622  aldo/keto reductase  59.18 
 
 
315 aa  343  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0688105  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2659  aldo/keto reductase  59.81 
 
 
326 aa  337  9.999999999999999e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0194115  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4504  aldo/keto reductase  58.73 
 
 
319 aa  321  9.000000000000001e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0157031 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2316  aldo/keto reductase  56.92 
 
 
323 aa  317  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2162  aldo/keto reductase  56.92 
 
 
323 aa  317  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3524  aldo/keto reductase  56.33 
 
 
321 aa  313  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2166  aldo/keto reductase  53.16 
 
 
311 aa  309  4e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2773  aldo/keto reductase  54.43 
 
 
308 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000277138  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20030  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  53.48 
 
 
321 aa  302  5.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1168  aldo/keto reductase  53.94 
 
 
338 aa  300  2e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.387611  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1909  aldo/keto reductase  52.05 
 
 
311 aa  292  6e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000159083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21000  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  52.81 
 
 
316 aa  291  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.669588 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2012  aldo/keto reductase  55.76 
 
 
318 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1477  aldo/keto reductase  50.32 
 
 
313 aa  276  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.699204  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2250  aldo/keto reductase  51.41 
 
 
321 aa  274  1.0000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.263208  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  41.9 
 
 
343 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  44.87 
 
 
344 aa  215  5.9999999999999996e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  40.99 
 
 
326 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  41.9 
 
 
352 aa  211  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1178  aldo/keto reductase  41.43 
 
 
353 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  37.35 
 
 
358 aa  206  5e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  41.21 
 
 
323 aa  206  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  42.45 
 
 
349 aa  205  7e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3629  aldo/keto reductase  41.49 
 
 
344 aa  205  9e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0520546 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  40.19 
 
 
333 aa  205  9e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  37.97 
 
 
334 aa  203  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2761  aldo/keto reductase  38.22 
 
 
323 aa  203  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
335 aa  203  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  44.27 
 
 
343 aa  202  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  40.06 
 
 
339 aa  202  8e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
339 aa  202  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  39.17 
 
 
342 aa  201  9e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3467  aldo/keto reductase  38.1 
 
 
361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.648507  normal  0.107464 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1549  aldo/keto reductase  38.94 
 
 
326 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.886416  normal  0.340196 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  40.12 
 
 
331 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  39.81 
 
 
326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  39.94 
 
 
343 aa  198  7.999999999999999e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  39.49 
 
 
328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0296  aldo/keto reductase  39.56 
 
 
338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  40.98 
 
 
331 aa  195  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3311  aldo/keto reductase  38.2 
 
 
322 aa  195  9e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.917987  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  40.32 
 
 
313 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6644  aldo/keto reductase  40.18 
 
 
342 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000695523  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0085  putative norsolorinic acid reductase  40.26 
 
 
348 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  37.5 
 
 
325 aa  193  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  38.51 
 
 
345 aa  193  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1876  aldo/keto reductase  37.77 
 
 
342 aa  193  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  37.93 
 
 
353 aa  193  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  40.12 
 
 
331 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  38.41 
 
 
333 aa  192  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0488  aldo/keto reductase  38.12 
 
 
368 aa  192  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.807596  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1898  aldo/keto reductase  40.25 
 
 
332 aa  192  7e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116625 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  39.22 
 
 
338 aa  192  7e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3226  aldo/keto reductase  41.85 
 
 
345 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  39.14 
 
 
355 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3239  aldo/keto reductase  43.84 
 
 
364 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.13922  normal  0.0117807 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6431  aldo/keto reductase  36.25 
 
 
324 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  37.46 
 
 
326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  38.84 
 
 
325 aa  189  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  35.69 
 
 
315 aa  190  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
343 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2826  aldo/keto reductase  36.84 
 
 
340 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5690  aldo/keto reductase  38.49 
 
 
326 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0442358  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  36.56 
 
 
349 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  34.15 
 
 
325 aa  189  7e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  37.12 
 
 
313 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  36.86 
 
 
349 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0617  aldo/keto reductase  38.2 
 
 
326 aa  188  9e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.376815  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  36.42 
 
 
349 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  36.42 
 
 
349 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  39.81 
 
 
352 aa  188  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0305  aldo/keto reductase  38.96 
 
 
346 aa  188  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  38.23 
 
 
332 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4577  aldo/keto reductase  37.46 
 
 
353 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871786  normal  0.194058 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  38.46 
 
 
343 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1650  aldo/keto reductase  34.82 
 
 
339 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42050  putative oxidoreductase  38.54 
 
 
323 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1722  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.82 
 
 
339 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0414871  hitchhiker  0.00103465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4382  aldo/keto reductase  36.19 
 
 
340 aa  187  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1541  aldo/keto reductase family oxidoreductase  34.82 
 
 
339 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  38.77 
 
 
343 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2556  aldo/keto reductase  38.27 
 
 
331 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  38.46 
 
 
343 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  38.71 
 
 
343 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  39.75 
 
 
338 aa  186  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  39.69 
 
 
338 aa  186  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1790  aldo/keto reductase  38.24 
 
 
331 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0366045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1656  aldo/keto reductase  38.61 
 
 
328 aa  186  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.702563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  36.45 
 
 
313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  36.16 
 
 
315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  35.28 
 
 
349 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  38.64 
 
 
329 aa  185  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0500  aldo/keto reductase  38.17 
 
 
332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3544  aldo/keto reductase  35.08 
 
 
326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.889794  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>