More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3524 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3524  aldo/keto reductase  100 
 
 
321 aa  625  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20030  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  75.71 
 
 
321 aa  471  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2659  aldo/keto reductase  65.73 
 
 
326 aa  402  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0194115  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5935  aldo/keto reductase  62.1 
 
 
314 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.431084  normal  0.0103117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2281  aldo/keto reductase  61.59 
 
 
312 aa  363  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000892258  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2162  aldo/keto reductase  61.61 
 
 
323 aa  358  5e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1938  aldo/keto reductase  60.76 
 
 
312 aa  358  6e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0483679  normal  0.477908 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4794  aldo/keto reductase  61.11 
 
 
336 aa  357  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2316  aldo/keto reductase  60.37 
 
 
323 aa  352  4e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2773  aldo/keto reductase  61.9 
 
 
308 aa  348  5e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000277138  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2622  aldo/keto reductase  60.76 
 
 
315 aa  348  8e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0688105  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1168  aldo/keto reductase  59.63 
 
 
338 aa  333  3e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.387611  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4504  aldo/keto reductase  57.59 
 
 
319 aa  326  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0157031 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2250  aldo/keto reductase  57.94 
 
 
321 aa  323  3e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.263208  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2012  aldo/keto reductase  57.55 
 
 
318 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1839  putative oxidoreductase  56.35 
 
 
318 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.237183  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2166  aldo/keto reductase  54.34 
 
 
311 aa  305  5.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1477  aldo/keto reductase  55.84 
 
 
313 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.699204  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2762  aldo/keto reductase  54.14 
 
 
317 aa  291  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1909  aldo/keto reductase  50.97 
 
 
311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000159083 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21000  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  52.22 
 
 
316 aa  278  8e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.669588 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  48.44 
 
 
344 aa  249  5e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  47.02 
 
 
343 aa  239  5e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  47.29 
 
 
343 aa  233  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  45.76 
 
 
349 aa  233  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3629  aldo/keto reductase  45.87 
 
 
344 aa  231  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0520546 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  40.79 
 
 
358 aa  230  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1178  aldo/keto reductase  41.28 
 
 
353 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3226  aldo/keto reductase  43.96 
 
 
345 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  42.86 
 
 
352 aa  221  9e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  44.12 
 
 
343 aa  220  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1447  aldo/keto reductase  44.92 
 
 
351 aa  220  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0652704  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0948  putative aldo/keto reductase  40.43 
 
 
360 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.738715  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  41.95 
 
 
352 aa  218  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  41.95 
 
 
357 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  41.03 
 
 
333 aa  216  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  41.51 
 
 
332 aa  214  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  43.17 
 
 
331 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  42.06 
 
 
331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  40.73 
 
 
335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  42.12 
 
 
355 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  41.74 
 
 
331 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7438  aldo/keto reductase  42.64 
 
 
360 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.798482 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  40.3 
 
 
345 aa  211  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  41.95 
 
 
340 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  40.38 
 
 
333 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  42.86 
 
 
323 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  39.58 
 
 
329 aa  210  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  40.79 
 
 
350 aa  210  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3467  aldo/keto reductase  39.08 
 
 
361 aa  208  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.648507  normal  0.107464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4577  aldo/keto reductase  40.3 
 
 
353 aa  208  9e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871786  normal  0.194058 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  41.95 
 
 
343 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1549  aldo/keto reductase  40.51 
 
 
326 aa  208  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.886416  normal  0.340196 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4943  aldo/keto reductase  38.61 
 
 
332 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0305  aldo/keto reductase  42.9 
 
 
346 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0991975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4192  aldo/keto reductase  39.57 
 
 
338 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.957663  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3716  aldo/keto reductase  41.88 
 
 
322 aa  206  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  37.54 
 
 
334 aa  206  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  38.91 
 
 
352 aa  205  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  41.95 
 
 
343 aa  205  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3819  aldo/keto reductase  42.9 
 
 
326 aa  205  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  42.25 
 
 
345 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  41.93 
 
 
343 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  42.32 
 
 
326 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0693  aldo/keto reductase  40.61 
 
 
338 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1473  aldo/keto reductase  43.26 
 
 
345 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0111458  normal  0.642292 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  40.79 
 
 
353 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1898  aldo/keto reductase  40.32 
 
 
332 aa  203  3e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116625 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5127  aldo/keto reductase  41.95 
 
 
345 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  37.99 
 
 
352 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0240  aldo/keto reductase  37.08 
 
 
340 aa  203  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.628771 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  37.69 
 
 
358 aa  202  6e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  41.52 
 
 
338 aa  202  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0722  aldo/keto reductase  41.52 
 
 
338 aa  202  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.798606  normal  0.462105 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6431  aldo/keto reductase  38.75 
 
 
324 aa  202  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2914  aldo/keto reductase  41.03 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  37.61 
 
 
338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4826  aldo/keto reductase  41.95 
 
 
345 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3340  aldo/keto reductase  41.95 
 
 
345 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  40.43 
 
 
343 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4175  aldo/keto reductase  41.95 
 
 
345 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  41.85 
 
 
316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0779  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
326 aa  199  5e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3311  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
322 aa  199  7e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.917987  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3996  aldo/keto reductase  41.93 
 
 
336 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  40.24 
 
 
354 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  38.91 
 
 
349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2761  aldo/keto reductase  39.24 
 
 
323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2263  aldo/keto reductase  38.87 
 
 
326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0588  aldo/keto reductase  37 
 
 
360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1578  aldo/keto reductase  42.81 
 
 
326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0491792  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6423  aldo/keto reductase  39.51 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251084  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  38.91 
 
 
349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3544  aldo/keto reductase  36.28 
 
 
326 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.889794  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3379  aldo/keto reductase  41.4 
 
 
325 aa  197  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1683  aldo/keto reductase  37.5 
 
 
325 aa  196  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.891662  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1321  aldo/keto reductase  39.61 
 
 
326 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  39.86 
 
 
327 aa  196  5.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3378  aldo/keto reductase  40.62 
 
 
337 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>