More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4534 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4534  aldo/keto reductase  100 
 
 
346 aa  704    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676979 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3492  aldo/keto reductase  54.03 
 
 
349 aa  371  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0085  putative norsolorinic acid reductase  53.31 
 
 
348 aa  363  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1189  aldo/keto reductase  53.43 
 
 
349 aa  362  6e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.712785  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0524  aldo/keto reductase  50.75 
 
 
351 aa  340  2e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0538  aldo/keto reductase  52.41 
 
 
350 aa  339  5e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2932  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  51.39 
 
 
335 aa  318  6e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0453646  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3365  aldo/keto reductase  49.39 
 
 
336 aa  308  8e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0948  putative aldo/keto reductase  47.25 
 
 
360 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.738715  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0701  aldo/keto reductase  45.7 
 
 
348 aa  290  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1178  aldo/keto reductase  45.19 
 
 
353 aa  285  8e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4192  aldo/keto reductase  43.57 
 
 
338 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.957663  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5688  aldo/keto reductase  42.73 
 
 
321 aa  267  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.871424 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3226  aldo/keto reductase  44.48 
 
 
345 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0240  aldo/keto reductase  43.15 
 
 
340 aa  262  4.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.628771 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14220  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  40.94 
 
 
354 aa  259  4e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.982518  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4577  aldo/keto reductase  42.69 
 
 
353 aa  256  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871786  normal  0.194058 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1447  aldo/keto reductase  41.93 
 
 
351 aa  252  5.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0652704  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  41.4 
 
 
358 aa  233  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3993  oxidoreductase  40 
 
 
365 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3467  aldo/keto reductase  40 
 
 
361 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.648507  normal  0.107464 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1473  aldo/keto reductase  41.41 
 
 
345 aa  229  8e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0111458  normal  0.642292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7438  aldo/keto reductase  40.06 
 
 
360 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.798482 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  39.94 
 
 
349 aa  210  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  40 
 
 
341 aa  209  7e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  41.06 
 
 
335 aa  207  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  41.4 
 
 
352 aa  204  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6327  aldo/keto reductase  40.42 
 
 
340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.563142  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0524  aldo/keto reductase  38.74 
 
 
359 aa  200  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  39.02 
 
 
352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  38.41 
 
 
343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  38.41 
 
 
343 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4943  aldo/keto reductase  39.34 
 
 
332 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  37.86 
 
 
355 aa  196  7e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  39.24 
 
 
351 aa  195  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  37.28 
 
 
349 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  38.58 
 
 
343 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  39.1 
 
 
325 aa  191  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  37.5 
 
 
343 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  37.86 
 
 
352 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  39.88 
 
 
343 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  39.05 
 
 
353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0296  aldo/keto reductase  37.06 
 
 
338 aa  190  4e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  36.69 
 
 
349 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  38.51 
 
 
349 aa  189  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  38.58 
 
 
338 aa  189  8e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  36.76 
 
 
347 aa  188  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  38.64 
 
 
349 aa  189  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  38.1 
 
 
344 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  37.39 
 
 
352 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  38.29 
 
 
350 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  37.72 
 
 
345 aa  187  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0426  aldo/keto reductase  37.06 
 
 
361 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152201  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  38.53 
 
 
344 aa  186  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  36.61 
 
 
345 aa  186  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  37.92 
 
 
343 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0488  aldo/keto reductase  37.57 
 
 
368 aa  186  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.807596  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  38.53 
 
 
389 aa  186  4e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  37.61 
 
 
357 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  36.92 
 
 
342 aa  185  8e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  37.26 
 
 
333 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  38.11 
 
 
344 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  37.2 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1288  aldo/keto reductase  38.41 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  36.23 
 
 
354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  38.74 
 
 
331 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  36.28 
 
 
334 aa  183  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3629  aldo/keto reductase  38.91 
 
 
344 aa  184  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0520546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2659  aldo/keto reductase  37.13 
 
 
326 aa  184  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0194115  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3931  aldo/keto reductase  38.91 
 
 
313 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0410  aldo/keto reductase  37.3 
 
 
320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.213987  normal  0.0921299 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  37.13 
 
 
349 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  37.13 
 
 
349 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4815  aldo/keto reductase  38.75 
 
 
313 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  36.39 
 
 
345 aa  182  8.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4044  aldo/keto reductase  37.87 
 
 
344 aa  182  8.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0155  aldo/keto reductase  37.61 
 
 
329 aa  182  9.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  37.07 
 
 
327 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  38.2 
 
 
341 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3074  aldo/keto reductase  36.62 
 
 
333 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00558733  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1938  aldo/keto reductase  38.72 
 
 
312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0483679  normal  0.477908 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2316  aldo/keto reductase  36.67 
 
 
323 aa  180  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00724126 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  36.23 
 
 
339 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  36.72 
 
 
348 aa  180  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  36.23 
 
 
339 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  36.9 
 
 
344 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3819  aldo/keto reductase  38.05 
 
 
326 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0588  aldo/keto reductase  35.4 
 
 
360 aa  179  7e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0693  aldo/keto reductase  37.77 
 
 
338 aa  179  8e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  38.19 
 
 
338 aa  178  9e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  37.15 
 
 
327 aa  179  9e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0735  aldo/keto reductase  37.15 
 
 
338 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  36.34 
 
 
332 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3824  aldo/keto reductase  40 
 
 
339 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2281  aldo/keto reductase  36.67 
 
 
312 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000892258  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1306  aldo/keto reductase  35.21 
 
 
346 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2528  aldo/keto reductase  36.16 
 
 
343 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5935  aldo/keto reductase  37.69 
 
 
314 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.431084  normal  0.0103117 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1049  aldo/keto reductase  35.37 
 
 
323 aa  177  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  36.01 
 
 
349 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>