More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5688 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5688  aldo/keto reductase  100 
 
 
321 aa  656    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.871424 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0085  putative norsolorinic acid reductase  46.3 
 
 
348 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0524  aldo/keto reductase  46.08 
 
 
351 aa  292  5e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0538  aldo/keto reductase  45.32 
 
 
350 aa  291  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1189  aldo/keto reductase  45.18 
 
 
349 aa  287  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.712785  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3492  aldo/keto reductase  43.98 
 
 
349 aa  278  8e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4534  aldo/keto reductase  42.73 
 
 
346 aa  267  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00676979 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2932  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  44.27 
 
 
335 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0453646  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0701  aldo/keto reductase  41.72 
 
 
348 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3365  aldo/keto reductase  41.93 
 
 
336 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0948  putative aldo/keto reductase  42.3 
 
 
360 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.738715  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1178  aldo/keto reductase  40.73 
 
 
353 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3226  aldo/keto reductase  41.64 
 
 
345 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4577  aldo/keto reductase  41.54 
 
 
353 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871786  normal  0.194058 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1447  aldo/keto reductase  37.42 
 
 
351 aa  238  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0652704  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4192  aldo/keto reductase  39.21 
 
 
338 aa  223  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.957663  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0240  aldo/keto reductase  38.97 
 
 
340 aa  222  7e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.628771 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14220  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  36.92 
 
 
354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.982518  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3467  aldo/keto reductase  37.42 
 
 
361 aa  212  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.648507  normal  0.107464 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1473  aldo/keto reductase  39.01 
 
 
345 aa  209  6e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0111458  normal  0.642292 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  38.65 
 
 
358 aa  208  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  37.27 
 
 
335 aa  195  9e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7438  aldo/keto reductase  38.17 
 
 
360 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.798482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  36.05 
 
 
353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2358  aldo/keto reductase  38.6 
 
 
331 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0956157 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  36.17 
 
 
349 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  38.32 
 
 
344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  38.32 
 
 
389 aa  180  4e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  35.54 
 
 
347 aa  179  7e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4145  aldo/keto reductase  38.24 
 
 
332 aa  179  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.128845 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  38.69 
 
 
344 aa  179  8e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4794  aldo/keto reductase  36.05 
 
 
336 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  37.07 
 
 
352 aa  176  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4943  aldo/keto reductase  38.73 
 
 
332 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01616  conserved hypothetical protein  33.9 
 
 
404 aa  176  6e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.178655 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2659  aldo/keto reductase  33.43 
 
 
326 aa  176  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0194115  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  35.82 
 
 
341 aa  176  6e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3993  oxidoreductase  35.84 
 
 
365 aa  176  7e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  36.96 
 
 
355 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4424  aldo/keto reductase  37.92 
 
 
335 aa  175  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00178858  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4044  aldo/keto reductase  37.54 
 
 
344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  36.65 
 
 
350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0524  aldo/keto reductase  34.14 
 
 
359 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0217  putative oxidoreductase  38.62 
 
 
331 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5694  aldo/keto reductase  34.51 
 
 
351 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  35.76 
 
 
357 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6058  aldo/keto reductase  34.51 
 
 
351 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0839954  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  35.98 
 
 
352 aa  171  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3629  aldo/keto reductase  36.61 
 
 
344 aa  170  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0520546 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  34.22 
 
 
351 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6327  aldo/keto reductase  36.14 
 
 
340 aa  169  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.563142  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  36.34 
 
 
345 aa  169  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  36.25 
 
 
343 aa  168  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  34.71 
 
 
345 aa  168  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  35.48 
 
 
334 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  35.06 
 
 
327 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7100  aldo/keto reductase  36.81 
 
 
331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.9082  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  36.06 
 
 
325 aa  166  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  34.02 
 
 
351 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4663  aldo/keto reductase  33.63 
 
 
349 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4531  aldo/keto reductase  33.63 
 
 
349 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.773631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  35 
 
 
349 aa  166  5e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  34.25 
 
 
345 aa  166  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  33.86 
 
 
328 aa  166  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05887  hypothetical aryl alcohol dehydrogenase (Eurofung)  31.69 
 
 
384 aa  165  9e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.238993  normal  0.631542 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  35.2 
 
 
351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  33.73 
 
 
370 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0462  aldo/keto reductase  35.87 
 
 
333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147038  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3210  aldo/keto reductase  39.29 
 
 
342 aa  163  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0255002 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  34.14 
 
 
344 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  33.04 
 
 
349 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  34.12 
 
 
343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  33.43 
 
 
338 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4075  aldo/keto reductase  35.33 
 
 
342 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4151  aldo/keto reductase  35.33 
 
 
342 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4305  aldo/keto reductase  35.33 
 
 
342 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0836372  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  34.44 
 
 
348 aa  161  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1763  aldo/keto reductase  34.04 
 
 
341 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  33.33 
 
 
358 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  35.29 
 
 
339 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0072  aldo/keto reductase  35.33 
 
 
342 aa  161  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2324  aldo/keto reductase  36.65 
 
 
326 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.7501  hitchhiker  0.00552953 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3015  putative oxidoreductase, MocA  38.03 
 
 
341 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  34.26 
 
 
344 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  35.29 
 
 
339 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3505  aldo/keto reductase  38.52 
 
 
344 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4249  aldo/keto reductase  38.33 
 
 
343 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.615627  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  36.42 
 
 
343 aa  160  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1427  aldo/keto reductase  37.11 
 
 
341 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  34.63 
 
 
326 aa  159  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6423  aldo/keto reductase  33.03 
 
 
339 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251084  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  33.93 
 
 
349 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  36.13 
 
 
326 aa  159  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5690  aldo/keto reductase  35.02 
 
 
326 aa  159  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0442358  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0488  aldo/keto reductase  33.63 
 
 
368 aa  159  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.807596  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0526  aldo/keto reductase  34.26 
 
 
341 aa  159  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51564  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  34.04 
 
 
340 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3663  aldo/keto reductase  38.52 
 
 
344 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1954  aldo/keto reductase  38.61 
 
 
349 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.464115  normal  0.0603236 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3594  aldo/keto reductase  38.52 
 
 
344 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>