More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3993 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3993  oxidoreductase  100 
 
 		 365 aa  742    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0488  aldo/keto reductase  54.25 
 
 		 368 aa  383  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.807596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  46.41 
 
 		 358 aa  331  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3467  aldo/keto reductase  46.83 
 
 		 361 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.648507  normal  0.107464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4577  aldo/keto reductase  44.9 
 
 		 353 aa  285  5.999999999999999e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.871786  normal  0.194058 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1178  aldo/keto reductase  43.8 
 
 		 353 aa  284  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3226  aldo/keto reductase  46.75 
 
 		 345 aa  275  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7438  aldo/keto reductase  43.19 
 
 		 360 aa  258  9e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.798482 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12040  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  41.64 
 
 		 343 aa  246  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6594  aldo/keto reductase  41.11 
 
 		 343 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.688437  hitchhiker  0.0000922081 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5670  aldo/keto reductase  40.82 
 
 		 343 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300824  normal  0.0449862 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5658  aldo/keto reductase  40.52 
 
 		 343 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  42.69 
 
 		 343 aa  242  7.999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3629  aldo/keto reductase  43.27 
 
 		 344 aa  234  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0520546 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  40.75 
 
 		 352 aa  233  5e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4534  aldo/keto reductase  40 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00676979 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  39.83 
 
 		 351 aa  229  4e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  41.69 
 
 		 344 aa  229  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  40.06 
 
 		 343 aa  227  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1447  aldo/keto reductase  39.41 
 
 		 351 aa  224  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0652704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4943  aldo/keto reductase  38.87 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  40.17 
 
 		 355 aa  222  8e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0085  putative norsolorinic acid reductase  39.5 
 
 		 348 aa  220  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1473  aldo/keto reductase  39.82 
 
 		 345 aa  219  6e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0111458  normal  0.642292 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3492  aldo/keto reductase  39.26 
 
 		 349 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4192  aldo/keto reductase  37.13 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.957663  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3180  aldo/keto reductase  38.79 
 
 		 345 aa  217  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.877105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6622  aldo/keto reductase  36.9 
 
 		 358 aa  216  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.171856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6593  aldo/keto reductase  37.54 
 
 		 338 aa  216  7e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1189  aldo/keto reductase  39.71 
 
 		 349 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.712785  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7154  aldo/keto reductase  38.81 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4424  aldo/keto reductase  38.3 
 
 		 335 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00178858  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0948  putative aldo/keto reductase  39.52 
 
 		 360 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.738715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5127  aldo/keto reductase  40.06 
 
 		 345 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  37.28 
 
 		 354 aa  213  5.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14220  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  40.4 
 
 		 354 aa  212  7e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.982518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  38.22 
 
 		 352 aa  212  9e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3268  aldo/keto reductase  39.49 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2735  aldo/keto reductase  38.29 
 
 		 344 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0603  aldo/keto reductase  38 
 
 		 345 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0240  aldo/keto reductase  37.84 
 
 		 340 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.628771 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0524  aldo/keto reductase  37.36 
 
 		 351 aa  211  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0538  aldo/keto reductase  38.57 
 
 		 350 aa  211  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2914  aldo/keto reductase  39.2 
 
 		 345 aa  210  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4161  aldo/keto reductase  39.48 
 
 		 344 aa  210  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  38.07 
 
 		 349 aa  209  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0554  aldo/keto reductase  38.18 
 
 		 341 aa  209  6e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.243293 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3852  aldo/keto reductase  39.48 
 
 		 389 aa  209  7e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.697779  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4309  aldo/keto reductase  39.14 
 
 		 344 aa  209  8e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.17774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2808  aldo/keto reductase  38.97 
 
 		 344 aa  208  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.191746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1154  oxidoreductase  37.82 
 
 		 349 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.185514 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4856  aldo/keto reductase  39.94 
 
 		 343 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3340  aldo/keto reductase  38.72 
 
 		 343 aa  207  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.958054  normal  0.0837708 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2549  aldo/keto reductase  38.4 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943239 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2932  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  39.3 
 
 		 335 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0453646  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4826  aldo/keto reductase  39.2 
 
 		 345 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3340  aldo/keto reductase  39.2 
 
 		 345 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2813  aldo/keto reductase  37.86 
 
 		 349 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00980112  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4175  aldo/keto reductase  39.2 
 
 		 345 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.530522  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3716  aldo/keto reductase  37.46 
 
 		 322 aa  206  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6537  aldo/keto reductase  39.47 
 
 		 335 aa  206  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.880727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0804  aldo/keto reductase  37.71 
 
 		 348 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.825748  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  35.21 
 
 		 334 aa  204  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2475  aldo/keto reductase  38.48 
 
 		 327 aa  203  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3045  aldo/keto reductase  36.58 
 
 		 326 aa  203  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.686286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  38.29 
 
 		 349 aa  202  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4044  aldo/keto reductase  37.07 
 
 		 344 aa  202  6e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  37.68 
 
 		 353 aa  202  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5452  aldo/keto reductase  37.57 
 
 		 350 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.447923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4686  aldo/keto reductase  36.16 
 
 		 342 aa  201  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0328236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5726  aldo/keto reductase  39.37 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.2086 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1790  aldo/keto reductase  36.73 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0366045 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  35.14 
 
 		 352 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0195  aldo/keto reductase  35.8 
 
 		 338 aa  199  5e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  37.92 
 
 		 345 aa  199  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6431  aldo/keto reductase  36.21 
 
 		 324 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6124  aldo/keto reductase  36.87 
 
 		 326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.516846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0524  aldo/keto reductase  36.78 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  35.14 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4437  putative oxidoreductase  38.04 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3129  aldo/keto reductase  37.76 
 
 		 325 aa  197  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2911  aldo/keto reductase  39.35 
 
 		 343 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.187668  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3505  aldo/keto reductase  38.92 
 
 		 344 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5453  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  33.98 
 
 		 335 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2915  aldo/keto reductase  35.47 
 
 		 337 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1427  aldo/keto reductase  38.51 
 
 		 341 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6644  aldo/keto reductase  36.78 
 
 		 342 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000695523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3379  aldo/keto reductase  36.73 
 
 		 325 aa  196  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0374  aldo/keto reductase  36.99 
 
 		 337 aa  195  8.000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6073  aldo/keto reductase  36.42 
 
 		 328 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114042  normal  0.744467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.15 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0071932  normal  0.188879 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5007  aldo/keto reductase  34.58 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3015  putative oxidoreductase, MocA  38.22 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2556  aldo/keto reductase  36.44 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2226  aldo/keto reductase  38.58 
 
 		 323 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0110  aldo/keto reductase  35.29 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.199403 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  37.25 
 
 		 350 aa  194  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1549  aldo/keto reductase  36.8 
 
 		 326 aa  194  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.886416  normal  0.340196 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1321  aldo/keto reductase  36.87 
 
 		 326 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.446153 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0379  aldo/keto reductase  38.02 
 
 		 314 aa  193  4e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0161187  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>