More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA1258 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA1258  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  100 
 
 
327 aa  661    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.185464  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1975  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  100 
 
 
327 aa  661    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1741  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  99.69 
 
 
327 aa  659    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.994489  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0151  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  100 
 
 
327 aa  661    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.191769  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1806  oxidoreductase, NAD-binding  99.69 
 
 
327 aa  658    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.677561  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1822  oxidoreductase, NAD-binding  100 
 
 
327 aa  661    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1015  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  100 
 
 
327 aa  661    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2514  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  93.58 
 
 
327 aa  568  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0152325  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4693  oxidoreductase  78.15 
 
 
328 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.454342  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1527  oxidoreductase domain-containing protein  77.23 
 
 
328 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.727189 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1473  oxidoreductase domain-containing protein  80.31 
 
 
328 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1452  oxidoreductase domain-containing protein  80.31 
 
 
328 aa  490  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1071  oxidoreductase-like  76.92 
 
 
328 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1551  oxidoreductase domain-containing protein  76.92 
 
 
328 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1681  oxidoreductase domain-containing protein  79.45 
 
 
328 aa  475  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0855152 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1726  oxidoreductase domain protein  71.52 
 
 
348 aa  448  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2511  oxidoreductase  69.94 
 
 
348 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1666  oxidoreductase domain-containing protein  69.04 
 
 
334 aa  435  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0263052 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  33.84 
 
 
328 aa  168  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  37.35 
 
 
334 aa  163  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  33.44 
 
 
327 aa  162  8.000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  32.51 
 
 
354 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  35.98 
 
 
329 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  31.52 
 
 
327 aa  153  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  34.63 
 
 
329 aa  149  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  31.1 
 
 
321 aa  143  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  32 
 
 
319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  30.29 
 
 
327 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  33.53 
 
 
356 aa  137  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  31.83 
 
 
328 aa  136  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  27.91 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  32.02 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  29.79 
 
 
324 aa  132  6e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  31.38 
 
 
331 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  35.29 
 
 
352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  29.79 
 
 
323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  35.67 
 
 
379 aa  129  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  32.52 
 
 
342 aa  129  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  33.13 
 
 
334 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  34.03 
 
 
357 aa  125  9e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  36.09 
 
 
354 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  31.27 
 
 
362 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  35.89 
 
 
333 aa  123  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  32.24 
 
 
336 aa  123  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  30.22 
 
 
321 aa  122  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  32.21 
 
 
338 aa  122  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1593  oxidoreductase domain-containing protein  32.51 
 
 
332 aa  122  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2075  Trans-1,2-dihydrobenzene-1,2-diol dehydrogenase  28.27 
 
 
332 aa  122  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  26.91 
 
 
320 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  36.11 
 
 
338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  32.11 
 
 
346 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  31.52 
 
 
349 aa  119  6e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  31.52 
 
 
345 aa  119  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26160  predicted dehydrogenase  34.67 
 
 
358 aa  119  9e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0688077  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2588  cytidyltransferase-related domain protein  30.22 
 
 
447 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  34.26 
 
 
338 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  30.75 
 
 
352 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  33.67 
 
 
358 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  28.96 
 
 
323 aa  112  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  30.45 
 
 
356 aa  112  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  29.78 
 
 
359 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  28.16 
 
 
451 aa  112  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  27.83 
 
 
326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  34.35 
 
 
360 aa  110  3e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.37 
 
 
349 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.06 
 
 
349 aa  109  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  28.65 
 
 
667 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  32.21 
 
 
335 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  24.44 
 
 
370 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 
667 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  27.38 
 
 
329 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  32.81 
 
 
341 aa  106  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  26.63 
 
 
327 aa  106  6e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1210  putative NADP or NAD utilising oxidoreductase  28.14 
 
 
331 aa  104  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0327  oxidoreductase domain-containing protein  32.5 
 
 
322 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.36589  hitchhiker  0.000842403 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  28.87 
 
 
665 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  28.29 
 
 
667 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.99 
 
 
338 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  30.17 
 
 
670 aa  102  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  25.73 
 
 
349 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  32.75 
 
 
338 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29330  oxidoreductase (Bacterial)  26.97 
 
 
361 aa  98.6  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05123  dimeric dihydrodiol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07520)  27.78 
 
 
388 aa  97.4  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  27.76 
 
 
331 aa  97.4  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00036  conserved hypothetical protein  27.78 
 
 
366 aa  95.5  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.448897  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0476  oxidoreductase domain protein  32.59 
 
 
338 aa  95.5  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0535  oxidoreductase domain protein  27.6 
 
 
332 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0565  oxidoreductase-like  37.96 
 
 
329 aa  94  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00933503 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  30.53 
 
 
327 aa  93.6  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2702  oxidoreductase domain protein  24.01 
 
 
329 aa  93.6  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.832621  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4316  oxidoreductase domain-containing protein  28.11 
 
 
326 aa  92.4  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  28.38 
 
 
343 aa  92.4  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1542  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.11 
 
 
318 aa  90.9  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  29.86 
 
 
342 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0408  dehydrogenase or related protein  27.23 
 
 
335 aa  91.3  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1809  oxidoreductase domain-containing protein  24.39 
 
 
324 aa  91.7  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598739  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2218  oxidoreductase domain-containing protein  36.28 
 
 
337 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3183  oxidoreductase domain-containing protein  34.53 
 
 
305 aa  89.7  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36454  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4196  oxidoreductase domain protein  33.23 
 
 
322 aa  89.4  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.754569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>