More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3183 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3183  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 		 305 aa  592  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  26.1 
 
 		 320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  31.29 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.94 
 
 		 349 aa  108  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4693  oxidoreductase  33.33 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.454342  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1258  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.53 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.185464  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1975  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.53 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1741  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.53 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.994489  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0151  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.53 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.191769  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1806  oxidoreductase, NAD-binding  34.53 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.677561  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1822  oxidoreductase, NAD-binding  34.53 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1015  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  34.53 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  37.19 
 
 		 356 aa  105  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1071  oxidoreductase-like  33.44 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1551  oxidoreductase domain-containing protein  33.44 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1527  oxidoreductase domain-containing protein  31.44 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.727189 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1726  oxidoreductase domain protein  31.08 
 
 		 348 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  31.9 
 
 		 329 aa  99.4  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2514  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.61 
 
 		 327 aa  98.2  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0152325  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2511  oxidoreductase  31.2 
 
 		 348 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1452  oxidoreductase domain-containing protein  33.56 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1473  oxidoreductase domain-containing protein  33.22 
 
 		 328 aa  94.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  30.84 
 
 		 359 aa  92.4  9e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  27.65 
 
 		 332 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  26.98 
 
 		 327 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  36.36 
 
 		 356 aa  92  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  30.81 
 
 		 321 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  29.5 
 
 		 329 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1681  oxidoreductase domain-containing protein  32.88 
 
 		 328 aa  90.1  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0855152 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  31.32 
 
 		 333 aa  89.4  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1666  oxidoreductase domain-containing protein  31.53 
 
 		 334 aa  89.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0263052 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  29.39 
 
 		 336 aa  89.4  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  29.89 
 
 		 329 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  30.32 
 
 		 352 aa  86.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  28.52 
 
 		 362 aa  86.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  24.3 
 
 		 354 aa  86.3  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  27.4 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  37.85 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  31.68 
 
 		 338 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  34.25 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  29.35 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  25.71 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  31.14 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  32.71 
 
 		 358 aa  82.8  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  31.69 
 
 		 323 aa  82.8  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  24.56 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  28.47 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  39.2 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0476  oxidoreductase domain protein  32.73 
 
 		 338 aa  81.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  33.83 
 
 		 335 aa  81.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3563  oxidoreductase domain protein  32.99 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  27.3 
 
 		 667 aa  80.1  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  28.85 
 
 		 667 aa  79.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  23.78 
 
 		 370 aa  79  0.00000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  30.58 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0150  oxidoreductase  32.98 
 
 		 328 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  25.62 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  30.69 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  31.07 
 
 		 667 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1333  oxidoreductase domain protein  40.77 
 
 		 665 aa  77.4  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.157894 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2588  cytidyltransferase-related domain protein  28.93 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  27.64 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4279  oxidoreductase domain protein  27.44 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.755394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  32.8 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3495  oxidoreductase domain-containing protein  33.16 
 
 		 328 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1646  dehydrogenase related protein  25.18 
 
 		 324 aa  74.3  0.000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  27.66 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1593  oxidoreductase domain-containing protein  28.52 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  27.15 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  28.76 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00036  conserved hypothetical protein  29.29 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.448897  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3785  oxidoreductase domain-containing protein  31.51 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208707 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1214  oxidoreductase-like protein  25.68 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4544  oxidoreductase domain protein  31.05 
 
 		 328 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48499  normal  0.997727 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  33.49 
 
 		 670 aa  71.2  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1542  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.04 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  40 
 
 		 665 aa  70.5  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  26.6 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2075  Trans-1,2-dihydrobenzene-1,2-diol dehydrogenase  23.94 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  29.15 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0041  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.59 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  25.45 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4260  oxidoreductase domain protein  29.8 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.386178  normal  0.399904 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1476  oxidoreductase-like protein  31.07 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.408484 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  30.61 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0531  oxidoreductase domain protein  28.64 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4370  oxidoreductase domain protein  29.8 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.999516  normal  0.460819 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0338  oxidoreductase domain-containing protein  34.12 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  27.07 
 
 		 667 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0678  oxidoreductase-like  30.53 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368892  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  29.33 
 
 		 451 aa  67.4  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  32.98 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  27.45 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3398  oxidoreductase-like  38.52 
 
 		 326 aa  67  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4277  oxidoreductase domain-containing protein  28.78 
 
 		 325 aa  67  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4175  oxidoreductase domain protein  30.47 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112038  hitchhiker  0.000326042 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  31.02 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  25.61 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>