More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2205 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2205  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 323 aa  615  1e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159283  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  45.37 
 
 		 1080 aa  272  7e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5611  glycosyl transferase group 1  45.2 
 
 		 1079 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.115035 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2206  oxidoreductase domain protein  49.67 
 
 		 316 aa  246  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.024069  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0335  oxidoreductase domain protein  52.32 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485901  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3904  oxidoreductase-like protein  43.49 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3978  oxidoreductase domain-containing protein  43.49 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3919  oxidoreductase domain-containing protein  43.17 
 
 		 324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0709512  normal  0.0805362 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0541  oxidoreductase domain protein  31.49 
 
 		 354 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1495  oxidoreductase domain-containing protein  29 
 
 		 344 aa  109  6e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0319265  normal  0.994285 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4139  oxidoreductase-like  31.12 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000162598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1215  oxidoreductase domain-containing protein  33.19 
 
 		 368 aa  100  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2267  oxidoreductase domain protein  37.5 
 
 		 330 aa  97.4  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.187377  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2602  oxidoreductase domain protein  32.02 
 
 		 350 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0740298 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3241  oxidoreductase domain-containing protein  32.02 
 
 		 350 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.18699  normal  0.554921 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6100  oxidoreductase domain-containing protein  32.89 
 
 		 345 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.402004 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3123  oxidoreductase domain-containing protein  32.02 
 
 		 350 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3811  oxidoreductase domain protein  33.04 
 
 		 358 aa  94.7  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.247991  normal  0.0981542 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  29.69 
 
 		 382 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_3639  myo-inositol 2-dehydrogenase putative  34.59 
 
 		 347 aa  94  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1596  oxidoreductase domain protein  24.19 
 
 		 341 aa  93.6  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  31.09 
 
 		 359 aa  92.4  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  31.48 
 
 		 353 aa  92.4  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  31.09 
 
 		 355 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30210  oxidoreductase protein  33.19 
 
 		 352 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0256  oxidoreductase-like  31.75 
 
 		 368 aa  90.5  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2148  oxidoreductase domain-containing protein  32.02 
 
 		 350 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.896351  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1244  oxidoreductase-like  27.58 
 
 		 349 aa  90.5  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  31.44 
 
 		 381 aa  90.1  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4503  oxidoreductase domain protein  27.71 
 
 		 345 aa  89.7  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  32.51 
 
 		 353 aa  87.4  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  29.14 
 
 		 377 aa  87  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0085  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.15 
 
 		 335 aa  86.7  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 		 384 aa  86.7  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  29.96 
 
 		 376 aa  86.3  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  28.78 
 
 		 377 aa  85.9  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3468  oxidoreductase domain protein  26.55 
 
 		 345 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1046  oxidoreductase domain protein  32.91 
 
 		 342 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0917  oxidoreductase domain protein  29.65 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.441331  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  36.65 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3352  myo-inositol 2-dehydrogenase  31.82 
 
 		 329 aa  84.3  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977173  normal  0.304593 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4484  oxidoreductase-like  28.21 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418021  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  30.9 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  27.88 
 
 		 359 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  30.47 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4053  oxidoreductase domain protein  24.62 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  27.49 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  32.08 
 
 		 326 aa  83.2  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  26.5 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  29.33 
 
 		 326 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  28.88 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  36.98 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  26.28 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0506  oxidoreductase domain-containing protein  28.29 
 
 		 334 aa  82.4  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0646765  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  35.45 
 
 		 340 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  27.5 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  29.9 
 
 		 381 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0546  oxidoreductase domain protein  26.86 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1805  inositol 2-dehydrogenase  31.68 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.801382 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3968  inositol 2-dehydrogenase  33.2 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.185357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2203  oxidoreductase domain-containing protein  32.63 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.345355  normal  0.953856 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  28.15 
 
 		 377 aa  80.5  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2680  oxidoreductase domain-containing protein  33.05 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4507  oxidoreductase domain protein  29.29 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0146  Inositol 2-dehydrogenase  31.28 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2329  inositol 2-dehydrogenase  34.85 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0074  myo-inositol 2-dehydrogenase  30.4 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  29.86 
 
 		 349 aa  79.7  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7086  oxidoreductase domain protein  30.34 
 
 		 353 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2613  inositol 2-dehydrogenase  31.54 
 
 		 338 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0349  oxidoreductase domain protein  28.26 
 
 		 350 aa  79.3  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2334  oxidoreductase domain protein  25.63 
 
 		 366 aa  79.3  0.00000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  30.65 
 
 		 369 aa  79  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.83 
 
 		 382 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4435  oxidoreductase domain-containing protein  32.3 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.497485 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0711  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.62 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.727119  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1576  dehydrogenase  28.33 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0256793  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  27.86 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  28.43 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1447  oxidoreductase domain protein  33.85 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0737599 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4498  oxidoreductase-like  30.7 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.39191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0488  inositol 2-dehydrogenase  30.27 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.21041 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0667  myo-inositol 2-dehydrogenase  28.36 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02930  putative oxidoreductase  28.45 
 
 		 347 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00065533 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4818  oxidoreductase domain protein  33.21 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.032332  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  27.7 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2828  inositol 2-dehydrogenase  27.69 
 
 		 330 aa  76.6  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  28.01 
 
 		 377 aa  75.9  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  29.5 
 
 		 342 aa  75.9  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  28.01 
 
 		 377 aa  75.9  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  26.72 
 
 		 385 aa  75.9  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1930  oxidoreductase domain protein  28.68 
 
 		 355 aa  75.9  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4111  oxidoreductase-like  27.43 
 
 		 360 aa  75.9  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.740502 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5946  oxidoreductase domain protein  26.59 
 
 		 355 aa  75.9  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0234266 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0056  inositol 2-dehydrogenase  28.71 
 
 		 389 aa  75.9  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  28.01 
 
 		 377 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  23.51 
 
 		 347 aa  74.3  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  31.82 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  23.71 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  30.04 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>