More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6301 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6301  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
428 aa  882    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.322189 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3256  glycosyl transferase group 1  45.08 
 
 
414 aa  291  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0509523  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2368  glycosyl transferase group 1  39.37 
 
 
409 aa  280  4e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.374877  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4958  glycosyl transferase group 1  34.74 
 
 
419 aa  242  9e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0890  a-glycosyltransferase  32.94 
 
 
420 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247924  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2761  glycosyl transferase group 1  29.09 
 
 
419 aa  146  7.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.399192  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0380  glycosyl transferase group 1  27.56 
 
 
391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.941  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5787  glycosyl transferase group 1  31.14 
 
 
415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0364  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.74 
 
 
412 aa  110  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3374  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 
408 aa  109  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0766435  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0421  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.23 
 
 
411 aa  109  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0822776  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3341  glycosyl transferase, group 1  28.08 
 
 
426 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.178171  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2612  glycosyl transferase group 1  36.36 
 
 
407 aa  98.6  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.198557 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05800  glycosyltransferase  31.02 
 
 
437 aa  98.2  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.504823  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1121  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 
386 aa  95.1  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.606067  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  39.29 
 
 
371 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1818  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
382 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  26.84 
 
 
426 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 
396 aa  77.8  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1382  glycosyltransferase-like protein  27.31 
 
 
387 aa  77.4  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.702037  normal  0.362808 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  33.73 
 
 
372 aa  76.6  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 
346 aa  75.9  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2186  glycosyl transferase group 1  28.93 
 
 
378 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1006  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 
382 aa  73.9  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0868  a-glycosyltransferase  26.21 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0630159 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2630  glycosyl transferase group 1  29.67 
 
 
438 aa  73.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.451665  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3577  glycosyl transferase group 1  31.87 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4579  glycosyl transferase, group 1  34.17 
 
 
398 aa  73.2  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0122865  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  43.53 
 
 
426 aa  72.4  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2150  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
437 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1077  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 
402 aa  72  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000145174 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4918  group 1 glycosyl transferase  30.77 
 
 
366 aa  72  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 
410 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4917  group 1 glycosyl transferase  23.66 
 
 
422 aa  71.2  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05710  glycosyltransferase  29.57 
 
 
379 aa  70.9  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4202  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.75 
 
 
364 aa  70.5  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
381 aa  70.5  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 
364 aa  70.5  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2157  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
385 aa  70.1  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750957  normal  0.801991 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  26.07 
 
 
358 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  27.1 
 
 
346 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  34 
 
 
378 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  40.18 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0025  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 
374 aa  68.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  29.07 
 
 
401 aa  67.8  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0230  glycosyl transferase, group 1  30.32 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.264072 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0383  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 
373 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  34.87 
 
 
401 aa  67  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  25.55 
 
 
364 aa  67  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  35.9 
 
 
411 aa  66.6  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  28.27 
 
 
414 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4961  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
396 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  28.48 
 
 
373 aa  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0170  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 
391 aa  66.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  33.61 
 
 
392 aa  66.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  30.67 
 
 
363 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 
364 aa  66.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 
409 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1964  glycosyl transferase group 1  46.75 
 
 
385 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014923 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4328  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.74 
 
 
381 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00438832  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6235  glycosyl transferase group 1  29.29 
 
 
381 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93613  normal  0.352956 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
380 aa  65.1  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  31.51 
 
 
378 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  28.67 
 
 
386 aa  65.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2654  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 
381 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.814437  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 
360 aa  65.1  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  27.91 
 
 
386 aa  65.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2334  glycosyl transferase, group 1  32.28 
 
 
376 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0688579  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.84 
 
 
396 aa  64.7  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  30.57 
 
 
392 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6431  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
380 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 
392 aa  64.3  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  20.85 
 
 
402 aa  64.3  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  26.47 
 
 
381 aa  64.3  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 
375 aa  64.3  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  30.61 
 
 
365 aa  64.3  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  30.64 
 
 
378 aa  63.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 
377 aa  63.5  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0056  glycosyl transferase group 1  30.41 
 
 
363 aa  63.2  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.368795 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2058  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
452 aa  63.2  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0147128  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 
398 aa  63.2  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  31.18 
 
 
396 aa  63.2  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5459  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 
660 aa  63.2  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 
376 aa  62.8  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2279  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 
373 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  26.86 
 
 
412 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  23.38 
 
 
373 aa  62.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0635  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 
375 aa  62.8  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.25395  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 
398 aa  62.4  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3530  glycosyl transferase group 1  36.43 
 
 
385 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000188303  hitchhiker  0.00829445 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6015  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 
384 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.44691 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 
346 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 
377 aa  62.4  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0557  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 
377 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  24.76 
 
 
364 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6549  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 
427 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1109  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.83 
 
 
380 aa  62  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>