More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1400 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1400  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
571 aa  1187    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1374  glycosyl transferase group 1  37.35 
 
 
615 aa  233  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0108808  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0251  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
406 aa  99.8  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000777332  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0891  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
332 aa  99  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1471  glycosyl transferase group 1  24.63 
 
 
383 aa  97.4  6e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.630233  normal  0.0889822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4642  glycosyl transferase group 1  24.13 
 
 
364 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486354  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3220  glycosyl transferase, group 1  24.15 
 
 
364 aa  87.8  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0889  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3880  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 
366 aa  84  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  42.2 
 
 
370 aa  82  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  24.66 
 
 
1152 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  24.66 
 
 
1152 aa  81.6  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  37.9 
 
 
423 aa  80.9  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3180  glycosyl transferase, group 1  38.79 
 
 
409 aa  80.9  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.780891  normal  0.107104 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  40.54 
 
 
388 aa  80.1  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  39.29 
 
 
382 aa  79  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4226  glycosyl transferase group 1  36.11 
 
 
370 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1744  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
343 aa  78.6  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2688  glycosyl transferase group 1  32.71 
 
 
387 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.504834  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 
375 aa  75.5  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1061  glycosyltransferase  22.48 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
414 aa  75.1  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  35.96 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0953  galactosyltransferase  31.14 
 
 
371 aa  74.3  0.000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.796429  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 
361 aa  73.6  0.000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  35.96 
 
 
395 aa  73.2  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  34.86 
 
 
422 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3927  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
366 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.273461 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2502  glycosyl transferase, group 1  32.71 
 
 
387 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.417702 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5485  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 
417 aa  72.8  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  33.86 
 
 
412 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 
386 aa  71.6  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0010  glycosyl transferase, group 1  39.25 
 
 
467 aa  71.2  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.785418  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0012  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 
458 aa  71.6  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 
419 aa  71.6  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  35.05 
 
 
370 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0296  glycosyl transferase, group 1  39.39 
 
 
346 aa  70.1  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  38.1 
 
 
446 aa  69.7  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0377  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 
378 aa  69.7  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0289897  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  36.7 
 
 
374 aa  70.1  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.29 
 
 
360 aa  70.1  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  28.96 
 
 
392 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1961  glycosyl transferase group 1  32.46 
 
 
350 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  33.86 
 
 
412 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  33.86 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  31.43 
 
 
381 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4232  glycosyl transferase, group 1  31.17 
 
 
390 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000972759 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2594  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 
421 aa  68.2  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 
422 aa  68.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  35.45 
 
 
351 aa  67.8  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0496  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  35.85 
 
 
405 aa  67.8  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1147  glycosyltransferase  21.75 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000216954  hitchhiker  0.0000000335668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  29.27 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  35.48 
 
 
439 aa  67.8  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2376  glycosyl transferase group 1  36.73 
 
 
372 aa  67.4  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 
374 aa  67  0.0000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  33.33 
 
 
404 aa  67  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1099  glycosyl transferase, group 1  33.63 
 
 
411 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.593469  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  34.51 
 
 
408 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2676  glycosyl transferase, group 1  26.22 
 
 
372 aa  66.6  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00158142  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  34.82 
 
 
1261 aa  66.6  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  34.51 
 
 
408 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 
419 aa  66.6  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  35.48 
 
 
377 aa  66.6  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0120  glycosyl transferase group 1  34.82 
 
 
393 aa  66.6  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000209107 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
393 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  34.51 
 
 
408 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.03 
 
 
382 aa  65.9  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0461  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
390 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  36.36 
 
 
358 aa  65.9  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5718  glycosyl transferase, group 1  34.51 
 
 
411 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 
415 aa  66.2  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 
370 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.78 
 
 
361 aa  65.5  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  24.16 
 
 
379 aa  65.5  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  37.89 
 
 
353 aa  65.5  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  32.14 
 
 
353 aa  65.1  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0890  a-glycosyltransferase  37.76 
 
 
420 aa  65.5  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0247924  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  38.95 
 
 
371 aa  65.1  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  32.14 
 
 
408 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 
426 aa  65.1  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  27.71 
 
 
375 aa  64.7  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0276  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 
342 aa  65.1  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.949437  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  36.21 
 
 
357 aa  65.1  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21071  hypothetical protein  36.36 
 
 
1232 aa  65.1  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  37.62 
 
 
394 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  31.9 
 
 
371 aa  64.3  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3098  glycosyl transferase group 1  36.61 
 
 
363 aa  64.3  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 
380 aa  64.3  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  33.04 
 
 
397 aa  64.3  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.31 
 
 
360 aa  63.9  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  25.66 
 
 
417 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  29.92 
 
 
448 aa  63.9  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0012  a-glycosyltransferase  33 
 
 
379 aa  63.9  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  35.05 
 
 
435 aa  63.9  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  25.32 
 
 
419 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  36.08 
 
 
434 aa  63.9  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0355  glycosyl transferase, group 1  34.19 
 
 
415 aa  63.9  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>