More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4526 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4526  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 419 aa  849    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.251401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 		 299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.87 
 
 		 312 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  32.87 
 
 		 672 aa  106  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  33.82 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.5 
 
 		 312 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  32.86 
 
 		 313 aa  104  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 		 597 aa  104  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  33.17 
 
 		 235 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  34.98 
 
 		 544 aa  103  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  37.88 
 
 		 320 aa  101  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3100  glycosyl transferase family protein  36.02 
 
 		 325 aa  99.8  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0346657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  33.17 
 
 		 847 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2672  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 316 aa  97.1  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.650455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1235  glycosyl transferase family protein  33.51 
 
 		 249 aa  95.9  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2461  glycosyl transferase family 2  32.85 
 
 		 289 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0660635  normal  0.806604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  34.22 
 
 		 268 aa  95.5  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1566  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 		 333 aa  95.5  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 331 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 		 1035 aa  94.4  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1853  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.61 
 
 		 274 aa  94  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00329609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  33.85 
 
 		 324 aa  92.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3362  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 		 235 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0060739  normal  0.350588 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  31.75 
 
 		 276 aa  92.4  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 		 302 aa  92.8  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2372  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 		 294 aa  90.9  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 		 352 aa  90.5  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 		 305 aa  90.1  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 		 321 aa  90.1  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 		 318 aa  89.7  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  29.77 
 
 		 303 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  30.05 
 
 		 275 aa  89.4  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0306  glycosyl transferase family protein  24.34 
 
 		 268 aa  89.4  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 		 310 aa  89  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 		 1250 aa  88.6  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  30.18 
 
 		 230 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  33.68 
 
 		 338 aa  87.8  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  35.65 
 
 		 983 aa  86.7  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  34.97 
 
 		 334 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  29.57 
 
 		 373 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  30.15 
 
 		 310 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  28.42 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1493  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 		 286 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.948959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 450 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 		 1032 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1381  glycosyl transferase family protein  35.18 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4618  glycosyl transferase family protein  34.27 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0203998 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  30.28 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 		 324 aa  84.3  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2799  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  27.46 
 
 		 392 aa  83.6  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2365  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  31.92 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  28.16 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  25.46 
 
 		 746 aa  82.4  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4042  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 		 358 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.625584  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  29.19 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3955  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2345  glycosyl transferase family protein  30.12 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 		 704 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  29.27 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3090  glycosyl transferase family protein  32.68 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.933883  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1642  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 297 aa  81.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3248  glycosyl transferase family 2  32.59 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.6 
 
 		 341 aa  80.5  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  30.95 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 		 812 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  28.78 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29970  Glycosyl transferase, family 2 protein  32.56 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  25.21 
 
 		 581 aa  80.1  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.37 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3249  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0399034  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  27.49 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  28.82 
 
 		 398 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 322 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3705  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 524 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.459069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1106  glycosyl transferase  29.76 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.648038  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  28.25 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  35.58 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  27.63 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 		 233 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  33.33 
 
 		 300 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3148  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 261 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2447  glycosyl transferase family protein  31.38 
 
 		 352 aa  79.7  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2617  glycosyl transferase family protein  37.72 
 
 		 328 aa  79  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.506776  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  24.15 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 		 727 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2583  glycosyl transferase family 2  26.11 
 
 		 296 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  32.54 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  24.62 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2486  glycosyl transferase family 2  31.8 
 
 		 231 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>