More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0383 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0383  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
377 aa  708    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.580829  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  48.03 
 
 
376 aa  256  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  48.46 
 
 
379 aa  231  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10750  glycosyltransferase  44.33 
 
 
399 aa  226  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  47.08 
 
 
373 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  42.22 
 
 
374 aa  222  8e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  43.88 
 
 
376 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  45.8 
 
 
375 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  45.8 
 
 
375 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  45.8 
 
 
375 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  44 
 
 
388 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  44.59 
 
 
374 aa  216  8e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  41.44 
 
 
376 aa  210  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  43.2 
 
 
370 aa  206  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  45.63 
 
 
374 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  43.18 
 
 
385 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2961  glycosyl transferase, group 1  44.25 
 
 
382 aa  200  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197137  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  42.13 
 
 
377 aa  200  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  42.78 
 
 
374 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  45.68 
 
 
376 aa  195  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3550  glycosyl transferase, group 1  43.8 
 
 
378 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.750733 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3243  glycosyl transferase group 1  41.54 
 
 
396 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0322741  normal  0.0997913 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  37.76 
 
 
390 aa  190  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  40.37 
 
 
423 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1764  putative glycosyl transferase  43.8 
 
 
398 aa  176  8e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0831707  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  42.5 
 
 
374 aa  172  7.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  40.84 
 
 
384 aa  169  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0171  glycosyl transferase, group 1  42.44 
 
 
422 aa  169  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0937  glycosyl transferase group 1  40.57 
 
 
369 aa  161  2e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  29.18 
 
 
383 aa  151  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  30.68 
 
 
386 aa  146  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 
384 aa  144  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3263  glycosyl transferase group 1  36.53 
 
 
381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  29.55 
 
 
382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  47.12 
 
 
409 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
414 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3845  group 1 glycosyl transferase  29.07 
 
 
411 aa  118  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000452091  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  34.48 
 
 
770 aa  114  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3445  glycosyl transferase, group 1  31.6 
 
 
389 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.129839  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1540  group 1 glycosyl transferase  29.64 
 
 
378 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.213513  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  33.42 
 
 
383 aa  110  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  41.36 
 
 
810 aa  109  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0234  glycosyl transferase group 1  37.33 
 
 
385 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 
389 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  26.57 
 
 
365 aa  108  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
360 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12220  glycosyltransferase  32.75 
 
 
432 aa  107  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.296579  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1135  glycosyl transferase, group 1  30.04 
 
 
380 aa  107  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.683403  hitchhiker  0.00885425 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  31.92 
 
 
374 aa  106  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  29.12 
 
 
426 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 
360 aa  104  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0192  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
378 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.480032  normal  0.0682367 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 
378 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 
408 aa  103  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  28.66 
 
 
419 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 
436 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 
359 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  31.73 
 
 
390 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3953  glycosyl transferase group 1  30.52 
 
 
374 aa  101  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.32029  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
394 aa  101  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  30.63 
 
 
367 aa  99.8  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 
381 aa  99.4  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 
426 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 
376 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  29.12 
 
 
770 aa  97.8  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  24.84 
 
 
427 aa  97.8  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  33.99 
 
 
414 aa  97.4  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  33.46 
 
 
382 aa  97.1  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 
362 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.31 
 
 
371 aa  96.7  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  33.45 
 
 
410 aa  96.7  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 
380 aa  96.7  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  26.92 
 
 
388 aa  96.3  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  28.33 
 
 
396 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0377  glycosyl transferase group 1  40.45 
 
 
404 aa  95.9  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000391271  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4017  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 
384 aa  95.9  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174092  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  33.42 
 
 
408 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2431  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 
364 aa  94.7  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.704693  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  31.39 
 
 
415 aa  94.4  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0894  a-glycosyltransferase  25.64 
 
 
380 aa  94  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00308239  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  35.02 
 
 
392 aa  94.7  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  29.97 
 
 
378 aa  94  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5045  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 
415 aa  94  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  31.47 
 
 
377 aa  94  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 
378 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  23.03 
 
 
378 aa  94  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1106  glycosyl transferase, group 1  34.35 
 
 
389 aa  93.6  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 
370 aa  93.2  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  23.93 
 
 
390 aa  93.2  7e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  30.95 
 
 
373 aa  92.8  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  23.95 
 
 
397 aa  92.8  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1638  glycosyl transferase group 1  32.75 
 
 
519 aa  92  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  31.89 
 
 
377 aa  92  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0993  putative cell division protease FtsH-like protein  28.07 
 
 
360 aa  92.8  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4921  group 1 glycosyl transferase  24.57 
 
 
391 aa  91.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.509527  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4271  glycosyl transferase group 1  27.04 
 
 
369 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  31.73 
 
 
402 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1085  glycosyl transferase, group 1  24.19 
 
 
430 aa  91.7  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  27 
 
 
386 aa  90.9  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  33.62 
 
 
386 aa  91.3  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>