More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4717 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3441  glycosyl transferase group 1  65.62 
 
 		 894 aa  1202    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4717  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 893 aa  1830    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.337059  normal  0.0164521 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3112  glycosyl transferase family protein  32.67 
 
 		 959 aa  341  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.264403 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  33.82 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.514087 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  30.48 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4087  glycosyl transferase family protein  27 
 
 		 336 aa  75.1  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.445004  normal  0.177761 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3562  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658872 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 		 1476 aa  73.9  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0557  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 		 399 aa  74.3  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808631  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  28.01 
 
 		 436 aa  73.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 		 370 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  25.2 
 
 		 1177 aa  72.8  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  32.18 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  25.2 
 
 		 1177 aa  72.4  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4622  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0028112 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5087  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 		 390 aa  70.9  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3512  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 		 369 aa  70.9  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5787  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 		 415 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 		 268 aa  69.7  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 		 390 aa  70.1  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0775  glycosyltransferase-like protein  34.44 
 
 		 371 aa  67.8  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1420  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 		 261 aa  67.4  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 		 536 aa  67.4  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1421  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 		 399 aa  66.6  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 		 380 aa  66.2  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1551  glycosyl transferase, group 1  24.79 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 		 346 aa  63.9  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 		 389 aa  63.5  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  36.59 
 
 		 739 aa  63.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3384  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320283  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1254  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3441  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 		 396 aa  62.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1194  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.12 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4950  glycosyl transferase  27.11 
 
 		 360 aa  62  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00550219  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1499  glycosyl transferase, group 1  25.65 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3861  putative glycosyltransferase  32.84 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  27.01 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  29 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2807  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2083  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.565137 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  28.23 
 
 		 425 aa  60.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2469  glycosyl transferase group 1  28 
 
 		 380 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal  0.290599 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2685  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 412 aa  60.8  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4364  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 		 393 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0405  glycosyl transferase group 1  23.48 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.224241 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 387 aa  59.7  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 		 425 aa  59.7  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  30.34 
 
 		 377 aa  60.1  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  29.61 
 
 		 417 aa  60.1  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3256  glycosyl transferase group 1  29.78 
 
 		 414 aa  59.7  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0509523  normal  0.260834 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0823  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 		 380 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 		 426 aa  59.7  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3648  glycosyl transferase family protein  23.63 
 
 		 738 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0250737  normal  0.0159543 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 		 1032 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2912  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.341746  normal  0.205284 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  24.68 
 
 		 413 aa  58.5  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1511  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.73 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1720  putative glycosyltransferase CpsG  27.72 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.27912  normal  0.563756 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5562  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.25 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  31.61 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  26.27 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  26.92 
 
 		 373 aa  57.8  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  27.65 
 
 		 365 aa  57.8  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2830  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 		 380 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0420061 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 773 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0236  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 		 1067 aa  57.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2353  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 		 252 aa  57.4  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.712246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  27 
 
 		 435 aa  57  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 355 aa  57.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  22.92 
 
 		 344 aa  57.4  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 		 391 aa  57.4  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2285  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 		 410 aa  57  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.0567423 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 		 418 aa  56.6  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3843  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 		 358 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  24.85 
 
 		 387 aa  56.6  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 		 417 aa  57  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2746  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 		 260 aa  56.2  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 		 396 aa  56.2  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2877  glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 		 426 aa  57  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 		 372 aa  56.6  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 		 389 aa  56.6  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1955  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 		 768 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.303263  normal  0.277598 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14251  hypothetical protein  23.81 
 
 		 384 aa  56.2  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0241071  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1102  glycosyl transferase family 2  27.87 
 
 		 953 aa  55.8  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4248  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 		 405 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461257  normal  0.0976118 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  26.83 
 
 		 379 aa  55.8  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 		 350 aa  55.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1549  glycosyl transferase, group 1  25.29 
 
 		 387 aa  55.8  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.190022  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0205  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 454 aa  56.2  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0375  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.79 
 
 		 462 aa  55.8  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  25.22 
 
 		 398 aa  56.2  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 		 468 aa  55.5  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 		 361 aa  55.8  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.972517 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>