174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0173 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0173  cofactor modifying protein (cmo)  100 
 
 		 301 aa  616  1e-175  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  86.71 
 
 		 335 aa  553  1e-156  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  46.38 
 
 		 331 aa  254  8e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  44.12 
 
 		 332 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1794  cofactor modifying protein (cmo)  42.17 
 
 		 311 aa  239  2.9999999999999997e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.420776 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0438  radical SAM domain-containing protein  26.17 
 
 		 390 aa  109  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.777378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2056  Radical SAM domain protein  28 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1217  Radical SAM domain protein  26.07 
 
 		 343 aa  94.4  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0163769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3080  Radical SAM domain protein  28.89 
 
 		 351 aa  94.7  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  26.06 
 
 		 384 aa  88.2  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2991  Radical SAM domain protein  29.49 
 
 		 397 aa  85.5  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  27.71 
 
 		 355 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  24.31 
 
 		 451 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  32.08 
 
 		 471 aa  79.7  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  33.81 
 
 		 437 aa  74.7  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  23.71 
 
 		 421 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 351 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  26.71 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  24.43 
 
 		 367 aa  69.3  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2884  Fe-S oxidoreductase  21.45 
 
 		 447 aa  68.9  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154845  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  25.62 
 
 		 474 aa  67.8  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  23.19 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3366  radical SAM family protein  32.24 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  21.88 
 
 		 341 aa  65.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  31.73 
 
 		 332 aa  65.9  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  23.55 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  25.27 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  25.84 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  29.29 
 
 		 873 aa  63.5  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  28.8 
 
 		 404 aa  62  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3588  radical SAM domain-containing protein  32.7 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  22.97 
 
 		 450 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1838  Radical SAM domain protein  31.79 
 
 		 491 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  25.29 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  30.95 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  30 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  22 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  30.86 
 
 		 465 aa  59.7  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  23.43 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.28 
 
 		 399 aa  59.7  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  28.49 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  28.49 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  23.72 
 
 		 380 aa  59.3  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1586  radical SAM family protein  26.14 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01021  hypothetical protein  23.83 
 
 		 373 aa  58.9  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.816192 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0480  Radical SAM domain protein  27.14 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00535769  hitchhiker  0.00252735 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1601  heme biosynthesis protein, putative  23.67 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196015  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2556  radical SAM family protein  28.36 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  30.95 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0433  radical SAM domain-containing protein  31.88 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1381  radical SAM domain-containing protein  26.14 
 
 		 345 aa  57.4  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  35.71 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3820  Radical SAM domain protein  22.38 
 
 		 515 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2924  Radical SAM domain protein  22.38 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  23.68 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  24.53 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0419  Fe-S oxidoreductase-like protein  33.02 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.399377  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  24.1 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0871  radical SAM family protein  37.59 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  27.04 
 
 		 445 aa  56.2  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 418 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  22.97 
 
 		 359 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  24.06 
 
 		 380 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.64 
 
 		 342 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  29.06 
 
 		 399 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3569  radical SAM domain-containing protein  25.19 
 
 		 365 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.64 
 
 		 342 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0911  radical SAM domain-containing protein  27.69 
 
 		 287 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2761  radical SAM domain-containing protein  30.19 
 
 		 348 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0874334  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  23.31 
 
 		 377 aa  53.9  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0802  radical SAM domain-containing protein  26.49 
 
 		 349 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1360  Radical SAM domain protein  27.85 
 
 		 445 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0916  Radical SAM domain protein  36.09 
 
 		 357 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0170039  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0369  radical SAM domain-containing protein  27.22 
 
 		 317 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.722387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  25.49 
 
 		 367 aa  52.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  22.22 
 
 		 378 aa  52.4  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  30.97 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  26.62 
 
 		 422 aa  52  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  23.31 
 
 		 384 aa  51.6  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  30.08 
 
 		 778 aa  50.8  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1033  radical SAM domain-containing protein  26.15 
 
 		 287 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1770  radical SAM domain-containing protein  25.38 
 
 		 287 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.201175  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0920  radical SAM domain protein  35.07 
 
 		 299 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  23.57 
 
 		 480 aa  50.4  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4250  Radical SAM domain protein  24.16 
 
 		 381 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  28.68 
 
 		 346 aa  50.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  26.19 
 
 		 406 aa  50.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  26.19 
 
 		 406 aa  50.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  27.87 
 
 		 323 aa  49.7  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0739  radical SAM domain-containing protein  26.63 
 
 		 347 aa  49.7  0.00006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0928  radical SAM domain-containing protein  33.1 
 
 		 355 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0991666  normal  0.304718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1817  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.62 
 
 		 384 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2153  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.62 
 
 		 384 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.666004  normal  0.11423 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  29.03 
 
 		 496 aa  49.7  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4523  Radical SAM domain protein  27.14 
 
 		 347 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  27.05 
 
 		 323 aa  48.9  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  25.4 
 
 		 410 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2551  radical SAM family protein  27.27 
 
 		 344 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0943  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 287 aa  48.5  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  27.67 
 
 		 335 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>