More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2507 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 421 aa  868    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  55.44 
 
 		 465 aa  463  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3588  radical SAM domain-containing protein  54.29 
 
 		 446 aa  456  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0433  radical SAM domain-containing protein  55.91 
 
 		 433 aa  426  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  49.74 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2924  Radical SAM domain protein  49.36 
 
 		 446 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1360  Radical SAM domain protein  49.36 
 
 		 445 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  48.76 
 
 		 450 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  46.33 
 
 		 451 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2884  Fe-S oxidoreductase  46.98 
 
 		 447 aa  388  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154845  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  44.87 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  44.56 
 
 		 437 aa  372  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3016  radical SAM domain-containing protein  36.09 
 
 		 513 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3051  Radical SAM domain protein  36.36 
 
 		 461 aa  279  6e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.684834  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  33.42 
 
 		 434 aa  186  6e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  33.5 
 
 		 372 aa  107  6e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  31.78 
 
 		 355 aa  100  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1381  radical SAM domain-containing protein  22.51 
 
 		 345 aa  94.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  23.38 
 
 		 335 aa  89.4  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  22.7 
 
 		 384 aa  88.2  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  33.51 
 
 		 351 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  32.97 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  27.32 
 
 		 329 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  27.92 
 
 		 340 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1794  cofactor modifying protein (cmo)  23.42 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.420776 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  31.82 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0506  radical SAM domain-containing protein  28.34 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  27.84 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3158  radical SAM domain-containing protein  23.81 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3820  Radical SAM domain protein  29.26 
 
 		 515 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.89 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0438  radical SAM domain-containing protein  30.05 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.777378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0173  cofactor modifying protein (cmo)  23.71 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  27.14 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2056  Radical SAM domain protein  25.85 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 		 402 aa  72.8  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  30.41 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  26.7 
 
 		 341 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  29.49 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2991  Radical SAM domain protein  30.16 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2567  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.77 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.324363  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.08 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  29.44 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1036  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.59 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643895  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  26.85 
 
 		 873 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.08 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.370128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.13 
 
 		 299 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.05 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.05 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1203  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.75 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2295  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.19 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0056  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.43 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0808361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.93 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1126  Fe-S oxidoreductase  32.82 
 
 		 347 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34160  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.82 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.142269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2419  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.54 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  25.13 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  26.79 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  29.05 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  24.86 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1348  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.85 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2272  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.74 
 
 		 326 aa  63.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  30.17 
 
 		 387 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  25.41 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 		 322 aa  62.4  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  30.17 
 
 		 387 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3080  Radical SAM domain protein  29.19 
 
 		 351 aa  62  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  25.99 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  26.26 
 
 		 404 aa  62  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.13 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1233  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.85 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.63882  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2270  radical SAM domain-containing protein  26.4 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.158683 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  23.91 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0574  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.13 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  30.46 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  23.48 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0373  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.11 
 
 		 323 aa  59.3  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.92 
 
 		 318 aa  59.7  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.19 
 
 		 321 aa  59.3  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000001817  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0597  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.48 
 
 		 348 aa  59.3  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  25.7 
 
 		 1000 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2268  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.89 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.88 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.209245  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0726  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.14 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130382 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01630  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.57 
 
 		 333 aa  57.8  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1217  Radical SAM domain protein  26.23 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0163769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0158  molybdenum cofactor synthesis-like  27.37 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194349  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  27.72 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1860  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.22 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.310247  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  22.72 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  23.2 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  31.96 
 
 		 345 aa  57  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1604  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.24 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4536  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.77 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.792195 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1755  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.57 
 
 		 349 aa  57  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.334737  hitchhiker  0.00806614 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2045  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.47 
 
 		 323 aa  57  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1760  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.39 
 
 		 323 aa  57  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.7115  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1410  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.17 
 
 		 335 aa  57  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  26.88 
 
 		 404 aa  57  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 474 aa  56.6  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>