238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0433 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3588  radical SAM domain-containing protein  73.24 
 
 
446 aa  652    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0433  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
433 aa  893    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2924  Radical SAM domain protein  52.44 
 
 
446 aa  481  1e-134  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  51.12 
 
 
465 aa  476  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  51.95 
 
 
445 aa  473  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1360  Radical SAM domain protein  51.71 
 
 
445 aa  473  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  55.91 
 
 
421 aa  443  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2884  Fe-S oxidoreductase  49.88 
 
 
447 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154845  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  48.68 
 
 
451 aa  435  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  48.67 
 
 
450 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  45.68 
 
 
471 aa  413  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  43.65 
 
 
437 aa  377  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3051  Radical SAM domain protein  36.72 
 
 
461 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.684834  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3016  radical SAM domain-containing protein  34.5 
 
 
513 aa  296  3e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  30.28 
 
 
434 aa  186  8e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  38.17 
 
 
372 aa  95.9  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1381  radical SAM domain-containing protein  29.22 
 
 
345 aa  88.6  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  29.92 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  25.47 
 
 
355 aa  70.1  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0438  radical SAM domain-containing protein  28.24 
 
 
390 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.777378  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  24.85 
 
 
341 aa  67.8  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1036  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.88 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643895  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.65 
 
 
299 aa  67  0.0000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  29.44 
 
 
387 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.5 
 
 
298 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.370128  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  23.86 
 
 
322 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.34 
 
 
298 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  23.86 
 
 
358 aa  64.7  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3158  radical SAM domain-containing protein  24.16 
 
 
428 aa  63.9  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271249  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.81 
 
 
342 aa  63.9  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.81 
 
 
342 aa  63.9  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  29.69 
 
 
329 aa  63.5  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  22.78 
 
 
339 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  27.75 
 
 
331 aa  62.4  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  24.15 
 
 
873 aa  61.6  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  32.58 
 
 
406 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  32.58 
 
 
406 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  24.37 
 
 
332 aa  60.5  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0304  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.74 
 
 
326 aa  60.5  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  27.37 
 
 
404 aa  60.5  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.8 
 
 
399 aa  59.7  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  32.03 
 
 
335 aa  59.7  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  25.45 
 
 
351 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0056  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.17 
 
 
348 aa  59.7  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0808361  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  25.21 
 
 
402 aa  59.3  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0734  Radical SAM domain protein  27.65 
 
 
401 aa  59.3  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2419  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.38 
 
 
326 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2766  radical SAM family Fe-S protein  33.09 
 
 
340 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3480  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.57 
 
 
344 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.460525 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 
384 aa  57.8  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  26.51 
 
 
351 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  22.45 
 
 
340 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  26.23 
 
 
387 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0173  cofactor modifying protein (cmo)  31.88 
 
 
301 aa  58.2  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34160  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.28 
 
 
339 aa  57.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.142269  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1445  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.93 
 
 
297 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2056  Radical SAM domain protein  27.17 
 
 
340 aa  57.8  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0363  radical SAM domain-containing protein  26.7 
 
 
327 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.411689  normal  0.816586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  22.87 
 
 
340 aa  56.6  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  26.23 
 
 
387 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0416  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.74 
 
 
341 aa  56.2  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.315113  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1233  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.26 
 
 
365 aa  56.2  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.63882  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1217  Radical SAM domain protein  20.63 
 
 
343 aa  56.2  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0163769  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  25.5 
 
 
379 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1126  Fe-S oxidoreductase  31.54 
 
 
347 aa  55.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  24.13 
 
 
496 aa  55.8  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  28.9 
 
 
418 aa  55.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  26.88 
 
 
325 aa  55.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28 
 
 
298 aa  55.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  25.15 
 
 
367 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.32 
 
 
318 aa  54.7  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4175  Radical SAM domain protein  28.28 
 
 
342 aa  55.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0506  radical SAM domain-containing protein  27.17 
 
 
319 aa  54.3  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  29.71 
 
 
335 aa  54.3  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1794  cofactor modifying protein (cmo)  27.2 
 
 
311 aa  54.3  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.420776 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.04 
 
 
321 aa  53.5  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000001817  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0169  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.07 
 
 
375 aa  52.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280654  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  30.59 
 
 
399 aa  52.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2095  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  33.7 
 
 
326 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0726  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.98 
 
 
324 aa  52.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00130382 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1706  radical SAM domain-containing protein  30.13 
 
 
516 aa  52.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3366  radical SAM family protein  27.33 
 
 
374 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1273  Radical SAM domain protein  28.16 
 
 
320 aa  53.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.390011  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0597  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.97 
 
 
348 aa  52.8  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1609  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.96 
 
 
317 aa  52.8  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3820  Radical SAM domain protein  24.31 
 
 
515 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2818  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.89 
 
 
326 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2231  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.82 
 
 
345 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  27.93 
 
 
404 aa  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3898  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.37 
 
 
350 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587408  normal  0.400488 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  29.94 
 
 
376 aa  51.2  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3385  Radical SAM domain protein  25.56 
 
 
843 aa  51.6  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2270  radical SAM domain-containing protein  26.97 
 
 
345 aa  51.6  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.158683 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.76 
 
 
344 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2272  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.33 
 
 
326 aa  50.4  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  27.05 
 
 
341 aa  50.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  29.71 
 
 
379 aa  50.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  22.87 
 
 
349 aa  50.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  23.81 
 
 
358 aa  50.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  27.53 
 
 
398 aa  50.4  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>