209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0438 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0438  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 390 aa  798    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.777378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1217  Radical SAM domain protein  30.92 
 
 		 343 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0163769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1794  cofactor modifying protein (cmo)  30.07 
 
 		 311 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.420776 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  24.17 
 
 		 335 aa  121  3e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  27.84 
 
 		 332 aa  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0173  cofactor modifying protein (cmo)  26.17 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  27.58 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2056  Radical SAM domain protein  28.13 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2991  Radical SAM domain protein  35.68 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3080  Radical SAM domain protein  26.22 
 
 		 351 aa  100  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  24.67 
 
 		 384 aa  91.3  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  33.15 
 
 		 451 aa  89.7  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 		 355 aa  88.6  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  25.08 
 
 		 367 aa  86.7  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  29.55 
 
 		 471 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  27.93 
 
 		 450 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2884  Fe-S oxidoreductase  25.12 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154845  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  31.71 
 
 		 445 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  25.35 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2924  Radical SAM domain protein  28.64 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3588  radical SAM domain-containing protein  29.35 
 
 		 446 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  26.82 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1360  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  30.05 
 
 		 421 aa  73.6  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  21.93 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  30.81 
 
 		 465 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0433  radical SAM domain-containing protein  28.24 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 340 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  23.66 
 
 		 351 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0480  Radical SAM domain protein  25.19 
 
 		 281 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00535769  hitchhiker  0.00252735 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  22.05 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  23.25 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0802  radical SAM domain-containing protein  21.56 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1381  radical SAM domain-containing protein  22.15 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  25.36 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.02 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  26.49 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2456  coenzyme PQQ biosynthesis protein E  27.35 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3051  Radical SAM domain protein  27.47 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.684834  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  23.67 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  27.89 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2588  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.83 
 
 		 414 aa  59.7  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0973479  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.56 
 
 		 378 aa  59.7  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4038  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.44 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2761  radical SAM domain-containing protein  27.08 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0874334  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3820  Radical SAM domain protein  25.69 
 
 		 515 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3016  radical SAM domain-containing protein  34.58 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.15 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  24.06 
 
 		 501 aa  57.8  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2098  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.65 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456256  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1449  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.88 
 
 		 373 aa  57.4  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0775464  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  22.7 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  20.45 
 
 		 873 aa  57.4  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6168  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.45 
 
 		 374 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0169631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  29.1 
 
 		 382 aa  57  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0454  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.6 
 
 		 368 aa  57  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0516  radical SAM domain-containing protein  25.57 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1782  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.81 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.449437  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0393  metallo cofactor biosynthesis protein  25.62 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5901  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.96 
 
 		 374 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.630073 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2492  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.31 
 
 		 400 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.250234  normal  0.0827229 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  22.53 
 
 		 395 aa  56.2  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  23.84 
 
 		 445 aa  56.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  23.08 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  26.02 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0848  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.42 
 
 		 371 aa  55.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.9 
 
 		 296 aa  55.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  22.09 
 
 		 406 aa  54.3  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  25.15 
 
 		 379 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5965  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.7 
 
 		 387 aa  54.7  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0233125 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  22.15 
 
 		 406 aa  54.3  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0292  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.69 
 
 		 386 aa  53.9  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.876947 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2470  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25 
 
 		 407 aa  53.9  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.616066 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3158  radical SAM domain-containing protein  24.44 
 
 		 428 aa  53.9  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3076  radical SAM family protein  21.23 
 
 		 430 aa  53.5  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  28.23 
 
 		 390 aa  53.1  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  24.56 
 
 		 376 aa  52.8  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.18 
 
 		 379 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.384282  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5119  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.18 
 
 		 379 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5162  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.18 
 
 		 379 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426022 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  24.46 
 
 		 393 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 		 332 aa  52.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  24.92 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  21.91 
 
 		 393 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  22.11 
 
 		 491 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.51 
 
 		 371 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0357225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  29.48 
 
 		 354 aa  51.2  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1203  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.66 
 
 		 308 aa  51.2  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0516  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.62 
 
 		 381 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  20.42 
 
 		 358 aa  51.2  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  22.7 
 
 		 332 aa  50.8  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  31.75 
 
 		 367 aa  50.8  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1991  radical SAM domain-containing protein  23.99 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0387606  normal  0.206645 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0802  radical SAM family Fe-S protein  27.34 
 
 		 561 aa  50.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  28.57 
 
 		 317 aa  50.4  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  21.69 
 
 		 379 aa  50.1  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41640  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.53 
 
 		 383 aa  50.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.177576  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1769  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.27 
 
 		 384 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>