More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1381 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1381  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
345 aa  701    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  37.21 
 
 
372 aa  244  9.999999999999999e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  34.37 
 
 
384 aa  221  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1360  Radical SAM domain protein  23.98 
 
 
445 aa  129  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2924  Radical SAM domain protein  24.76 
 
 
446 aa  116  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3051  Radical SAM domain protein  22.77 
 
 
461 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.684834  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2884  Fe-S oxidoreductase  22.77 
 
 
447 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154845  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  22.22 
 
 
450 aa  106  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  24.7 
 
 
445 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0433  radical SAM domain-containing protein  22.83 
 
 
433 aa  99.4  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  32.89 
 
 
465 aa  98.6  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3016  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 
513 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  30.99 
 
 
437 aa  94.7  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  22.51 
 
 
421 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3588  radical SAM domain-containing protein  31.62 
 
 
446 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2056  Radical SAM domain protein  25.08 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  26.33 
 
 
367 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  28.77 
 
 
451 aa  76.3  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  24.58 
 
 
340 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  22.73 
 
 
355 aa  73.2  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  24.87 
 
 
471 aa  70.9  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  30.52 
 
 
434 aa  70.9  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3820  Radical SAM domain protein  24.38 
 
 
515 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  22.67 
 
 
341 aa  69.7  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  21.21 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  23.26 
 
 
340 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 
565 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  21.26 
 
 
351 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3158  radical SAM domain-containing protein  21.27 
 
 
428 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271249  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0438  radical SAM domain-containing protein  22.15 
 
 
390 aa  63.2  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.777378  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  26.02 
 
 
335 aa  62.8  0.000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  22.01 
 
 
800 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  21.47 
 
 
411 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2197  radical SAM domain-containing protein  23.61 
 
 
368 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0928  radical SAM domain-containing protein  19.39 
 
 
355 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0991666  normal  0.304718 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3569  radical SAM domain-containing protein  23.03 
 
 
365 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  22.7 
 
 
339 aa  61.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  23.01 
 
 
382 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1725  radical SAM domain-containing protein  22.96 
 
 
460 aa  59.3  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2577  radical SAM domain-containing protein  22.29 
 
 
371 aa  59.3  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.014973  unclonable  0.0000162693 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0516  radical SAM domain-containing protein  21.95 
 
 
343 aa  59.3  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  23.27 
 
 
462 aa  59.3  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  23.67 
 
 
778 aa  58.9  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3724  Radical SAM domain protein  27.63 
 
 
355 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3080  Radical SAM domain protein  21.54 
 
 
351 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0480  Radical SAM domain protein  21.89 
 
 
281 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00535769  hitchhiker  0.00252735 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  23.92 
 
 
373 aa  57.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  25.83 
 
 
438 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  26.82 
 
 
358 aa  58.5  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  27.44 
 
 
379 aa  57.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 
331 aa  57.4  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  26.88 
 
 
355 aa  57.4  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  22.42 
 
 
325 aa  57.4  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0173  cofactor modifying protein (cmo)  26.14 
 
 
301 aa  57.4  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0871  radical SAM family protein  18.4 
 
 
357 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  21.45 
 
 
371 aa  57.4  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0357225  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0802  radical SAM domain-containing protein  24.03 
 
 
349 aa  57.4  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  29.19 
 
 
413 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  21.49 
 
 
394 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.38 
 
 
399 aa  56.2  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  21.39 
 
 
372 aa  55.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  23.59 
 
 
456 aa  55.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  21.96 
 
 
429 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  24.72 
 
 
1005 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  24.64 
 
 
460 aa  55.1  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0122  Radical SAM domain protein  29.27 
 
 
344 aa  54.3  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  21.62 
 
 
333 aa  54.3  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2991  Radical SAM domain protein  21.86 
 
 
397 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  20.24 
 
 
389 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  24.92 
 
 
349 aa  53.9  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  24.09 
 
 
442 aa  53.9  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  21.53 
 
 
356 aa  53.9  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0177  radical SAM family protein  21.54 
 
 
372 aa  53.9  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.698116  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  29.12 
 
 
468 aa  53.9  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1794  cofactor modifying protein (cmo)  23.83 
 
 
311 aa  53.9  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.420776 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  25.92 
 
 
346 aa  53.9  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1265  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.94 
 
 
336 aa  53.9  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.522887  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  24.09 
 
 
442 aa  53.9  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  20.18 
 
 
377 aa  53.9  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  21.53 
 
 
356 aa  53.5  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  24 
 
 
479 aa  53.5  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1943  Radical SAM domain protein  24.26 
 
 
315 aa  53.5  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.227047  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3366  radical SAM family protein  22.38 
 
 
374 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1593  radical SAM domain-containing protein  21.5 
 
 
354 aa  53.5  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  21.01 
 
 
501 aa  53.1  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  25.95 
 
 
496 aa  53.5  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  24.54 
 
 
337 aa  53.1  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  24 
 
 
326 aa  53.1  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2586  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.16 
 
 
340 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  24.27 
 
 
326 aa  52.8  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1217  Radical SAM domain protein  19.81 
 
 
343 aa  52.8  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0163769  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  23.1 
 
 
450 aa  52.8  0.000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  22.81 
 
 
1002 aa  52.8  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  26.4 
 
 
453 aa  52  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2272  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.85 
 
 
326 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.85 
 
 
326 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  25.58 
 
 
428 aa  52  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  20.77 
 
 
429 aa  52  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  26.35 
 
 
368 aa  52.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  30.25 
 
 
345 aa  52.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>