125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0871 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0871  radical SAM family protein  100 
 
 		 357 aa  687    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0916  Radical SAM domain protein  93.84 
 
 		 357 aa  547  1e-154  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0170039  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0920  radical SAM domain protein  92.98 
 
 		 299 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0928  radical SAM domain-containing protein  70.45 
 
 		 355 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0991666  normal  0.304718 
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  36.39 
 
 		 778 aa  276  3e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0783  glycosyl transferase group 1  46.44 
 
 		 782 aa  265  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  25.46 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  31.32 
 
 		 335 aa  77  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3820  Radical SAM domain protein  25.32 
 
 		 515 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1381  radical SAM domain-containing protein  19.94 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  24.3 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0173  cofactor modifying protein (cmo)  32.57 
 
 		 301 aa  69.3  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  27.63 
 
 		 367 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1057  radical SAM domain-containing protein  25.5 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  30.57 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  24.23 
 
 		 391 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  24.68 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  28.09 
 
 		 399 aa  60.8  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  22.4 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  27.14 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3569  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 		 365 aa  60.1  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  24.65 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  26.18 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  27.94 
 
 		 351 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  27.03 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  26.63 
 
 		 363 aa  58.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  28.24 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3158  radical SAM domain-containing protein  26.11 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1794  cofactor modifying protein (cmo)  22.1 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.420776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  23.2 
 
 		 340 aa  56.6  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  25.4 
 
 		 405 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2456  coenzyme PQQ biosynthesis protein E  28.66 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2754  radical SAM domain-containing protein  21.56 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  26.39 
 
 		 380 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0390  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.33 
 
 		 380 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.52753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0790  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.28 
 
 		 380 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  27.7 
 
 		 480 aa  53.9  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  27.71 
 
 		 382 aa  53.9  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  30.65 
 
 		 354 aa  53.1  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  30.35 
 
 		 364 aa  52.8  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  24.21 
 
 		 339 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2164  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 		 349 aa  52.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.295283  normal  0.13164 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  24.08 
 
 		 389 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0734  Radical SAM domain protein  25.95 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  19.27 
 
 		 369 aa  52  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  24.2 
 
 		 429 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  26.15 
 
 		 394 aa  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  30.65 
 
 		 345 aa  50.8  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0689  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.39 
 
 		 389 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.62446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0848  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28 
 
 		 371 aa  51.2  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2446  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.61 
 
 		 380 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.121554  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0480  Radical SAM domain protein  21.05 
 
 		 281 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00535769  hitchhiker  0.00252735 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  24.32 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  26.67 
 
 		 346 aa  50.4  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 380 aa  50.4  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  27.49 
 
 		 428 aa  50.4  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2991  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 397 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  29.57 
 
 		 392 aa  50.1  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  28.89 
 
 		 413 aa  50.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  25.57 
 
 		 377 aa  50.1  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  29.41 
 
 		 387 aa  49.7  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  22.39 
 
 		 451 aa  50.1  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  20.21 
 
 		 474 aa  49.7  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1978  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.69 
 
 		 372 aa  49.7  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.633092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  37.5 
 
 		 366 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.16 
 
 		 397 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  25.8 
 
 		 355 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  29.41 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  22.74 
 
 		 323 aa  49.3  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1769  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.44 
 
 		 384 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  23.16 
 
 		 402 aa  48.9  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  26.49 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1817  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.37 
 
 		 384 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2153  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.37 
 
 		 384 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.666004  normal  0.11423 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  29.05 
 
 		 359 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  26.44 
 
 		 325 aa  47.4  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  25.27 
 
 		 398 aa  47.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  25.19 
 
 		 434 aa  47  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 446 aa  47  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  23.27 
 
 		 396 aa  46.6  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  27.06 
 
 		 471 aa  46.6  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 347 aa  46.6  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  21.74 
 
 		 323 aa  46.6  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  24.85 
 
 		 414 aa  47  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3080  Radical SAM domain protein  27 
 
 		 351 aa  46.6  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  25.97 
 
 		 335 aa  46.6  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  21.93 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.32 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  27.27 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3973  radical SAM domain-containing protein  29.73 
 
 		 292 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1043  radical SAM domain-containing protein  37.35 
 
 		 297 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1930  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.13 
 
 		 319 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5597  hypothetical protein  30.43 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5139  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  30.43 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.219844  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  26.27 
 
 		 407 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  26.79 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0907  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  34.31 
 
 		 251 aa  45.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5642  hypothetical protein  30.43 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00436698  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5580  hypothetical protein  30.43 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488042  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5367  hypothetical protein  30.43 
 
 		 279 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0445867  hitchhiker  0.0000016486 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>