62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0177 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0177  radical SAM family protein  100 
 
 		 372 aa  780    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.698116  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01061  hypothetical protein  49.2 
 
 		 387 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.392097 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1586  radical SAM family protein  28.11 
 
 		 356 aa  151  1e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0182  radical SAM family protein  27.94 
 
 		 369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1064  radical SAM domain-containing protein  26.96 
 
 		 365 aa  137  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.468822  normal  0.968223 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2164  radical SAM domain-containing protein  23.82 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.295283  normal  0.13164 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01021  hypothetical protein  26.12 
 
 		 373 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.816192 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1057  radical SAM domain-containing protein  22.96 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828068 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0368  radical SAM domain-containing protein  21.22 
 
 		 574 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1592  radical SAM domain-containing protein  22.18 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1593  radical SAM domain-containing protein  19.38 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  22.4 
 
 		 323 aa  55.8  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  22.9 
 
 		 428 aa  55.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1381  radical SAM domain-containing protein  21.54 
 
 		 345 aa  53.9  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  20.17 
 
 		 384 aa  53.1  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  22.01 
 
 		 323 aa  53.1  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  21.52 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  25.58 
 
 		 446 aa  50.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0804  hypothetical protein  24.14 
 
 		 342 aa  50.1  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.68 
 
 		 308 aa  50.1  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  23.5 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3252  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.84 
 
 		 313 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  24.86 
 
 		 496 aa  49.3  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0808  Radical SAM domain protein  20.33 
 
 		 359 aa  47.8  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  21.28 
 
 		 474 aa  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  24.02 
 
 		 372 aa  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  20.35 
 
 		 316 aa  47.4  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  22.29 
 
 		 468 aa  47.4  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  27.81 
 
 		 415 aa  47.4  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  21.78 
 
 		 340 aa  47  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1266  Radical SAM domain protein  24.68 
 
 		 571 aa  47.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000753017 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  24.2 
 
 		 380 aa  47  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  23.68 
 
 		 332 aa  46.6  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  27.46 
 
 		 382 aa  46.6  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  25.68 
 
 		 397 aa  46.6  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 480 aa  46.2  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1167  radical SAM family protein  23.62 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000619352  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4157  radical SAM superfamily protein  30 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1646  radical SAM family protein  29.47 
 
 		 368 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3345  radical SAM domain-containing protein  25.58 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0363  radical SAM domain-containing protein  22.15 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.411689  normal  0.816586 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1951  radical SAM family Fe-S protein  27.72 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  21.32 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2177  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.39 
 
 		 339 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.697668  normal  0.807394 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  28 
 
 		 366 aa  44.3  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  25.57 
 
 		 501 aa  44.7  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  29.34 
 
 		 394 aa  43.9  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  22.26 
 
 		 341 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0426  Radical SAM domain protein  24.72 
 
 		 420 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0694  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 371 aa  43.5  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2836  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.74 
 
 		 326 aa  43.5  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2922  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.74 
 
 		 326 aa  43.5  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.347624  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4172  Radical SAM domain protein  23.03 
 
 		 338 aa  43.5  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1434  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.74 
 
 		 326 aa  43.5  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0911  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 497 aa  43.5  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  24.72 
 
 		 423 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  24.72 
 
 		 423 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2952  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.21 
 
 		 340 aa  43.1  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  22.58 
 
 		 387 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  22.17 
 
 		 387 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  23.37 
 
 		 358 aa  43.1  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0787  Radical SAM domain protein  27.06 
 
 		 537 aa  42.7  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0612604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>