170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1943 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1943  Radical SAM domain protein  100 
 
 
315 aa  644    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.227047  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1300  Radical SAM domain protein  26.28 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.696652  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  32.06 
 
 
384 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0369  radical SAM domain-containing protein  33.08 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.722387  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  28.3 
 
 
367 aa  66.2  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.61 
 
 
342 aa  65.1  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.61 
 
 
342 aa  65.1  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  28.8 
 
 
451 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2766  radical SAM family Fe-S protein  30.97 
 
 
340 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3490  Radical SAM domain protein  40.45 
 
 
346 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  30.07 
 
 
434 aa  61.2  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  33.82 
 
 
405 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  25.83 
 
 
340 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  22.64 
 
 
329 aa  60.8  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  23.94 
 
 
332 aa  59.3  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  23.1 
 
 
459 aa  59.3  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0506  radical SAM domain-containing protein  23.74 
 
 
319 aa  58.5  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  26.52 
 
 
471 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2991  Radical SAM domain protein  31.72 
 
 
397 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2056  Radical SAM domain protein  27.32 
 
 
340 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  25.32 
 
 
341 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  32.93 
 
 
351 aa  57  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  31.78 
 
 
372 aa  56.6  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  23.78 
 
 
332 aa  56.6  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6115  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 
352 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2391  MoaA/NifB/PqqE family protein  28.76 
 
 
455 aa  55.8  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.426665  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  23.94 
 
 
427 aa  55.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1586  radical SAM family protein  18.22 
 
 
356 aa  55.8  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0188  radical SAM family protein  33.98 
 
 
279 aa  54.3  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 
351 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  26.34 
 
 
437 aa  54.3  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1381  radical SAM domain-containing protein  24.26 
 
 
345 aa  53.5  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2884  Fe-S oxidoreductase  24.87 
 
 
447 aa  53.1  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154845  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3345  radical SAM domain-containing protein  29.14 
 
 
338 aa  52.8  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4048  radical SAM family Fe-S protein  26.79 
 
 
486 aa  52.8  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  32.38 
 
 
392 aa  52  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1126  Fe-S oxidoreductase  28.31 
 
 
347 aa  52.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  25.19 
 
 
339 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  26.9 
 
 
873 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1914  Radical SAM domain protein  30.16 
 
 
376 aa  52.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  23.84 
 
 
340 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  35.79 
 
 
410 aa  52.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 
412 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0409  radical SAM family protein  30.84 
 
 
474 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.343517 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  28.05 
 
 
335 aa  51.6  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  29.37 
 
 
421 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4173  Radical SAM domain protein  30.25 
 
 
344 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6304  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.41 
 
 
398 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2134  radical SAM family Fe-S protein  37.8 
 
 
479 aa  50.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426592  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1217  Radical SAM domain protein  30.1 
 
 
343 aa  50.8  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0163769  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.09 
 
 
299 aa  50.8  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3820  Radical SAM domain protein  24.31 
 
 
515 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  27.69 
 
 
355 aa  50.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1794  cofactor modifying protein (cmo)  26.45 
 
 
311 aa  50.8  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.420776 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 
450 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  32.95 
 
 
429 aa  50.4  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2359  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.5 
 
 
378 aa  50.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1033  radical SAM domain-containing protein  25.37 
 
 
287 aa  50.4  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0761  radical SAM family protein  28.38 
 
 
503 aa  50.1  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.510153  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  27.72 
 
 
465 aa  50.1  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.32 
 
 
326 aa  50.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0804  hypothetical protein  24.68 
 
 
342 aa  49.7  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  24.36 
 
 
335 aa  49.7  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  33.64 
 
 
409 aa  49.7  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2225  Radical SAM domain protein  22.86 
 
 
286 aa  49.7  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  27.78 
 
 
367 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  27.54 
 
 
335 aa  48.9  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  22.88 
 
 
330 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 
445 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0911  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 
287 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  21.54 
 
 
322 aa  48.5  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5597  hypothetical protein  29.25 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5311  hypothetical protein  29.25 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5139  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  29.25 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.219844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5153  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  29.25 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.120302  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5707  hypothetical protein  29.25 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5552  hypothetical protein  29.25 
 
 
292 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.05586e-17 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  32.91 
 
 
401 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  31.97 
 
 
377 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  32.91 
 
 
401 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  32.91 
 
 
401 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2419  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.55 
 
 
326 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5642  hypothetical protein  29.25 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00436698  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  31.78 
 
 
391 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5580  hypothetical protein  29.25 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488042  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  21.54 
 
 
358 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5251  radical SAM domain-containing protein  29.25 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  25.64 
 
 
331 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3326  radical SAM domain-containing protein  34.52 
 
 
396 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  28.32 
 
 
334 aa  47.4  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  24.24 
 
 
415 aa  47  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1592  radical SAM domain-containing protein  19.71 
 
 
354 aa  47.4  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1360  Radical SAM domain protein  24.57 
 
 
445 aa  47  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 
474 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0512  radical SAM domain-containing protein  21.64 
 
 
491 aa  47  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.158097  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1486  radical SAM family protein  27.61 
 
 
292 aa  46.2  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4243  Radical SAM domain protein  25.37 
 
 
360 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1535  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  28 
 
 
322 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.495642 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2931  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.63 
 
 
326 aa  46.2  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  27.72 
 
 
462 aa  46.2  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>