More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1873 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 450 aa  928    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  49.33 
 
 		 465 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3588  radical SAM domain-containing protein  47.2 
 
 		 446 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  43.69 
 
 		 451 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0433  radical SAM domain-containing protein  48.67 
 
 		 433 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  48.76 
 
 		 421 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  44.27 
 
 		 445 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2884  Fe-S oxidoreductase  44.54 
 
 		 447 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154845  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  43.06 
 
 		 437 aa  382  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2924  Radical SAM domain protein  41.99 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1360  Radical SAM domain protein  41.99 
 
 		 445 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 471 aa  366  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3016  radical SAM domain-containing protein  37.62 
 
 		 513 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3051  Radical SAM domain protein  36.98 
 
 		 461 aa  296  6e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.684834  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  31.85 
 
 		 434 aa  188  2e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1381  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 		 345 aa  106  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  32.68 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  25.38 
 
 		 355 aa  94.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  27.75 
 
 		 384 aa  92  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  31.07 
 
 		 351 aa  89  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2056  Radical SAM domain protein  24.42 
 
 		 340 aa  87  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0438  radical SAM domain-containing protein  27.93 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.777378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  30.34 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.96 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0726  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.44 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  23.01 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.8 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.8 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  31.65 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.73 
 
 		 371 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0357225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0260  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.97 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678678  normal  0.916365 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  26.2 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  23.46 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  26.2 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  25.56 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  25.34 
 
 		 329 aa  72  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1036  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.14 
 
 		 298 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643895  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1915  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.1 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.04 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.370128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0056  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.49 
 
 		 348 aa  71.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0808361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3480  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.31 
 
 		 344 aa  71.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.460525 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.26 
 
 		 299 aa  70.9  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  28.44 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4564  molybdenum cofactor synthesis-like  33.16 
 
 		 340 aa  70.1  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  23.2 
 
 		 341 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.4 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.88 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  25.54 
 
 		 873 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.58 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.41 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.8 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3366  radical SAM family protein  30.21 
 
 		 374 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1680  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.12 
 
 		 397 aa  67  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  30.06 
 
 		 384 aa  67  0.0000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  29.79 
 
 		 335 aa  66.6  0.0000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2556  radical SAM family protein  26.13 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  29.5 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  26.13 
 
 		 496 aa  66.6  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  30.6 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3898  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.61 
 
 		 350 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587408  normal  0.400488 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1126  Fe-S oxidoreductase  32.21 
 
 		 347 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2191  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.9 
 
 		 344 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  27.07 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2098  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.73 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  27.5 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0506  radical SAM domain-containing protein  26.34 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  27.88 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1601  heme biosynthesis protein, putative  23.26 
 
 		 354 aa  64.3  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196015  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2492  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.25 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.250234  normal  0.0827229 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  28.73 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  26.15 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  29 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2586  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.15 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0518  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.49 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  27.54 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1445  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.14 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2231  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.19 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1387  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.3 
 
 		 351 aa  63.2  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.84 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.155054 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  24.75 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  27.68 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.47 
 
 		 332 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.708354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  25.49 
 
 		 479 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1219  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.5 
 
 		 343 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4147  molybdenum cofactor synthesis-like  30.53 
 
 		 322 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.115526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1288  molybdenum cofactor synthesis protein  30.81 
 
 		 330 aa  63.2  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2703  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.2 
 
 		 345 aa  63.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33.59 
 
 		 321 aa  62.8  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000001817  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  26.8 
 
 		 346 aa  62.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  25.4 
 
 		 398 aa  63.2  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0724  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.89 
 
 		 335 aa  62.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.485207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  32.16 
 
 		 359 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0173  cofactor modifying protein (cmo)  22.97 
 
 		 301 aa  62  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3544  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.94 
 
 		 464 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  26.83 
 
 		 401 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1579  radical SAM domain-containing protein  36.73 
 
 		 543 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.803741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  22.93 
 
 		 367 aa  62.4  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2588  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.23 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0973479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3158  radical SAM domain-containing protein  25.62 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  27.75 
 
 		 358 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>