280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3051 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3051  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 461 aa  949    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.684834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2924  Radical SAM domain protein  38.62 
 
 		 446 aa  342  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  39.11 
 
 		 465 aa  338  9e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1360  Radical SAM domain protein  38.62 
 
 		 445 aa  335  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  38.12 
 
 		 445 aa  329  8e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  37.96 
 
 		 451 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3588  radical SAM domain-containing protein  36.38 
 
 		 446 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0433  radical SAM domain-containing protein  37.77 
 
 		 433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  36.98 
 
 		 450 aa  296  7e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  35.76 
 
 		 437 aa  290  4e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2884  Fe-S oxidoreductase  36.24 
 
 		 447 aa  288  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154845  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  34.47 
 
 		 471 aa  279  6e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 		 421 aa  279  7e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3016  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 513 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1381  radical SAM domain-containing protein  22.77 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  34.13 
 
 		 372 aa  84.7  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  25.62 
 
 		 384 aa  82.8  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2991  Radical SAM domain protein  32.98 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  23.76 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  24.78 
 
 		 873 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2056  Radical SAM domain protein  25.68 
 
 		 340 aa  67  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  23.14 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  23.31 
 
 		 355 aa  65.1  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1233  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.16 
 
 		 365 aa  64.7  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.63882  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 496 aa  62.8  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  23.4 
 
 		 411 aa  63.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4147  molybdenum cofactor synthesis-like  28.57 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.115526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  24.34 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0438  radical SAM domain-containing protein  28.25 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.777378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19300  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.22 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00282794  normal  0.0296768 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  25.52 
 
 		 335 aa  60.5  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2214  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.84 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.422159  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  25.97 
 
 		 351 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  29.34 
 
 		 377 aa  59.7  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.29 
 
 		 299 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2270  radical SAM domain-containing protein  30.28 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.158683 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  29.58 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3366  radical SAM family protein  27.32 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  23.01 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1217  Radical SAM domain protein  22.31 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0163769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.86 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.370128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3158  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 		 428 aa  57  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  29.57 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0506  radical SAM domain-containing protein  24.1 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  25.79 
 
 		 359 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  25.82 
 
 		 479 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  36.44 
 
 		 334 aa  56.2  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  23.51 
 
 		 384 aa  56.2  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.02 
 
 		 298 aa  56.2  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  32.74 
 
 		 359 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  26.39 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  23.64 
 
 		 332 aa  55.8  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  25.51 
 
 		 399 aa  55.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  24.08 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.51 
 
 		 342 aa  55.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  23.04 
 
 		 346 aa  54.7  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3080  Radical SAM domain protein  24.12 
 
 		 351 aa  55.1  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  26 
 
 		 404 aa  54.7  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.51 
 
 		 342 aa  55.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01630  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  31.06 
 
 		 333 aa  55.1  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4173  Radical SAM domain protein  28.15 
 
 		 344 aa  55.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1535  molybdenum cofactor synthesis domain-containing protein  27.32 
 
 		 322 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.495642 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2225  Radical SAM domain protein  24.09 
 
 		 286 aa  54.7  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1036  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.87 
 
 		 298 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643895  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  24.15 
 
 		 413 aa  53.9  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  28.68 
 
 		 341 aa  53.9  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3345  radical SAM domain-containing protein  28.36 
 
 		 338 aa  53.9  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0739  radical SAM domain-containing protein  26.34 
 
 		 347 aa  53.9  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1043  radical SAM domain-containing protein  25.78 
 
 		 297 aa  53.9  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1853  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.23 
 
 		 335 aa  53.5  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.12 
 
 		 397 aa  53.5  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3820  Radical SAM domain protein  24.32 
 
 		 515 aa  53.5  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  27.89 
 
 		 330 aa  53.5  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2556  radical SAM family protein  31.5 
 
 		 337 aa  53.1  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2197  radical SAM domain-containing protein  32.58 
 
 		 368 aa  53.1  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1255  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.92 
 
 		 319 aa  53.5  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2905  radical SAM domain-containing protein  30.22 
 
 		 389 aa  53.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.71 
 
 		 321 aa  53.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000001817  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.67 
 
 		 298 aa  53.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  28.33 
 
 		 332 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0416  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.25 
 
 		 341 aa  53.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.315113  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3906  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.91 
 
 		 334 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  25.32 
 
 		 330 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  25.08 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  23.32 
 
 		 329 aa  52.8  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  25.27 
 
 		 398 aa  52.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3724  Radical SAM domain protein  27.39 
 
 		 355 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0197  radical SAM family protein  27.78 
 
 		 367 aa  52.4  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2500  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.91 
 
 		 335 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818092  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  24.03 
 
 		 332 aa  52.4  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1400  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.48 
 
 		 323 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  28.18 
 
 		 418 aa  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  24.88 
 
 		 326 aa  52  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.76 
 
 		 330 aa  52.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1203  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.98 
 
 		 308 aa  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.31848  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1794  cofactor modifying protein (cmo)  25.95 
 
 		 311 aa  51.2  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.420776 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1926  radical SAM domain-containing protein  27.46 
 
 		 347 aa  51.6  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.265306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  26.13 
 
 		 405 aa  52  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>