198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1217 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1217  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 343 aa  718    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0163769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2056  Radical SAM domain protein  36.02 
 
 		 340 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3080  Radical SAM domain protein  31.91 
 
 		 351 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2991  Radical SAM domain protein  42.49 
 
 		 397 aa  169  7e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0438  radical SAM domain-containing protein  30.92 
 
 		 390 aa  146  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.777378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  27.42 
 
 		 335 aa  117  3e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1794  cofactor modifying protein (cmo)  28.93 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.420776 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  26.88 
 
 		 332 aa  112  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  29.35 
 
 		 331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  24.14 
 
 		 340 aa  97.1  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  25.56 
 
 		 372 aa  95.5  1e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0173  cofactor modifying protein (cmo)  26.07 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  22.59 
 
 		 339 aa  87.8  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  23.53 
 
 		 340 aa  86.3  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  21.91 
 
 		 341 aa  84  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  23.17 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  23.4 
 
 		 565 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  20.73 
 
 		 384 aa  72.8  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  21.15 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1360  Radical SAM domain protein  25.97 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2924  Radical SAM domain protein  25.41 
 
 		 446 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  27.14 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  24.5 
 
 		 471 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3588  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 		 446 aa  63.2  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  22.44 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3820  Radical SAM domain protein  20.36 
 
 		 515 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  23.21 
 
 		 335 aa  62  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  22.74 
 
 		 379 aa  60.8  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3158  radical SAM domain-containing protein  19.84 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1586  radical SAM family protein  22.89 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  24.59 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  22.83 
 
 		 355 aa  60.1  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  25.68 
 
 		 445 aa  59.7  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  26.23 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3051  Radical SAM domain protein  22.31 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.684834  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0761  radical SAM family protein  28.69 
 
 		 503 aa  57  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.510153  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  22.02 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  29.6 
 
 		 341 aa  57  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  24.64 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  22.34 
 
 		 351 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5597  hypothetical protein  34.23 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5311  hypothetical protein  34.23 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5139  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  34.23 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.219844  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5153  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  34.23 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.120302  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5552  hypothetical protein  34.23 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.05586e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5707  hypothetical protein  34.23 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5580  hypothetical protein  34.23 
 
 		 292 aa  55.8  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488042  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5642  hypothetical protein  34.23 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00436698  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2556  radical SAM family protein  31.58 
 
 		 337 aa  55.8  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1033  radical SAM domain-containing protein  27.66 
 
 		 287 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  23.27 
 
 		 377 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  22.83 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5251  radical SAM domain-containing protein  34.23 
 
 		 292 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0480  Radical SAM domain protein  21.32 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00535769  hitchhiker  0.00252735 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1126  Fe-S oxidoreductase  27.73 
 
 		 347 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04330  Radical SAM domain protein  19.51 
 
 		 336 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  21.69 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0794  radical SAM domain-containing protein  21.36 
 
 		 446 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  22.11 
 
 		 402 aa  54.3  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  20.37 
 
 		 465 aa  54.3  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  24.24 
 
 		 414 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0911  radical SAM domain-containing protein  27.14 
 
 		 287 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.47 
 
 		 399 aa  53.9  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  22.49 
 
 		 396 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  22.52 
 
 		 387 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18370  predicted Fe-S oxidoreductase  25.18 
 
 		 384 aa  53.5  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  23.24 
 
 		 363 aa  53.5  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  20.38 
 
 		 382 aa  53.5  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  23.44 
 
 		 437 aa  53.5  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0369  radical SAM domain-containing protein  28.38 
 
 		 317 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.722387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  20.62 
 
 		 393 aa  52.8  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2552  radical SAM family protein  25.64 
 
 		 340 aa  52.8  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1381  radical SAM domain-containing protein  19.81 
 
 		 345 aa  52.8  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  22.19 
 
 		 366 aa  52.8  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.06 
 
 		 342 aa  52.8  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.06 
 
 		 342 aa  52.8  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  22.75 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1064  radical SAM domain-containing protein  22.39 
 
 		 365 aa  52  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.468822  normal  0.968223 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0368  radical SAM domain-containing protein  27.12 
 
 		 574 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01021  hypothetical protein  21.97 
 
 		 373 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.816192 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  23.4 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2761  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 348 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0874334  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  27.2 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.63 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3724  Radical SAM domain protein  22.52 
 
 		 355 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1770  radical SAM domain-containing protein  27.66 
 
 		 287 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.201175  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  20.96 
 
 		 364 aa  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2641  Radical SAM domain protein  24.42 
 
 		 358 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.587199  normal  0.0478342 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0195  radical SAM family protein  19.94 
 
 		 342 aa  50.8  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  23.67 
 
 		 401 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5367  hypothetical protein  34.29 
 
 		 279 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0445867  hitchhiker  0.0000016486 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  23.67 
 
 		 401 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  23.67 
 
 		 401 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17970  predicted Fe-S oxidoreductase  26.39 
 
 		 356 aa  50.8  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1943  Radical SAM domain protein  30.1 
 
 		 315 aa  50.8  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.227047  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  22.99 
 
 		 410 aa  50.8  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  25.89 
 
 		 392 aa  50.4  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  23.85 
 
 		 471 aa  50.4  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  21.15 
 
 		 413 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  21.56 
 
 		 422 aa  50.4  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>