250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1126 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1126  Fe-S oxidoreductase  100 
 
 
347 aa  725    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1124  Fe-S oxidoreductases  26.75 
 
 
338 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3345  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 
338 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2552  radical SAM family protein  26.5 
 
 
340 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2556  radical SAM family protein  25.93 
 
 
337 aa  99.4  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  25.52 
 
 
341 aa  95.9  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  28.91 
 
 
359 aa  95.5  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2551  radical SAM family protein  26.42 
 
 
344 aa  90.1  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1849  Radical SAM domain protein  26.21 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4172  Radical SAM domain protein  24.92 
 
 
338 aa  82  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4173  Radical SAM domain protein  25.79 
 
 
344 aa  82  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  25.25 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0419  Fe-S oxidoreductase-like protein  24.81 
 
 
284 aa  79.3  0.00000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.399377  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4175  Radical SAM domain protein  23.23 
 
 
342 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0506  radical SAM domain-containing protein  22.19 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  29.83 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  21.74 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
372 aa  70.5  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  27.23 
 
 
351 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  32.59 
 
 
437 aa  69.3  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3252  Elongator protein 3/MiaB/NifB  22.73 
 
 
313 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  21.9 
 
 
339 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2754  radical SAM domain-containing protein  24.39 
 
 
332 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  32.21 
 
 
450 aa  66.2  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3588  radical SAM domain-containing protein  33.73 
 
 
446 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.57 
 
 
332 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3724  Radical SAM domain protein  23.36 
 
 
355 aa  65.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  30.32 
 
 
355 aa  65.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  32.82 
 
 
421 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14401  hypothetical protein  26.73 
 
 
311 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.32313  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  27.14 
 
 
873 aa  63.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  21.75 
 
 
340 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  28.79 
 
 
471 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0776  Fe-S oxidoreductase-like  21.97 
 
 
338 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  33.06 
 
 
434 aa  62  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.67 
 
 
296 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2559  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.67 
 
 
342 aa  59.7  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2189  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.67 
 
 
342 aa  59.7  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28518  hitchhiker  0.000000328904 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2804  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.14 
 
 
341 aa  58.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.933845  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2884  Fe-S oxidoreductase  28.4 
 
 
447 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154845  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2248  radical SAM domain-containing protein  26.63 
 
 
332 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000187282  normal  0.0755271 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2787  radical SAM domain-containing protein  22.94 
 
 
307 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  21.45 
 
 
474 aa  57  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  26.82 
 
 
465 aa  56.6  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.39 
 
 
330 aa  56.2  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00116324  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0240  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.47 
 
 
330 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4391  Radical SAM domain protein  35.25 
 
 
327 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1601  heme biosynthesis protein, putative  22.15 
 
 
354 aa  55.5  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196015  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2366  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.13 
 
 
332 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0761  radical SAM family protein  26.03 
 
 
503 aa  55.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.510153  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1217  Radical SAM domain protein  27.73 
 
 
343 aa  54.7  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0163769  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0433  radical SAM domain-containing protein  31.54 
 
 
433 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0734  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.89 
 
 
333 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.66 
 
 
298 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.370128  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  29.09 
 
 
451 aa  54.3  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1392  Radical SAM domain protein  26.53 
 
 
377 aa  53.9  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.358724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 
445 aa  53.9  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2766  radical SAM family Fe-S protein  26.14 
 
 
340 aa  53.9  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4990  radical SAM family protein  26.04 
 
 
386 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.396764  normal  0.819586 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  28.19 
 
 
330 aa  53.5  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2126  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.77 
 
 
336 aa  53.5  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.307772 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.25 
 
 
299 aa  53.5  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1036  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.66 
 
 
298 aa  53.5  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643895  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  32.09 
 
 
345 aa  53.1  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0416  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.87 
 
 
341 aa  53.1  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.315113  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6508  Radical SAM domain protein  21.11 
 
 
366 aa  52.8  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.969716  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1609  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.58 
 
 
317 aa  52.8  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1445  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.87 
 
 
297 aa  52.8  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1465  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.41 
 
 
292 aa  52.8  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1734  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.63 
 
 
329 aa  52.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 
409 aa  52.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1360  Radical SAM domain protein  32.06 
 
 
445 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1943  Radical SAM domain protein  28.31 
 
 
315 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.227047  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  20.9 
 
 
341 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1555  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.64 
 
 
348 aa  52  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0700995  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  24.39 
 
 
449 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  31.75 
 
 
445 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0710  Radical SAM domain protein  27.81 
 
 
388 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  21.14 
 
 
340 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2991  Radical SAM domain protein  29.73 
 
 
397 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2557  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.62 
 
 
330 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0683  Radical SAM domain protein  27.81 
 
 
388 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1582  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.56 
 
 
349 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.519622  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.54 
 
 
334 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.155054 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1605  hypothetical protein  22 
 
 
305 aa  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0804  hypothetical protein  21.4 
 
 
342 aa  50.8  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.8 
 
 
332 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.708354  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2190  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.92 
 
 
318 aa  51.2  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1760  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.66 
 
 
323 aa  50.8  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.7115  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  26.35 
 
 
384 aa  51.2  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0597  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.83 
 
 
348 aa  51.2  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  26.95 
 
 
396 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0726  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.08 
 
 
324 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00130382 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34160  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  25.69 
 
 
339 aa  50.4  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.142269  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2045  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.66 
 
 
323 aa  50.4  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 
380 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0169  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.18 
 
 
375 aa  50.1  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280654  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2924  Radical SAM domain protein  31.3 
 
 
446 aa  50.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0658  radical SAM domain-containing protein  25.12 
 
 
336 aa  50.4  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0197  radical SAM family protein  24.43 
 
 
367 aa  50.1  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>