More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1033 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1033  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 287 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1770  radical SAM domain-containing protein  93.73 
 
 		 287 aa  546  1e-154  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.201175  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0911  radical SAM domain-containing protein  92.33 
 
 		 287 aa  540  1e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0943  radical SAM domain-containing protein  79.44 
 
 		 287 aa  471  1e-132  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0512  radical SAM domain-containing protein  65.52 
 
 		 491 aa  349  3e-95  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.158097  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0301  radical SAM family Fe-S protein  27.27 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.239452  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3389  hypothetical protein  27.36 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000102267  normal  0.0705776 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  25.27 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2248  radical SAM domain-containing protein  29.23 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000187282  normal  0.0755271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2110  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.59 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  30.99 
 
 		 395 aa  65.9  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  24.29 
 
 		 335 aa  65.5  0.0000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  33.07 
 
 		 399 aa  64.3  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  30.29 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  25.63 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  28.9 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 		 351 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1665  Radical SAM domain protein  28.65 
 
 		 438 aa  62.8  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  25.22 
 
 		 332 aa  62.4  0.000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  31.78 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  27.59 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  25.49 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  28.92 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4316  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  27.49 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.904735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  25.57 
 
 		 480 aa  60.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  27.43 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  32.84 
 
 		 397 aa  60.5  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0804  hypothetical protein  28.28 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.58 
 
 		 394 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  32.54 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1759  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.64 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.103881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4182  Radical SAM domain protein  23.55 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  23.67 
 
 		 325 aa  59.3  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  31.73 
 
 		 399 aa  58.9  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  27.75 
 
 		 396 aa  58.9  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  32.17 
 
 		 378 aa  58.5  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  33.59 
 
 		 394 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2270  radical SAM domain-containing protein  23.94 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.158683 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  28.79 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  28.66 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0597  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.66 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0458  radical SAM domain-containing protein  24.87 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  30.95 
 
 		 491 aa  57.4  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1926  radical SAM domain-containing protein  25.13 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.265306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  27.23 
 
 		 471 aa  57  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  27.84 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1609  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.09 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  27.78 
 
 		 445 aa  57  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1226  Radical SAM domain protein  29.3 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  26.47 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  25.23 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  26.47 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.36 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1559  Radical SAM domain protein  27.31 
 
 		 327 aa  55.8  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  28.03 
 
 		 384 aa  55.8  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  25.64 
 
 		 379 aa  55.8  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1217  Radical SAM domain protein  27.66 
 
 		 343 aa  55.5  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0163769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  26.01 
 
 		 382 aa  55.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  29.57 
 
 		 391 aa  55.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  26.42 
 
 		 339 aa  55.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0739  radical SAM domain-containing protein  27.13 
 
 		 347 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1930  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.38 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  27.22 
 
 		 873 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  26.09 
 
 		 414 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1586  radical SAM family protein  25.68 
 
 		 356 aa  54.3  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  23.04 
 
 		 331 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.72 
 
 		 308 aa  53.9  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3252  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.66 
 
 		 313 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  31.9 
 
 		 330 aa  54.3  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  25.47 
 
 		 359 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  26.01 
 
 		 462 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0658  radical SAM domain-containing protein  24.62 
 
 		 336 aa  53.5  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  25.14 
 
 		 358 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 468 aa  53.5  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  25.14 
 
 		 358 aa  53.5  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3318  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25 
 
 		 333 aa  53.5  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1371  radical SAM domain-containing protein  29.73 
 
 		 457 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000145601 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  26.52 
 
 		 399 aa  53.5  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  28.91 
 
 		 394 aa  53.5  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  29.63 
 
 		 317 aa  53.5  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  23.39 
 
 		 399 aa  53.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0506  radical SAM domain-containing protein  27.36 
 
 		 319 aa  53.1  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0408  tRNA-modifying enzyme  26.2 
 
 		 299 aa  53.1  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  25.24 
 
 		 393 aa  52.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0102  radical SAM domain-containing protein  25.47 
 
 		 482 aa  52.8  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  24.71 
 
 		 422 aa  52.8  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 		 334 aa  52.8  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  30.53 
 
 		 330 aa  52.8  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  21.88 
 
 		 474 aa  52.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  28.91 
 
 		 496 aa  52.8  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  31.01 
 
 		 379 aa  52.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  27.97 
 
 		 366 aa  52.4  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0103  radical SAM domain-containing protein  24.53 
 
 		 482 aa  52  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.46 
 
 		 399 aa  52  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  24.04 
 
 		 501 aa  51.6  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3820  Radical SAM domain protein  31.54 
 
 		 515 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  24.38 
 
 		 390 aa  51.6  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  25.76 
 
 		 363 aa  52  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>